Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Y4A9

Protein Details
Accession A0A0D1Y4A9    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26ALKPPPPKPRAGQHRRAIPRGRIEBasic
195-215CLYLACRRKHEQIQNERRPMYHydrophilic
376-407DPPAYQRAHNPKPPKKKRGRPRKHPLPPATPEBasic
641-662KEKLAKGRRKDGTKKPGRRGDVBasic
774-799SKTSLAAERRERKKREQSSSQVRELRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24KPPPPKPRAGQHRRAIPRGR
384-400HNPKPPKKKRGRPRKHP
628-659LRARGLDPAKEALKEKLAKGRRKDGTKKPGRR
768-788RAGRDRSKTSLAAERRERKKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPALKPPPPKPRAGQHRRAIPRGRIEGLGSPAPVSIRATTPSFRRASTPSIQRPAGGKVLKCTNPSCPNPHIVESEQGLICDTCGAVALAESGLVSEQGFGETDSGAITALGVRVNENQTHQRTYAPGGALGNAGREPTINRERSEQQARTIMQSFQTLLGVRQAEVDAGLQLFKLAWGYSFVQGRTIDSVAVVCLYLACRRKHEQIQNERRPMYSLMLIDFAEKINIDVFYLGKMYSDLVRKLYLQTDGTIKGDVSSDLLAMGPEVLVSRFVDELEFDKSHRDKIKMDAIRIVQRMKRDWMSTGRRPSGVCGAAVILAARMNNYRRTTREVVLTAKVTEITINKRLEEFQDTASSKLSVSQFRDNTVLDAQVASDPPAYQRAHNPKPPKKKRGRPRKHPLPPATPEPETGVSVEAETGDGEPPSKRARVDADGYKIPDIPQRPTPIDPALTGTDASALHADPSSEEATSQSSEIPRRKRTFVVPPPSEAELAIESEIEQDIQTAFQENPELDPNRSQNNDTQPSGPSRQPATILPDDDGDPLNPLGPHRKDKTPGPRVDSNAGNTGCVSLSPTIRAEEFDGDEDVSMCLLSEEESKIKETIWLHMNADWIRKNHYKVIKQELKDRELRARGLDPAKEALKEKLAKGRRKDGTKKPGRRGDVSYLDEQAKGEPGGGDRDKRDAAESVRKMFTTRGVYSRRVNYDVLDSIYGIPEGGDADSDSRSASRSQSVASDMPQDAREGSIASVASVAARASLGPEGIFRGNSGRAGRDRSKTSLAAERRERKKREQSSSQVRELREGSTASDRRSRSIRSPSGTPGVEIRETVKRKRETSGPSPEPGSATVVDEQSNAESGLSKPQDQGGPLSPPATQHQGPPPIRISGAIPTVASSSQGPQQQRTPPATQSEGTPPSHMTTSGGIPTVTSSSEIPSVASTQSQALPPSIRVTSDIPVVRPSSKSKQQPQATSAASPTTQAQTETDTKAAIVKASSSSSDRDTDKADDQDGNEDEDDDDDEDEEEEEEEEDDDDEDEDDDDDEDEQDGDEDDYVRELDDGDIDAAFEGRFGDDEDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.76
3 0.82
4 0.84
5 0.86
6 0.84
7 0.81
8 0.8
9 0.76
10 0.7
11 0.61
12 0.56
13 0.51
14 0.48
15 0.42
16 0.33
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.21
21 0.19
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.22
26 0.26
27 0.3
28 0.37
29 0.37
30 0.36
31 0.38
32 0.39
33 0.42
34 0.47
35 0.53
36 0.54
37 0.59
38 0.59
39 0.57
40 0.55
41 0.53
42 0.53
43 0.47
44 0.4
45 0.39
46 0.47
47 0.49
48 0.5
49 0.48
50 0.5
51 0.54
52 0.58
53 0.58
54 0.54
55 0.56
56 0.56
57 0.57
58 0.52
59 0.45
60 0.43
61 0.38
62 0.39
63 0.32
64 0.28
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.14
69 0.12
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.13
102 0.17
103 0.19
104 0.23
105 0.31
106 0.34
107 0.38
108 0.37
109 0.35
110 0.34
111 0.36
112 0.37
113 0.29
114 0.27
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.18
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.18
126 0.27
127 0.29
128 0.3
129 0.36
130 0.4
131 0.48
132 0.56
133 0.5
134 0.46
135 0.5
136 0.5
137 0.49
138 0.48
139 0.4
140 0.32
141 0.32
142 0.28
143 0.21
144 0.22
145 0.18
146 0.16
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.09
166 0.12
167 0.16
168 0.2
169 0.19
170 0.23
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.22
175 0.18
176 0.14
177 0.15
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.12
185 0.19
186 0.21
187 0.26
188 0.32
189 0.4
190 0.49
191 0.57
192 0.61
193 0.66
194 0.76
195 0.8
196 0.83
197 0.76
198 0.67
199 0.61
200 0.53
201 0.44
202 0.37
203 0.28
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.17
209 0.14
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.17
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.2
267 0.21
268 0.28
269 0.32
270 0.33
271 0.3
272 0.36
273 0.46
274 0.43
275 0.44
276 0.43
277 0.42
278 0.46
279 0.46
280 0.45
281 0.37
282 0.37
283 0.39
284 0.39
285 0.38
286 0.33
287 0.35
288 0.39
289 0.46
290 0.49
291 0.55
292 0.52
293 0.51
294 0.49
295 0.48
296 0.45
297 0.38
298 0.29
299 0.21
300 0.18
301 0.16
302 0.16
303 0.13
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.09
309 0.11
310 0.18
311 0.22
312 0.25
313 0.27
314 0.35
315 0.39
316 0.38
317 0.41
318 0.38
319 0.38
320 0.37
321 0.36
322 0.28
323 0.24
324 0.22
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.22
330 0.23
331 0.23
332 0.23
333 0.24
334 0.25
335 0.27
336 0.23
337 0.18
338 0.25
339 0.25
340 0.25
341 0.25
342 0.23
343 0.18
344 0.21
345 0.22
346 0.19
347 0.23
348 0.3
349 0.3
350 0.31
351 0.33
352 0.29
353 0.28
354 0.24
355 0.2
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.23
369 0.32
370 0.38
371 0.45
372 0.55
373 0.59
374 0.7
375 0.79
376 0.81
377 0.82
378 0.85
379 0.89
380 0.9
381 0.92
382 0.92
383 0.93
384 0.93
385 0.92
386 0.92
387 0.89
388 0.86
389 0.8
390 0.76
391 0.7
392 0.59
393 0.5
394 0.43
395 0.36
396 0.28
397 0.23
398 0.17
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.11
412 0.13
413 0.12
414 0.14
415 0.18
416 0.21
417 0.26
418 0.28
419 0.3
420 0.31
421 0.32
422 0.31
423 0.27
424 0.24
425 0.23
426 0.2
427 0.19
428 0.21
429 0.24
430 0.26
431 0.27
432 0.29
433 0.27
434 0.26
435 0.23
436 0.21
437 0.18
438 0.16
439 0.14
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.1
460 0.16
461 0.22
462 0.29
463 0.36
464 0.39
465 0.42
466 0.43
467 0.46
468 0.51
469 0.54
470 0.58
471 0.51
472 0.49
473 0.49
474 0.47
475 0.42
476 0.31
477 0.23
478 0.13
479 0.12
480 0.09
481 0.07
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.08
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.16
501 0.18
502 0.21
503 0.22
504 0.22
505 0.22
506 0.29
507 0.32
508 0.3
509 0.29
510 0.27
511 0.29
512 0.31
513 0.28
514 0.23
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.19
519 0.22
520 0.2
521 0.2
522 0.18
523 0.17
524 0.17
525 0.16
526 0.15
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.14
534 0.16
535 0.22
536 0.25
537 0.28
538 0.3
539 0.38
540 0.48
541 0.5
542 0.51
543 0.52
544 0.52
545 0.52
546 0.53
547 0.47
548 0.38
549 0.35
550 0.31
551 0.25
552 0.2
553 0.18
554 0.14
555 0.12
556 0.11
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.04
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.13
587 0.13
588 0.16
589 0.19
590 0.2
591 0.19
592 0.2
593 0.24
594 0.21
595 0.24
596 0.23
597 0.2
598 0.24
599 0.28
600 0.29
601 0.32
602 0.39
603 0.41
604 0.43
605 0.53
606 0.54
607 0.52
608 0.59
609 0.58
610 0.54
611 0.53
612 0.5
613 0.46
614 0.42
615 0.41
616 0.35
617 0.31
618 0.32
619 0.3
620 0.29
621 0.23
622 0.23
623 0.23
624 0.22
625 0.22
626 0.18
627 0.21
628 0.22
629 0.22
630 0.28
631 0.35
632 0.41
633 0.44
634 0.52
635 0.53
636 0.6
637 0.68
638 0.69
639 0.72
640 0.76
641 0.81
642 0.8
643 0.82
644 0.77
645 0.72
646 0.67
647 0.63
648 0.6
649 0.54
650 0.46
651 0.41
652 0.38
653 0.34
654 0.28
655 0.21
656 0.15
657 0.11
658 0.1
659 0.08
660 0.08
661 0.13
662 0.15
663 0.17
664 0.17
665 0.2
666 0.2
667 0.2
668 0.21
669 0.18
670 0.21
671 0.28
672 0.3
673 0.31
674 0.31
675 0.31
676 0.3
677 0.28
678 0.29
679 0.26
680 0.26
