Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O60056

Protein Details
Accession O60056    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-365AAAISRSRCSRCKKSKKGCDRQRPCGRCRDAGHydrophilic
377-397MPVSNARKPRGRGRGRPKTKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
383-397RKPRGRGRGRPKTKN
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPBC56F2.05c  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MDLHSILQPISTPSASVVTAPLPATIALPSPNYYYPPVAQGHYPVNNMWSLPSNVRVISSHGAPGHQTSASQPSTVMPALETNASNAQYYPAYSVINGNNSVQVASPAYTVSHSPHSFSNPRYVAVPQKSTSPNQVCSYCEPLPNHLTKTKSCSIPPILNSSDRSPLSLPTPYPVQYSTQPVSLPQPIAAPAPPSAESSKSTISDEDVAWQLIRLGALSSNSVKSSPSKSFVSISSPVQSTVKPTKASGVVKSEKVEKRSLPPQDFGNASSSTSAKRRRPDHNHTSTLDASSSNTSLASTGPMTVSSSTVERKGKEASEVNPNSTSSVTFSDFAAAISRSRCSRCKKSKKGCDRQRPCGRCRDAGLNSEDCISDDDMPVSNARKPRGRGRGRPKTKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.12
6 0.14
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.13
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.21
20 0.23
21 0.24
22 0.24
23 0.27
24 0.28
25 0.26
26 0.26
27 0.27
28 0.32
29 0.32
30 0.32
31 0.27
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.22
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.22
40 0.22
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.22
52 0.2
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.18
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.15
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.16
82 0.16
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.13
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.26
104 0.3
105 0.31
106 0.37
107 0.31
108 0.31
109 0.31
110 0.32
111 0.34
112 0.35
113 0.37
114 0.29
115 0.34
116 0.37
117 0.37
118 0.44
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.39
123 0.35
124 0.35
125 0.4
126 0.33
127 0.34
128 0.3
129 0.31
130 0.35
131 0.35
132 0.35
133 0.32
134 0.33
135 0.3
136 0.36
137 0.37
138 0.34
139 0.32
140 0.35
141 0.36
142 0.37
143 0.37
144 0.36
145 0.33
146 0.32
147 0.34
148 0.3
149 0.31
150 0.27
151 0.27
152 0.21
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.14
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.18
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.16
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.23
221 0.22
222 0.21
223 0.2
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.19
228 0.23
229 0.25
230 0.24
231 0.23
232 0.26
233 0.31
234 0.33
235 0.31
236 0.32
237 0.32
238 0.33
239 0.34
240 0.4
241 0.38
242 0.39
243 0.39
244 0.34
245 0.37
246 0.43
247 0.49
248 0.44
249 0.42
250 0.4
251 0.4
252 0.38
253 0.33
254 0.29
255 0.21
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.22
261 0.29
262 0.31
263 0.38
264 0.45
265 0.54
266 0.63
267 0.71
268 0.75
269 0.76
270 0.76
271 0.7
272 0.68
273 0.58
274 0.49
275 0.4
276 0.29
277 0.22
278 0.18
279 0.17
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.13
296 0.19
297 0.23
298 0.22
299 0.24
300 0.28
301 0.28
302 0.31
303 0.34
304 0.31
305 0.38
306 0.39
307 0.4
308 0.38
309 0.37
310 0.32
311 0.28
312 0.26
313 0.17
314 0.18
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.19
327 0.24
328 0.32
329 0.38
330 0.49
331 0.58
332 0.68
333 0.76
334 0.83
335 0.9
336 0.94
337 0.96
338 0.96
339 0.96
340 0.94
341 0.94
342 0.94
343 0.91
344 0.86
345 0.85
346 0.8
347 0.75
348 0.7
349 0.69
350 0.63
351 0.61
352 0.61
353 0.52
354 0.47
355 0.42
356 0.37
357 0.28
358 0.25
359 0.21
360 0.17
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.19
367 0.22
368 0.26
369 0.31
370 0.37
371 0.42
372 0.52
373 0.6
374 0.68
375 0.73
376 0.79
377 0.84