Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2BKW6

Protein Details
Accession A0A0D2BKW6    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-423VEDARRQKRLKRKATTNADGTHydrophilic
440-461ALESDKKTTKKERKLAESKFSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-414RQKRLKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQSQPPPARPTLPQTQSPFQRDFTGGHGRPSPLGPQSPQLAMNYSSPSPQQFSPQAYNQPPAAKRPRLSPDAQSPFSPQSYPPTPGGQPTTPGGNVQTNGTGPPNSRQGLMPPPQRPSDKAEDRNYEDILSGTGINIEEEARMLVRPDYYGSSTPRPASQPQSAGFRYHVNSLNAGEAGDSVNGTPQGQTGSENQPQPYQPSTEELKHRDEERADWEASRHSQHPLWDMFLLGGALNDKIRTISITEHLVDPQSGVLVNTQKHAPPPTVRVNGLEGSSRVIDKGQAILDTGTKGERLSDIMKVISLATKARLTGVVSASARISQERQLHSKGKVPDEWQDLASVTKPLNEALDGASSPAGSTSLKRTHSQANSEPVFSADPVPAPARILDVLDKTSQAERAVEDARRQKRLKRKATTNADGTVGTPSADAAAEAAAVAALESDKKTTKKERKLAESKFSEQQQHKSANEAARMAFSGLLGKGFGSKKQRTYDWMKGSGASPAMTPGRPALSATASTAGTPGPDRARAAPKDKQLGQWDEEKDPKIQARDVFLVLEGDGRNSRSYLRGLSLPEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.62
4 0.66
5 0.68
6 0.64
7 0.55
8 0.54
9 0.48
10 0.43
11 0.4
12 0.42
13 0.38
14 0.39
15 0.42
16 0.38
17 0.38
18 0.39
19 0.38
20 0.32
21 0.36
22 0.33
23 0.33
24 0.36
25 0.36
26 0.36
27 0.32
28 0.3
29 0.27
30 0.28
31 0.27
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.29
39 0.3
40 0.36
41 0.4
42 0.43
43 0.5
44 0.5
45 0.52
46 0.49
47 0.51
48 0.47
49 0.5
50 0.54
51 0.53
52 0.51
53 0.57
54 0.61
55 0.59
56 0.61
57 0.59
58 0.6
59 0.61
60 0.61
61 0.54
62 0.51
63 0.49
64 0.46
65 0.4
66 0.3
67 0.3
68 0.33
69 0.35
70 0.32
71 0.33
72 0.33
73 0.36
74 0.41
75 0.34
76 0.32
77 0.3
78 0.31
79 0.27
80 0.26
81 0.25
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.2
92 0.25
93 0.24
94 0.25
95 0.24
96 0.26
97 0.33
98 0.4
99 0.44
100 0.42
101 0.45
102 0.5
103 0.52
104 0.5
105 0.49
106 0.51
107 0.52
108 0.56
109 0.6
110 0.61
111 0.64
112 0.64
113 0.58
114 0.48
115 0.38
116 0.3
117 0.23
118 0.16
119 0.11
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.1
136 0.12
137 0.15
138 0.18
139 0.22
140 0.25
141 0.28
142 0.29
143 0.3
144 0.31
145 0.33
146 0.35
147 0.36
148 0.36
149 0.35
150 0.41
151 0.39
152 0.37
153 0.34
154 0.32
155 0.29
156 0.29
157 0.32
158 0.26
159 0.26
160 0.25
161 0.24
162 0.21
163 0.19
164 0.14
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.12
179 0.18
180 0.23
181 0.26
182 0.26
183 0.28
184 0.28
185 0.3
186 0.28
187 0.23
188 0.19
189 0.21
190 0.24
191 0.27
192 0.32
193 0.32
194 0.35
195 0.36
196 0.36
197 0.36
198 0.33
199 0.3
200 0.29
201 0.3
202 0.26
203 0.23
204 0.23
205 0.22
206 0.23
207 0.23
208 0.19
209 0.18
210 0.19
211 0.21
212 0.25
213 0.23
214 0.22
215 0.19
216 0.18
217 0.15
218 0.13
219 0.11
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.21
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.28
259 0.29
260 0.27
261 0.26
262 0.21
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.14
312 0.19
313 0.22
314 0.26
315 0.3
316 0.34
317 0.35
318 0.4
319 0.38
320 0.36
321 0.36
322 0.34
323 0.35
324 0.36
325 0.35
326 0.29
327 0.26
328 0.22
329 0.2
330 0.18
331 0.14
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.05
349 0.06
350 0.12
351 0.18
352 0.2
353 0.22
354 0.25
355 0.33
356 0.36
357 0.41
358 0.4
359 0.43
360 0.42
361 0.41
362 0.38
363 0.3
364 0.27
365 0.22
366 0.18
367 0.1
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.13
387 0.12
388 0.15
389 0.18
390 0.18
391 0.24
392 0.31
393 0.36
394 0.43
395 0.45
396 0.5
397 0.57
398 0.66
399 0.7
400 0.71
401 0.75
402 0.77
403 0.85
404 0.84
405 0.77
406 0.68
407 0.59
408 0.49
409 0.4
410 0.31
411 0.21
412 0.15
413 0.1
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.02
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.07
431 0.11
432 0.14
433 0.2
434 0.31
435 0.41
436 0.51
437 0.59
438 0.65
439 0.72
440 0.81
441 0.82
442 0.81
443 0.77
444 0.72
445 0.7
446 0.65
447 0.64
448 0.58
449 0.57
450 0.54
451 0.54
452 0.5
453 0.48
454 0.49
455 0.45
456 0.44
457 0.39
458 0.32
459 0.27
460 0.27
461 0.23
462 0.17
463 0.13
464 0.12
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.14
470 0.15
471 0.21
472 0.27
473 0.33
474 0.39
475 0.45
476 0.48
477 0.5
478 0.57
479 0.62
480 0.6
481 0.6
482 0.54
483 0.5
484 0.47
485 0.44
486 0.36
487 0.26
488 0.19
489 0.18
490 0.2
491 0.18
492 0.19
493 0.17
494 0.18
495 0.18
496 0.19
497 0.17
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.19
502 0.17
503 0.16
504 0.16
505 0.13
506 0.12
507 0.12
508 0.16
509 0.16
510 0.19
511 0.22
512 0.27
513 0.36
514 0.41
515 0.47
516 0.5
517 0.55
518 0.61
519 0.62
520 0.63
521 0.62
522 0.62
523 0.58
524 0.58
525 0.54
526 0.52
527 0.55
528 0.49
529 0.43
530 0.43
531 0.46
532 0.42
533 0.43
534 0.4
535 0.41
536 0.42
537 0.41
538 0.36
539 0.31
540 0.27
541 0.22
542 0.23
543 0.16
544 0.16
545 0.17
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.21
550 0.2
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.28