FuNGI

A0A0D2DX94

Protein Details

Accession

A0A0D2DX94

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-37	STSGPRPKPRAGIQRKSKAEREAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-74	GPRPKPRAGIQRKSKAEREAFAREEAERQKARLAEAERNAAAAARGGRGGRAGRGGRG
203-251	RRKGKQKAESKPERSNFELRPILPRKDPDPDAKKKREAEKKSRGSARKK
287-300	RRRGLKKPGGRARE

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDPKASTSKPSASTSGPRPKPRAGIQRKSKAEREAFAREEAERQKARLAEAERNAAAAARGGRGGRAGRGGRGGASTADHGRDHPVGGNSVFGASTGLRPQTNRHNEPEGYSERLEGQSTIKPDESGVQGTEEGTSSRGGGGGGGGGLGGGRGATKEQQYYETISDDEPPENRRPIEDIATITLSSDEDGSDADDEEPLDSRRKGKQKAESKPERSNFELRPILPRKDPDPDAKKKREAEKKSRGSARKKLESDIQEADADDTAGDAMDIDEPVLVKEQPSSPEMRRRGLKKPGGRAREAKFANETIEERAERLRMMGDVQRLRRVFKQVGVKSESPAVGVAGREDSKQTDQSDDTGNEDKSDPKGELFLFQLPPLTPFLVDSAGIETEPEVKKEPGATDGPATTSNNPPPDDGDQAKKEANDDDVVPSPRPKLQIPGTLTATEPTRLPAGLVGKLRLHKSGKVSLDWGGADMEVRYGTKVDFLQDVVMVERRHKNKPEVGETDGSGVGDGGVDGLGEKQETDGGLDGTAYTLGHVRQKMVCIPDWTRLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.54
3	0.58
4	0.61
5	0.64
6	0.66
7	0.69
8	0.72
9	0.74
10	0.75
11	0.75
12	0.77
13	0.79
14	0.83
15	0.87
16	0.86
17	0.83
18	0.81
19	0.76
20	0.71
21	0.67
22	0.65
23	0.58
24	0.54
25	0.5
26	0.41
27	0.43
28	0.42
29	0.44
30	0.38
31	0.37
32	0.38
33	0.38
34	0.39
35	0.38
36	0.39
37	0.39
38	0.41
39	0.45
40	0.4
41	0.39
42	0.37
43	0.3
44	0.25
45	0.19
46	0.16
47	0.11
48	0.14
49	0.13
50	0.14
51	0.17
52	0.19
53	0.18
54	0.24
55	0.24
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.24
60	0.24
61	0.23
62	0.16
63	0.16
64	0.17
65	0.16
66	0.18
67	0.18
68	0.18
69	0.21
70	0.21
71	0.21
72	0.21
73	0.21
74	0.21
75	0.2
76	0.2
77	0.16
78	0.15
79	0.14
80	0.1
81	0.1
82	0.07
83	0.09
84	0.12
85	0.14
86	0.15
87	0.17
88	0.21
89	0.31
90	0.4
91	0.43
92	0.46
93	0.5
94	0.49
95	0.51
96	0.53
97	0.46
98	0.4
99	0.36
100	0.31
101	0.27
102	0.27
103	0.25
104	0.19
105	0.18
106	0.18
107	0.2
108	0.22
109	0.2
110	0.19
111	0.19
112	0.21
113	0.2
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.04
132	0.04
133	0.03
134	0.03
135	0.03
136	0.02
137	0.02
138	0.02
139	0.02
140	0.03
141	0.04
142	0.07
143	0.1
144	0.12
145	0.13
146	0.16
147	0.18
148	0.21
149	0.21
150	0.19
151	0.18
152	0.16
153	0.18
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.19
158	0.22
159	0.24
160	0.24
161	0.23
162	0.25
163	0.26
164	0.28
165	0.25
166	0.22
167	0.21
168	0.21
169	0.2
170	0.17
171	0.14
172	0.1
173	0.08
174	0.07
175	0.05
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.11
188	0.12
189	0.15
190	0.23
191	0.31
192	0.38
193	0.45
194	0.53
195	0.6
196	0.68
197	0.76
198	0.78
199	0.77
200	0.79
201	0.76
202	0.71
203	0.65
204	0.62
205	0.53
206	0.5
207	0.46
208	0.38
209	0.43
210	0.43
211	0.42
212	0.38
213	0.39
214	0.34
215	0.36
216	0.39
217	0.39
218	0.43
219	0.5
220	0.56
221	0.6
222	0.64
223	0.64
224	0.71
225	0.71
226	0.72
