FuNGI

A0A0D1Y6B3

Protein Details

Accession

A0A0D1Y6B3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-448	KRRKEMEDRRERNQRRRDQENQAREAREAARNPKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLTKKYPKIITPVIEELPYEIDGVQYPVDTTKPNPNGEEMHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRQQKQDRDEDSESTVEEVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAELKIIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPEYDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVNVRDAKAKTCKLCGQQGHYAENCRGNAKAKSGDFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLAAEMFVPGQSFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIHEDGIDKLIAIWRDNIPVMGGYLTCDGSVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEMEDRRERNQRRRDQENQAREAREAARNPKRRRSSPDYSLGGRVPARVDARVPTGPIDAIEATNYPMLDYNAIVNRNTVDKTQTSNKSAAAVLKEQMLAKKAAGTPTKDGSVGASNGVGTADTTPTSALGKRKAELIDAESEDSGTPGRNTPVEKPQSSADPNDPPPDTVRLWEPGYAERYYEQKFHVSPDDFEFRHKVARSYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIDEMTVKFDKGKPFKPYEQLMGVLPASSNHAIPKAFHPLMTDEDSDIVDFYPEEFDLDLNGKKQSWKAIVLLPFIDEQRLLNAMATKYPLLTEDERVRNELGKEALIISHRNPLYEDLALQFYSKKAKDGKNGVKLSMRKGKLAGTVMKNDDFLPHMDLIGPEEDIKLEPVVDDDHSLMVHYSAPPATHVHKSMLFPGVVLPPPVLDKSDLAILRSKARNSGRDFGGAPLYDNSRRDPQDHQNRGGRINYAVDRPYPGSNQGGNGSDNPFAALLDPRYAPQGRGGPPPPPPPYQNGYQNGYDRYQAPANSYGGYGGGQGGYNNYQNPAHGGQGQYNSGNQGQSQNQYDNRRYQQNGGRSASDGYYQSQGQSQRGGGNYNQGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.62
7	0.59
8	0.53
9	0.45
10	0.41
11	0.34
12	0.29
13	0.24
14	0.18
15	0.13
16	0.11
17	0.11
18	0.13
19	0.12
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.12
24	0.14
25	0.16
26	0.25
27	0.32
28	0.35
29	0.36
30	0.38
31	0.41
32	0.43
33	0.48
34	0.42
35	0.39
36	0.36
37	0.34
38	0.31
39	0.27
40	0.24
41	0.14
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.21
50	0.27
51	0.28
52	0.37
53	0.46
54	0.53
55	0.6
56	0.59
57	0.6
58	0.59
59	0.6
60	0.51
61	0.44
62	0.38
63	0.32
64	0.3
65	0.24
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.45
81	0.47
82	0.46
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.09
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.82
105	0.8
106	0.77
107	0.79
108	0.79
109	0.75
110	0.76
111	0.69
112	0.62
113	0.67
114	0.62
115	0.56
116	0.53
117	0.47
118	0.42
119	0.43
120	0.41
121	0.31
122	0.3
123	0.35
124	0.38
125	0.47
126	0.47
127	0.49
128	0.53
129	0.6
130	0.63
131	0.6
132	0.54
133	0.53
134	0.52
135	0.48
136	0.47
137	0.39
138	0.35
139	0.29
140	0.25
141	0.18
142	0.17
143	0.16
144	0.14
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.18
149	0.23
150	0.25
151	0.27
152	0.32
153	0.32
154	0.32
155	0.31
156	0.3
157	0.25
158	0.21
159	0.17
160	0.12
161	0.1
162	0.1
163	0.13
164	0.12
165	0.13
166	0.13
167	0.16
168	0.15
169	0.15
170	0.18
171	0.18
172	0.25
173	0.28
174	0.32
175	0.35
176	0.42
177	0.41
178	0.41
179	0.38
180	0.33
181	0.32
182	0.28
183	0.23
184	0.17
185	0.17
186	0.16
187	0.15
188	0.12
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.11
200	0.1
201	0.13
202	0.14
203	0.15
204	0.18
205	0.24
206	0.3
207	0.31