681 0.29
682 0.32
683 0.36
684 0.41
685 0.46
686 0.44
687 0.4
688 0.39
689 0.32
690 0.31
691 0.29
692 0.25
693 0.19
694 0.16
695 0.13
696 0.13
697 0.12
698 0.08
699 0.06
700 0.05
701 0.05
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.07
711 0.09
712 0.1
713 0.12
714 0.12
715 0.13
716 0.14
717 0.17
718 0.17
719 0.17
720 0.19
721 0.17
722 0.18
723 0.18
724 0.17
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.09
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.06
746 0.08
747 0.09
748 0.09
749 0.08
750 0.11
751 0.11
752 0.15
753 0.16
754 0.18
755 0.2
756 0.27
757 0.32
758 0.35
759 0.39
760 0.4
761 0.43
762 0.4
763 0.4
764 0.42
765 0.41
766 0.44
767 0.49
768 0.55
769 0.61
770 0.69
771 0.71
772 0.72
773 0.78
774 0.8
775 0.8
776 0.8
777 0.8
778 0.82
779 0.84
780 0.82
781 0.76
782 0.66
783 0.61
784 0.52
785 0.43
786 0.34
787 0.28
788 0.22
789 0.27
790 0.29
791 0.28
792 0.33
793 0.33
794 0.34
795 0.38
796 0.4
797 0.38
798 0.46
799 0.5
800 0.47
801 0.5
802 0.51
803 0.53
804 0.49
805 0.42
806 0.34
807 0.31
808 0.27
809 0.24
810 0.23
811 0.25
812 0.3
813 0.35
814 0.41
815 0.44
816 0.45
817 0.49
818 0.54
819 0.53
820 0.58
821 0.63
822 0.58
823 0.55
824 0.54
825 0.5
826 0.44
827 0.36
828 0.3
829 0.19
830 0.17
831 0.17
832 0.16
833 0.16
834 0.15
835 0.14
836 0.12
837 0.12
838 0.1
839 0.08
840 0.08
841 0.09
842 0.17
843 0.18
844 0.19
845 0.19
846 0.22
847 0.24
848 0.24
849 0.27
850 0.22
851 0.24
852 0.24
853 0.24
854 0.21
855 0.22
856 0.24
857 0.27
858 0.23
859 0.24
860 0.31
861 0.4
862 0.41
863 0.43
864 0.42
865 0.38
866 0.37
867 0.33
868 0.28
869 0.22
870 0.23
871 0.19
872 0.16
873 0.15
874 0.16
875 0.15
876 0.15
877 0.11
878 0.11
879 0.16
880 0.21
881 0.23
882 0.25
883 0.32
884 0.37
885 0.43
886 0.47
887 0.46
888 0.45
889 0.48
890 0.48
891 0.42
892 0.39
893 0.4
894 0.39
895 0.37
896 0.34
897 0.3
898 0.29
899 0.29
900 0.26
901 0.19
902 0.17
903 0.18
904 0.18
905 0.18
906 0.15
907 0.14
908 0.15
909 0.14
910 0.12
911 0.11
912 0.1
913 0.11
914 0.13
915 0.13
916 0.12
917 0.12
918 0.13
919 0.13
920 0.13
921 0.12
922 0.12
923 0.15
924 0.16
925 0.17
926 0.18
927 0.19
928 0.19
929 0.22
930 0.21
931 0.19
932 0.2
933 0.22
934 0.21
935 0.26
936 0.27
937 0.24
938 0.27
939 0.29
940 0.29
941 0.3
942 0.35
943 0.37
944 0.44
945 0.53
946 0.59
947 0.66
948 0.72
949 0.76
950 0.72
951 0.71
952 0.64
953 0.56
954 0.48
955 0.41
956 0.32
957 0.27
958 0.25
959 0.21
960 0.19
961 0.18
962 0.18
963 0.21
964 0.25
965 0.27
966 0.25
967 0.22
968 0.21
969 0.23
970 0.23
971 0.19
972 0.15
973 0.14
974 0.15
975 0.17
976 0.2
977 0.18
978 0.21
979 0.22
980 0.27
981 0.27
982 0.26
983 0.29
984 0.31
985 0.34
986 0.34
987 0.34
988 0.32
989 0.31
990 0.36
991 0.33
992 0.31
993 0.26
994 0.24
995 0.21
996 0.19
997 0.19
998 0.13
999 0.12
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.1
1003 0.1
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.08
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.08
1017 0.08
1018 0.08
1019 0.08
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.09
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.08
1030 0.09
1031 0.09
1032 0.09
1033 0.1
1034 0.1
1035 0.1
1036 0.09
1037 0.09
1038 0.09
1039 0.09
1040 0.1
1041 0.1
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.08
1047 0.07
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.07