227	0.72
228	0.74
229	0.75
230	0.76
231	0.79
232	0.77
233	0.75
234	0.75
235	0.73
236	0.71
237	0.64
238	0.59
239	0.58
240	0.52
241	0.49
242	0.42
243	0.34
244	0.26
245	0.24
246	0.22
247	0.15
248	0.12
249	0.07
250	0.05
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.02
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.04
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.06
266	0.07
267	0.09
268	0.1
269	0.14
270	0.16
271	0.25
272	0.28
273	0.31
274	0.35
275	0.38
276	0.44
277	0.5
278	0.55
279	0.52
280	0.6
281	0.63
282	0.62
283	0.62
284	0.62
285	0.55
286	0.57
287	0.51
288	0.42
289	0.36
290	0.33
291	0.3
292	0.24
293	0.22
294	0.15
295	0.17
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.13
300	0.11
301	0.11
302	0.09
303	0.07
304	0.09
305	0.12
306	0.17
307	0.21
308	0.23
309	0.29
310	0.29
311	0.31
312	0.32
313	0.35
314	0.31
315	0.31
316	0.4
317	0.37
318	0.42
319	0.45
320	0.42
321	0.37
322	0.38
323	0.33
324	0.23
325	0.2
326	0.15
327	0.1
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.12
335	0.13
336	0.17
337	0.17
338	0.18
339	0.18
340	0.19
341	0.23
342	0.21
343	0.22
344	0.22
345	0.22
346	0.2
347	0.2
348	0.2
349	0.18
350	0.19
351	0.16
352	0.12
353	0.15
354	0.14
355	0.15
356	0.15
357	0.17
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.15
362	0.16
363	0.16
364	0.14
365	0.1
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.13
377	0.13
378	0.14
379	0.16
380	0.16
381	0.17
382	0.19
383	0.19
384	0.17
385	0.18
386	0.18
387	0.17
388	0.17
389	0.18
390	0.18
391	0.19
392	0.18
393	0.21
394	0.25
395	0.27
396	0.28
397	0.27
398	0.28
399	0.29
400	0.32
401	0.3
402	0.32
403	0.3
404	0.32
405	0.34
406	0.3
407	0.29
408	0.25
409	0.24
410	0.18
411	0.17
412	0.18
413	0.21
414	0.23
415	0.23
416	0.24
417	0.23
418	0.25
419	0.27
420	0.25
421	0.27
422	0.31
423	0.37
424	0.4
425	0.43
426	0.43
427	0.41
428	0.4
429	0.35
430	0.31
431	0.23
432	0.19
433	0.15
434	0.13
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.15
439	0.19
440	0.21
441	0.23
442	0.25
443	0.3
444	0.32
445	0.35
446	0.35
447	0.34
448	0.38
449	0.43
450	0.43
451	0.41
452	0.41
453	0.37
454	0.36
455	0.32
456	0.27
457	0.19
458	0.15
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.11
468	0.12
469	0.13
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.15
474	0.15
475	0.14
476	0.18
477	0.17
478	0.22
479	0.3
480	0.34
481	0.41
482	0.47
483	0.53
484	0.55
485	0.63
486	0.66
487	0.62
488	0.63
489	0.58
490	0.52
491	0.47
492	0.4
493	0.31
494	0.22
495	0.17
496	0.11
497	0.08
498	0.07
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.08
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.07
519	0.06
520	0.08
521	0.11
522	0.17
523	0.19
524	0.22
525	0.24
526	0.28
527	0.33
528	0.36
529	0.38
530	0.39
531	0.41
532	0.46

A0A0D2DX94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer