Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39750

Protein Details
Accession P39750    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-380PSSPKKPVDTKSKGSAKRKRDSNKGGESKKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-380PKKPVDTKSKGSAKRKRDSNKGGESKKKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto 9, mito_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR023426  Flap_endonuc  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0008409  F:5'-3' exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0051908  F:double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:0045145  F:single-stranded DNA 5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG spo:SPAC3G6.06c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09907  H3TH_FEN1-Euk  
cd09867  PIN_FEN1  
Amino Acid Sequences MGIKGLAQVLSEHAPASVKHNDIKNYFGRKVAIDASMSLYQFLIQVRSQDGQQLMNEQGETTSHLMGMFYRTLRIVDNGIKPCFVFDGKPPTLKSGELAKRVARHQKAREDQEETKEVGTAEMVDRFAKRTVKVTRQHNDEAKRLLELMGIPFVNAPCEAEAQCAALARSGKVYAAASEDMDTLCFQAPVLLRHLTFSEQRKEPISEYNIEKALNGLDMSVEQFVDLCILLGCDYCEPIRGVGPARAVELIRQYGTLDRFVKEADRSKYPIPEDWPYEDARRLFLDAEVLPGEEIELKWKSPDADGIIQFLVKEKGFNEDRVKLGINRLEKASKTIPQGRLDSFFKPVPSSPKKPVDTKSKGSAKRKRDSNKGGESKKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.2
4 0.22
5 0.23
6 0.28
7 0.34
8 0.4
9 0.4
10 0.46
11 0.49
12 0.51
13 0.5
14 0.47
15 0.44
16 0.38
17 0.41
18 0.38
19 0.31
20 0.24
21 0.23
22 0.25
23 0.26
24 0.25
25 0.21
26 0.18
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.15
31 0.12
32 0.14
33 0.17
34 0.19
35 0.19
36 0.22
37 0.22
38 0.22
39 0.21
40 0.23
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.16
45 0.15
46 0.13
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.21
64 0.28
65 0.33
66 0.33
67 0.33
68 0.31
69 0.3
70 0.29
71 0.23
72 0.17
73 0.17
74 0.26
75 0.28
76 0.33
77 0.33
78 0.34
79 0.35
80 0.33
81 0.3
82 0.3
83 0.34
84 0.34
85 0.36
86 0.36
87 0.39
88 0.45
89 0.52
90 0.5
91 0.52
92 0.55
93 0.62
94 0.68
95 0.71
96 0.7
97 0.67
98 0.64
99 0.61
100 0.56
101 0.47
102 0.39
103 0.32
104 0.27
105 0.2
106 0.16
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.24
118 0.31
119 0.38
120 0.46
121 0.53
122 0.57
123 0.6
124 0.66
125 0.65
126 0.63
127 0.58
128 0.53
129 0.44
130 0.37
131 0.31
132 0.25
133 0.19
134 0.14
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.17
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.25
188 0.27
189 0.28
190 0.27
191 0.28
192 0.26
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.26
197 0.24
198 0.23
199 0.17
200 0.14
201 0.11
202 0.08
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.2
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.21
249 0.22
250 0.28
251 0.27
252 0.29
253 0.33
254 0.35
255 0.4
256 0.39
257 0.39
258 0.36
259 0.37
260 0.36
261 0.37
262 0.36
263 0.33
264 0.34
265 0.34
266 0.29
267 0.26
268 0.23
269 0.21
270 0.19
271 0.17
272 0.18
273 0.13
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.19
290 0.19
291 0.24
292 0.25
293 0.26
294 0.25
295 0.24
296 0.23
297 0.21
298 0.19
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.19
303 0.22
304 0.28
305 0.32
306 0.34
307 0.35
308 0.37
309 0.39
310 0.33
311 0.37
312 0.37
313 0.34
314 0.33
315 0.35
316 0.37
317 0.35
318 0.39
319 0.38
320 0.37
321 0.42
322 0.48
323 0.5
324 0.51
325 0.55
326 0.52
327 0.53
328 0.51
329 0.45
330 0.41
331 0.38
332 0.34
333 0.33
334 0.34
335 0.38
336 0.44
337 0.49
338 0.53
339 0.6
340 0.64
341 0.68
342 0.72
343 0.73
344 0.72
345 0.72
346 0.73
347 0.73
348 0.77
349 0.81
350 0.82
351 0.81
352 0.82
353 0.85
354 0.84
355 0.85
356 0.86
357 0.86
358 0.87
359 0.88
360 0.88