Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q09738

Protein Details
Accession Q09738    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-55SCHFVPRRCSTCKRINKRSIRCLSCHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR001607  Znf_UBP  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0004197  F:cysteine-type endopeptidase activity  
GO:0140492  F:metal-dependent deubiquitinase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016578  P:histone deubiquitination  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045815  P:transcription initiation-coupled chromatin remodeling  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG spo:SPAC13A11.04c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PF02148  zf-UBP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
PS50271  ZF_UBP  
CDD cd02660  Peptidase_C19D  
Amino Acid Sequences MPGDVEGCQHLKLKPADVENYQKICTQIFSCHFVPRRCSTCKRINKRSIRCLSCHSVGCLWGHHGEEHAMEHTHMIGVDVKNGHTYCFGCQDYVYQTELETLRFKIKNIKAWQSDHKRLPEKYNQMVCLEAYRKYPPVCATAGLRGIQNLGATCFMSVILQSILHNPLVRNLFFSGFHTSTDCKRPTCMTCAIDDMFSSIYNSKNKSTFYGPTAVLNLMWKLSKSLCGYSQQDGHEFFVYLLDQMHTESGGGTSMPCTCPIHRIFSGSLKNVVTCLDCKKERVAVDPLMDISLDINEPTLQGCLERFVSKEKVQYSCHSCGSKNAIKQLVFDKLPPTICMQLKRFEQNNFAMSTKIDKQVSYPAFLRMRYNFNQDDVDYQLYSVVCHKGTLDTGHYIAYTYYQNQWFLLDDTTIVEVKESEVLNSQAYLLFYHERQILYSDEMTVKTEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.43
4 0.45
5 0.53
6 0.54
7 0.55
8 0.5
9 0.47
10 0.43
11 0.38
12 0.36
13 0.29
14 0.28
15 0.29
16 0.34
17 0.34
18 0.41
19 0.48
20 0.49
21 0.54
22 0.53
23 0.56
24 0.59
25 0.64
26 0.65
27 0.68
28 0.74
29 0.78
30 0.81
31 0.85
32 0.87
33 0.9
34 0.92
35 0.92
36 0.86
37 0.8
38 0.77
39 0.73
40 0.68
41 0.6
42 0.53
43 0.44
44 0.41
45 0.38
46 0.31
47 0.27
48 0.23
49 0.22
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.13
64 0.12
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.24
75 0.24
76 0.2
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.22
82 0.16
83 0.15
84 0.19
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.17
89 0.23
90 0.24
91 0.25
92 0.31
93 0.35
94 0.42
95 0.47
96 0.55
97 0.53
98 0.57
99 0.67
100 0.66
101 0.7
102 0.68
103 0.7
104 0.68
105 0.66
106 0.68
107 0.67
108 0.65
109 0.65
110 0.64
111 0.58
112 0.51
113 0.48
114 0.41
115 0.37
116 0.31
117 0.24
118 0.21
119 0.22
120 0.25
121 0.25
122 0.28
123 0.24
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.22
131 0.2
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.13
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.15
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.19
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.19
167 0.21
168 0.28
169 0.29
170 0.23
171 0.24
172 0.28
173 0.29
174 0.32
175 0.35
176 0.29
177 0.27
178 0.3
179 0.28
180 0.24
181 0.21
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.11
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.25
198 0.23
199 0.21
200 0.22
201 0.19
202 0.16
203 0.14
204 0.11
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.26
218 0.23
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.18
223 0.16
224 0.14
225 0.1
226 0.1
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.1
245 0.1
246 0.16
247 0.18
248 0.23
249 0.22
250 0.25
251 0.25
252 0.3
253 0.34
254 0.29
255 0.31
256 0.25
257 0.25
258 0.22
259 0.21
260 0.16
261 0.13
262 0.16
263 0.19
264 0.2
265 0.21
266 0.23
267 0.27
268 0.27
269 0.3
270 0.31
271 0.28
272 0.28
273 0.27
274 0.25
275 0.2
276 0.19
277 0.14
278 0.09
279 0.07
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.15
295 0.2
296 0.22
297 0.27
298 0.29
299 0.32
300 0.35
301 0.4
302 0.43
303 0.42
304 0.45
305 0.42
306 0.38
307 0.39
308 0.44
309 0.43
310 0.39
311 0.41
312 0.41
313 0.39
314 0.41
315 0.4
316 0.38
317 0.33
318 0.32
319 0.27
320 0.25
321 0.26
322 0.25
323 0.24
324 0.25
325 0.28
326 0.33
327 0.34
328 0.37
329 0.4
330 0.47
331 0.49
332 0.45
333 0.47
334 0.45
335 0.45
336 0.4
337 0.36
338 0.29
339 0.25
340 0.27
341 0.26
342 0.28
343 0.26
344 0.23
345 0.25
346 0.34
347 0.35
348 0.33
349 0.31
350 0.32
351 0.34
352 0.35
353 0.39
354 0.33
355 0.39
356 0.38
357 0.45
358 0.39
359 0.38
360 0.39
361 0.35
362 0.33
363 0.3
364 0.29
365 0.21
366 0.19
367 0.19
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.14
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.17
377 0.19
378 0.2
379 0.19
380 0.2
381 0.2
382 0.19
383 0.18
384 0.16
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.2
389 0.23
390 0.24
391 0.23
392 0.24
393 0.24
394 0.23
395 0.22
396 0.15
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.15
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.11
405 0.15
406 0.13
407 0.13
408 0.15
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.14
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.17
418 0.16
419 0.21
420 0.24
421 0.22
422 0.22
423 0.24
424 0.23
425 0.24
426 0.25
427 0.23
428 0.22
429 0.23