208	0.33
209	0.35
210	0.39
211	0.41
212	0.38
213	0.42
214	0.38
215	0.41
216	0.42
217	0.41
218	0.4
219	0.37
220	0.35
221	0.26
222	0.23
223	0.18
224	0.18
225	0.15
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.06
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.05
238	0.07
239	0.08
240	0.11
241	0.13
242	0.14
243	0.18
244	0.2
245	0.23
246	0.26
247	0.29
248	0.27
249	0.32
250	0.32
251	0.29
252	0.33
253	0.3
254	0.32
255	0.36
256	0.4
257	0.36
258	0.4
259	0.45
260	0.44
261	0.51
262	0.5
263	0.49
264	0.5
265	0.52
266	0.51
267	0.47
268	0.45
269	0.4
270	0.39
271	0.34
272	0.28
273	0.26
274	0.26
275	0.26
276	0.27
277	0.31
278	0.27
279	0.29
280	0.32
281	0.36
282	0.32
283	0.32
284	0.29
285	0.23
286	0.24
287	0.22
288	0.2
289	0.15
290	0.17
291	0.17
292	0.15
293	0.16
294	0.15
295	0.14
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.17
300	0.18
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.13
323	0.14
324	0.14
325	0.17
326	0.15
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.1
331	0.08
332	0.08
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.08
355	0.06
356	0.05
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.11
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.12
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.06
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.07
393	0.08
394	0.12
395	0.14
396	0.21
397	0.26
398	0.26
399	0.33
400	0.36
401	0.39
402	0.44
403	0.52
404	0.55
405	0.61
406	0.65
407	0.66
408	0.74
409	0.78
410	0.78
411	0.78
412	0.76
413	0.72
414	0.75
415	0.76
416	0.76
417	0.78
418	0.76
419	0.72
420	0.68
421	0.61
422	0.53
423	0.48
424	0.4
425	0.36
426	0.31
427	0.35
428	0.4
429	0.48
430	0.53
431	0.6
432	0.64
433	0.65
434	0.7
435	0.7
436	0.68
437	0.65
438	0.69
439	0.63
440	0.57
441	0.54
442	0.45
443	0.38
444	0.3
445	0.24
446	0.16
447	0.16
448	0.15
449	0.13
450	0.14
451	0.13
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.13
456	0.13
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.08
473	0.1
474	0.11
475	0.11
476	0.1
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.11
481	0.11
482	0.11
483	0.15
484	0.22
485	0.26
486	0.27
487	0.27
488	0.27
489	0.26
490	0.26
491	0.24
492	0.18
493	0.15
494	0.13
495	0.13
496	0.14
497	0.13
498	0.13
499	0.12
500	0.11
501	0.1
502	0.12
503	0.13
504	0.17
505	0.19
506	0.2
507	0.21
508	0.22
509	0.22
510	0.19
511	0.18
512	0.14
513	0.14
514	0.12
515	0.09
516	0.08
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.06
529	0.09
530	0.11
531	0.16
532	0.17
533	0.18
534	0.21
535	0.21
536	0.21
537	0.19
538	0.19
539	0.17
540	0.16
541	0.16
542	0.13
543	0.13
544	0.11
545	0.1
546	0.08
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.09
552	0.11
553	0.14
554	0.23
555	0.28
556	0.28
557	0.28
558	0.29
559	0.31
560	0.31
561	0.3
562	0.25
563	0.25
564	0.26
565	0.28
566	0.27
567	0.23
568	0.23
569	0.24
570	0.21
571	0.17
572	0.17
573	0.17
574	0.17
575	0.18
576	0.18
577	0.17
578	0.2
579	0.19
580	0.17
581	0.15
582	0.19
583	0.19
584	0.19
585	0.18
586	0.18
587	0.18
