Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2BHU1

Protein Details
Accession A0A0D2BHU1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-102ADAAATQKKKRKQPNDGEAGQKHydrophilic
207-228QEAPAKTSKKDQKKIIKRTQKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-95KKKRKQPN
102-104KSK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MAADERSDEGLQTGFPRSPSSFDADPRVSFSRLDNKFILETDEGSEFEWDSALKRWIPVLDQSLLEQQGEIYKVEGVDENADAAATQKKKRKQPNDGEAGQKSKRPRVNTAVYVTSIPLDADQEEIQHVFSKCGVIAEEIDSGKPRIKMYEDDKGQFKGDALVVYFRPESVDLAIQMLDDSDFRLGSEGPAGKMKVQAADFSYKSQQEAPAKTSKKDQKKIIKRTQKMMGKLTDWDDDDPQAIPDTSSRWDKVVILKHMFTLEELEEDPAAMLEIKEDIREECSKLGEVTNVVLFDKEPAGIASVRFSNAEAAAACVRLMNGRWFDERQLEAFVSTGNEKFKKSSDRAVEDDDEEDQEGGRLDKFGSWLEQEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.2
4 0.21
5 0.24
6 0.26
7 0.3
8 0.31
9 0.32
10 0.39
11 0.38
12 0.38
13 0.39
14 0.4
15 0.35
16 0.32
17 0.34
18 0.36
19 0.36
20 0.4
21 0.36
22 0.35
23 0.35
24 0.35
25 0.34
26 0.25
27 0.23
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.09
37 0.09
38 0.13
39 0.16
40 0.16
41 0.16
42 0.18
43 0.19
44 0.21
45 0.24
46 0.25
47 0.24
48 0.24
49 0.25
50 0.27
51 0.26
52 0.24
53 0.19
54 0.14
55 0.15
56 0.16
57 0.14
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.08
71 0.13
72 0.16
73 0.22
74 0.3
75 0.38
76 0.47
77 0.58
78 0.67
79 0.72
80 0.78
81 0.82
82 0.84
83 0.8
84 0.78
85 0.72
86 0.67
87 0.58
88 0.51
89 0.46
90 0.45
91 0.46
92 0.44
93 0.47
94 0.49
95 0.55
96 0.57
97 0.56
98 0.5
99 0.46
100 0.42
101 0.35
102 0.27
103 0.19
104 0.13
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.13
115 0.13
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.16
135 0.21
136 0.25
137 0.33
138 0.33
139 0.35
140 0.36
141 0.36
142 0.34
143 0.28
144 0.24
145 0.16
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.2
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.21
194 0.23
195 0.25
196 0.26
197 0.32
198 0.34
199 0.34
200 0.41
201 0.45
202 0.5
203 0.55
204 0.6
205 0.63
206 0.71
207 0.81
208 0.83
209 0.84
210 0.79
211 0.78
212 0.78
213 0.73
214 0.67
215 0.62
216 0.55
217 0.45
218 0.43
219 0.39
220 0.33
221 0.28
222 0.25
223 0.2
224 0.17
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.18
239 0.23
240 0.29
241 0.32
242 0.32
243 0.32
244 0.32
245 0.32
246 0.3
247 0.24
248 0.19
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.13
307 0.16
308 0.19
309 0.22
310 0.26
311 0.28
312 0.3
313 0.34
314 0.34
315 0.29
316 0.29
317 0.26
318 0.22
319 0.21
320 0.18
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.21
325 0.23
326 0.24
327 0.26
328 0.32
329 0.39
330 0.41
331 0.48
332 0.5
333 0.54
334 0.57
335 0.61
336 0.58
337 0.5
338 0.47
339 0.39
340 0.31
341 0.26
342 0.22
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.18