Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YYN6

Protein Details
Accession A0A0D1YYN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-103GMNKKLTRDGQPAKRRGPKPDSKPAQTRRQELNRQAQRTHRERKENYIKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-82TRDGQPAKRRGPKPDSKPAQTRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046347  bZIP_sf  
IPR007783  eIF3d  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0098808  F:mRNA cap binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002191  P:cap-dependent translational initiation  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF05091  eIF-3_zeta  
CDD cd14688  bZIP_YAP  
Amino Acid Sequences MASHPQMLSNVQQSSEMDSPWAGQDYGAVPVYNNGMVGEAKGSAYGGLLKGFGGMNKKLTRDGQPAKRRGPKPDSKPAQTRRQELNRQAQRTHRERKENYIKALEMELARLRETYLVEQNAREATLKQQQLVIENQRNENLALREILMNRGIQFENELENRKAVIAMRPKREENSLSPPNLTFSPPTSMAGRSVVGYGSAGQPTPTVYSLGVNNAMSTSGHSPGTTHHSHSPQGPDIQEVSIKQEPGAISDMPGMSEMLVPGIFEKEPQLGIDFILKLEQTCRDHGEYLVRRSMDSPNNDEEAVFSGHALMASCPPPSHIQHTPAVNGGLDPTYEHKVPDAESVQILNNLLNLSQSLKGSAIPSGQVTPIMALQSLKGHRNYATLTREDVLGMIDSIRSKVRCYGFGAVMEDFELRDALSSIFATKPETYDQLGTDYTAEIDEIVLQPQYDHFDRDGRISFFTTLQQRKQRSHRLSQIFAIMPGISLADVISNLNVNDEWGPEISSSTTLDGVPYAPFSKSDKLGRMADWTQEGKEGRDRSGRQYGRNFRDQQIYGAGTSSLFAVQVAEDESSFSVVDNTRAANKTRGFGRGGLAVFRGRGQRGAAQRGGRGTFQRAGQGRTTGQQQGQYYDNRGGRGGRGRRFGWRDYDKPQRNRDASVNIRPDWVMKEEIDFNRLAKLNLETGDGEDLDGYGFLYYYDRSFDKPPVKNTERKLLSLDRAAYNVTTSADPVIQELAEKDEATIFATSDILSMLMCATRSVYSWDIIVLKHGDKIFLDKRPDSSIDLVTVNENAADAPLEAESTTAQTGVKADSINTPSNLAMEATMINHNFAFQTVLENPNNKVEFPHPNPFYSSNDETDPLASKAYKYRRFDLSLERDEEPLNLIVRTELDAATKNNISGEDQFLVIKALNEFDHKAQGAGGALDWRTKLTSQRGAVVATEMKNNSCKLARWTTQAILAKADQMKLGFVSRVNPKSAANHVILGVVGYKPREFAGQMNLGFSNGWGIVRTIVDLVRSMAEGEDGDKKYVLIKDPNKPVIRLYEVPLNTFDEDDDGMTGTVATEGPDGGNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.21
9 0.14
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.18
14 0.18
15 0.15
16 0.13
17 0.15
18 0.18
19 0.15
20 0.14
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.07
31 0.08
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.14
40 0.17
41 0.19
42 0.26
43 0.3
44 0.32
45 0.35
46 0.39
47 0.44
48 0.48
49 0.56
50 0.59
51 0.65
52 0.72
53 0.77
54 0.83
55 0.81
56 0.8
57 0.81
58 0.8
59 0.79
60 0.82
61 0.82
62 0.8
63 0.86
64 0.85
65 0.85
66 0.83
67 0.81
68 0.8
69 0.81
70 0.82
71 0.81
72 0.83
73 0.81
74 0.79
75 0.77
76 0.75
77 0.75
78 0.75
79 0.76
80 0.74
81 0.75
82 0.74
83 0.8
84 0.82
85 0.8
86 0.77
87 0.72
88 0.64
89 0.55
90 0.53
91 0.45
92 0.34
93 0.3
94 0.27
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.24
103 0.28
104 0.29
105 0.29
106 0.31
107 0.3
108 0.28
109 0.25
110 0.18
111 0.2
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.29
116 0.29
117 0.32
118 0.38
119 0.41
120 0.4
121 0.42
122 0.44
123 0.42
124 0.42
125 0.4
126 0.38
127 0.3
128 0.24
129 0.21
130 0.2
131 0.22
132 0.21
133 0.23
134 0.19
135 0.19
136 0.17
137 0.2
138 0.19
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.2
143 0.22
144 0.27
145 0.24
146 0.25
147 0.25
148 0.23
149 0.23
150 0.19
151 0.24
152 0.29
153 0.36
154 0.44
155 0.49
156 0.51
157 0.52
158 0.56
159 0.53
160 0.49
161 0.51
162 0.5
163 0.46
164 0.45
165 0.43
166 0.4
167 0.36
168 0.32
169 0.24
170 0.19
171 0.23
172 0.22
173 0.24
174 0.23
175 0.23
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.12
196 0.13
197 0.15
198 0.17
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.22
212 0.21
213 0.23
214 0.27
