Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YJC2

Protein Details
Accession A0A0D1YJC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42ADDTPLRKKARKTQHPTKLRASLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-34RKKARKTQHP
119-126EKKSKKEK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito_nucl 11, mito 9.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000915  60S_ribosomal_L6E  
IPR005824  KOW  
IPR041997  KOW_RPL6  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01159  Ribosomal_L6e  
CDD cd13156  KOW_RPL6  
Amino Acid Sequences MSSTQANPAVQKAARWYPADDTPLRKKARKTQHPTKLRASLKPGAVVIVLAGRFRGKRAVVLGHSKDAVIVTGPFKINGVPIRRVNARYVIGTSTTVDISKLDKSVLEKVTKPEYFAREKKSKKEKGEDAFIKQGEKPEVGIKKQPTSERASDQKAIDKPLLSAIKNEEFLASYLRSSFSLRHGQRPHEMVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.37
4 0.35
5 0.39
6 0.43
7 0.4
8 0.41
9 0.45
10 0.51
11 0.55
12 0.56
13 0.58
14 0.63
15 0.7
16 0.74
17 0.75
18 0.77
19 0.82
20 0.86
21 0.85
22 0.83
23 0.81
24 0.75
25 0.71
26 0.67
27 0.62
28 0.55
29 0.51
30 0.43
31 0.33
32 0.28
33 0.23
34 0.16
35 0.12
36 0.1
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.11
42 0.15
43 0.13
44 0.15
45 0.18
46 0.22
47 0.24
48 0.32
49 0.33
50 0.3
51 0.3
52 0.28
53 0.25
54 0.2
55 0.16
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.15
66 0.18
67 0.21
68 0.22
69 0.26
70 0.28
71 0.3
72 0.29
73 0.28
74 0.25
75 0.21
76 0.21
77 0.18
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.15
93 0.18
94 0.19
95 0.2
96 0.23
97 0.3
98 0.29
99 0.3
100 0.29
101 0.3
102 0.36
103 0.39
104 0.44
105 0.46
106 0.5
107 0.57
108 0.64
109 0.67
110 0.67
111 0.71
112 0.72
113 0.68
114 0.74
115 0.68
116 0.62
117 0.6
118 0.53
119 0.45
120 0.38
121 0.36
122 0.28
123 0.25
124 0.21
125 0.23
126 0.27
127 0.28
128 0.34
129 0.33
130 0.36
131 0.41
132 0.44
133 0.41
134 0.43
135 0.45
136 0.45
137 0.48
138 0.49
139 0.48
140 0.46
141 0.49
142 0.45
143 0.44
144 0.39
145 0.33
146 0.29
147 0.32
148 0.35
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.31
153 0.32
154 0.31
155 0.24
156 0.21
157 0.21
158 0.22
159 0.17
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.2
167 0.3
168 0.32
169 0.41
170 0.46
171 0.5
172 0.56