215 0.3
216 0.32
217 0.36
218 0.39
219 0.36
220 0.38
221 0.34
222 0.3
223 0.28
224 0.27
225 0.25
226 0.2
227 0.22
228 0.21
229 0.21
230 0.18
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.15
236 0.13
237 0.15
238 0.15
239 0.12
240 0.13
241 0.11
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.13
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.17
267 0.16
268 0.18
269 0.22
270 0.23
271 0.25
272 0.26
273 0.34
274 0.34
275 0.35
276 0.38
277 0.34
278 0.32
279 0.33
280 0.39
281 0.36
282 0.34
283 0.34
284 0.33
285 0.35
286 0.34
287 0.32
288 0.26
289 0.22
290 0.19
291 0.14
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.11
303 0.15
304 0.17
305 0.23
306 0.24
307 0.28
308 0.32
309 0.34
310 0.33
311 0.3
312 0.28
313 0.22
314 0.18
315 0.14
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.18
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.11
362 0.14
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.21
368 0.23
369 0.25
370 0.26
371 0.24
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.2
376 0.18
377 0.12
378 0.08
379 0.07
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.09
386 0.1
387 0.16
388 0.18
389 0.2
390 0.23
391 0.26
392 0.25
393 0.26
394 0.27
395 0.21
396 0.19
397 0.17
398 0.13
399 0.09
400 0.08
401 0.06
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.1
412 0.09
413 0.1
414 0.12
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.14
421 0.13
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.14
441 0.15
442 0.17
443 0.2
444 0.18
445 0.18
446 0.18
447 0.18
448 0.16
449 0.19
450 0.24
451 0.26
452 0.31
453 0.37
454 0.4
455 0.45
456 0.53
457 0.59
458 0.58
459 0.62
460 0.65
461 0.63
462 0.61
463 0.56
464 0.52
465 0.41
466 0.35
467 0.28
468 0.18
469 0.12
470 0.1
471 0.08
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.06
504 0.08
505 0.1
506 0.12
507 0.15
508 0.18
509 0.2
510 0.23
511 0.24
512 0.24
513 0.26
514 0.24
515 0.22
516 0.22
517 0.2
518 0.16
519 0.18
520 0.18
521 0.14
522 0.19
523 0.19
524 0.18
525 0.24
526 0.25
527 0.27
528 0.37
529 0.38
530 0.38
531 0.46
532 0.53
533 0.51
534 0.58
535 0.56
536 0.48
537 0.52
538 0.47
539 0.4
540 0.33
541 0.29
542 0.21
543 0.18
544 0.16
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.11
568 0.13
569 0.14
570 0.18
571 0.19
572 0.21
573 0.23
574 0.25
575 0.23
576 0.22
577 0.22
578 0.2
579 0.2
580 0.17
581 0.16
582 0.14
583 0.13
584 0.14
585 0.15
586 0.11
587 0.12
588 0.13
589 0.17
590 0.21
591 0.25
592 0.27
593 0.26
594 0.27
595 0.28
596 0.28
597 0.25
598 0.22
599 0.21
600 0.2
601 0.19
602 0.24
603 0.23
604 0.25
605 0.24
606 0.25
607 0.22
608 0.21
609 0.24
610 0.21
611 0.2
612 0.22
613 0.21
614 0.21
615 0.24
616 0.23
617 0.22
618 0.25
619 0.26
620 0.22
621 0.22
622 0.2
623 0.2
624 0.28
625 0.33
626 0.31
627 0.35
628 0.35
629 0.42
630 0.46
631 0.46
632 0.46
633 0.46
634 0.45
635 0.47
636 0.57
637 0.58
638 0.61
639 0.66
640 0.65
641 0.61
642 0.6
643 0.57
644 0.55
645 0.52
646 0.53
647 0.51
648 0.42
649 0.41
650 0.38
651 0.35
652 0.28
653 0.24
654 0.18
655 0.13
656 0.15
657 0.2
658 0.2
659 0.21
660 0.19
661 0.17
662 0.2
663 0.2
664 0.18
665 0.14
666 0.15
667 0.15
668 0.16
669 0.17
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.11
674 0.1
675 0.07
676 0.07
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.03
681 0.03
682 0.03
683 0.04
684 0.05
685 0.05
686 0.08
687 0.08
688 0.11
689 0.14
690 0.2
691 0.29
692 0.33
693 0.39
694 0.47
695 0.51
696 0.56
697 0.57
698 0.6
699 0.54
700 0.5
701 0.49
702 0.43
703 0.41
704 0.39
705 0.38
706 0.29
707 0.27
708 0.26
709 0.21
710 0.17
711 0.15
712 0.12
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.09
724 0.09
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.1
730 0.1
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.05
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.04
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.06
746 0.07
747 0.11
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.13
752 0.13
753 0.13
754 0.15
755 0.13
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.16
760 0.14
761 0.22
762 0.24
763 0.28
764 0.33
765 0.31
766 0.33
767 0.36
768 0.38
769 0.34
770 0.32
771 0.27
772 0.24
773 0.23
774 0.2
775 0.17
776 0.16
777 0.13
778 0.09
779 0.08
780 0.06
781 0.05
782 0.05
783 0.04
784 0.05
785 0.04
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.06
794 0.06
795 0.08
796 0.08
797 0.1
798 0.09
799 0.1
800 0.14
801 0.19
802 0.21
803 0.2
804 0.21
805 0.19
806 0.19
807 0.19
808 0.14
809 0.1
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.11
817 0.11
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.07
822 0.11
823 0.13
824 0.19
825 0.22
826 0.24
827 0.25
828 0.3
829 0.31
830 0.27
831 0.27
832 0.26
833 0.33
834 0.37
835 0.46
836 0.41
837 0.41
838 0.45
839 0.46
840 0.45
841 0.43
842 0.4
843 0.33
844 0.32
845 0.32
846 0.29
847 0.27
848 0.26
849 0.19
850 0.18
851 0.15
852 0.16
853 0.23
854 0.32
855 0.39
856 0.42
857 0.46
858 0.51
859 0.55
860 0.57
861 0.59
862 0.58
863 0.56
864 0.55
865 0.51
866 0.46
867 0.42
868 0.38
869 0.3
870 0.24
871 0.18
872 0.14
873 0.12
874 0.12
875 0.12
876 0.13
877 0.12
878 0.1
879 0.11
880 0.14
881 0.15
882 0.19
883 0.19
884 0.17
885 0.17
886 0.17
887 0.18
888 0.18
889 0.2
890 0.17
891 0.17
892 0.16
893 0.16
894 0.16
895 0.14
896 0.13
897 0.09
898 0.1
899 0.11
900 0.14
901 0.16
902 0.17
903 0.21
904 0.2
905 0.2
906 0.18
907 0.18
908 0.16
909 0.13
910 0.12
911 0.1
912 0.11
913 0.12
914 0.12
915 0.12
916 0.13
917 0.15
918 0.21
919 0.26
920 0.33
921 0.33
922 0.39
923 0.39
924 0.38
925 0.37
926 0.34
927 0.31
928 0.24
929 0.27
930 0.23
931 0.24
932 0.26
933 0.27
934 0.27
935 0.25
936 0.27
937 0.3
938 0.38
939 0.4
940 0.42
941 0.47
942 0.44
943 0.49
944 0.52
945 0.45
946 0.39
947 0.36
948 0.36
949 0.33
950 0.32
951 0.26
952 0.21
953 0.21
954 0.19
955 0.21
956 0.16
957 0.15
958 0.2
959 0.28
960 0.31
961 0.33
962 0.33
963 0.33
964 0.37
965 0.42
966 0.4
967 0.33
968 0.31
969 0.28
970 0.27
971 0.25
972 0.2
973 0.16
974 0.12
975 0.12
976 0.12
977 0.12
978 0.13
979 0.13
980 0.16
981 0.16
982 0.18
983 0.24
984 0.29
985 0.29
986 0.31
987 0.3
988 0.28
989 0.26
990 0.23
991 0.18
992 0.11
993 0.11
994 0.09
995 0.1
996 0.11
997 0.11
998 0.12
999 0.11
1000 0.12
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.13
1004 0.12
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.18
1012 0.19
1013 0.2
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.24
1017 0.28
1018 0.32
1019 0.34
1020 0.4
1021 0.48
1022 0.58
1023 0.67
1024 0.65
1025 0.62
1026 0.6
1027 0.57
1028 0.57
1029 0.5
1030 0.45
1031 0.45
1032 0.42
1033 0.43
1034 0.41
1035 0.38
1036 0.31
1037 0.28
1038 0.24
1039 0.17
1040 0.17
1041 0.16
1042 0.14
1043 0.11
1044 0.1
1045 0.1
1046 0.09
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.07
1051 0.07
1052 0.07
1053 0.07