588	0.2
589	0.25
590	0.23
591	0.23
592	0.25
593	0.29
594	0.26
595	0.27
596	0.27
597	0.22
598	0.26
599	0.25
600	0.22
601	0.2
602	0.24
603	0.25
604	0.27
605	0.27
606	0.22
607	0.22
608	0.2
609	0.17
610	0.13
611	0.1
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.08
620	0.09
621	0.14
622	0.17
623	0.16
624	0.19
625	0.2
626	0.25
627	0.28
628	0.3
629	0.28
630	0.24
631	0.24
632	0.21
633	0.2
634	0.15
635	0.12
636	0.09
637	0.07
638	0.08
639	0.08
640	0.08
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.09
646	0.08
647	0.09
648	0.13
649	0.21
650	0.25
651	0.31
652	0.37
653	0.43
654	0.47
655	0.51
656	0.5
657	0.46
658	0.43
659	0.38
660	0.31
661	0.27
662	0.22
663	0.16
664	0.13
665	0.09
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.11
671	0.11
672	0.13
673	0.15
674	0.21
675	0.21
676	0.2
677	0.21
678	0.21
679	0.25
680	0.26
681	0.24
682	0.16
683	0.16
684	0.16
685	0.14
686	0.13
687	0.09
688	0.06
689	0.05
690	0.05
691	0.06
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.09
698	0.1
699	0.1
700	0.12
701	0.12
702	0.14
703	0.16
704	0.2
705	0.21
706	0.22
707	0.23
708	0.27
709	0.29
710	0.29
711	0.28
712	0.23
713	0.21
714	0.19
715	0.17
716	0.12
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.09
721	0.09
722	0.12
723	0.12
724	0.13
725	0.14
726	0.13
727	0.12
728	0.12
729	0.12
730	0.13
731	0.14
732	0.18
733	0.25
734	0.31
735	0.31
736	0.33
737	0.33
738	0.32
739	0.31
740	0.29
741	0.22
742	0.16
743	0.16
744	0.14
745	0.15
746	0.14
747	0.15
748	0.13
749	0.19
750	0.19
751	0.19
752	0.2
753	0.21
754	0.22
755	0.21
756	0.2
757	0.14
758	0.16
759	0.16
760	0.15
761	0.13
762	0.12
763	0.18
764	0.18
765	0.21
766	0.28
767	0.34
768	0.42
769	0.52
770	0.6
771	0.63
772	0.64
773	0.62
774	0.61
775	0.58
776	0.57
777	0.56
778	0.48
779	0.4
780	0.4
781	0.4
782	0.38
783	0.4
784	0.39
785	0.34
786	0.38
787	0.4
788	0.39
789	0.37
790	0.32
791	0.28
792	0.22
793	0.19
794	0.17
795	0.14
796	0.13
797	0.13
798	0.13
799	0.14
800	0.13
801	0.12
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.09
806	0.1
807	0.08
808	0.07
809	0.07
810	0.07
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.09
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.09
819	0.08
820	0.09
821	0.08
822	0.09
823	0.1
824	0.1
825	0.11
826	0.14
827	0.18
828	0.21
829	0.22
830	0.24
831	0.27
832	0.28
833	0.3
834	0.31
835	0.27
836	0.23
837	0.23
838	0.24
839	0.21
840	0.2
841	0.16
842	0.13
843	0.15
844	0.16
845	0.15
846	0.12
847	0.12
848	0.13
849	0.19
850	0.19
851	0.18
852	0.23
853	0.23
854	0.3
855	0.34
856	0.33
857	0.36
858	0.41
859	0.47
860	0.49
861	0.54
862	0.48
863	0.47
864	0.47
865	0.41
866	0.4
867	0.33
868	0.28
869	0.23
870	0.26
871	0.26
872	0.27
873	0.29
874	0.32
875	0.34
876	0.35
877	0.4
878	0.46
879	0.53
880	0.59
881	0.63
882	0.62
883	0.63
884	0.64
885	0.59
886	0.5
887	0.41
888	0.4
889	0.35
890	0.32
891	0.31
892	0.29
893	0.3
894	0.3
895	0.31
896	0.28
897	0.28
898	0.28
899	0.28
900	0.29
901	0.29
902	0.28
903	0.27
904	0.27
905	0.26
906	0.22
907	0.21
908	0.19
909	0.16
910	0.13
911	0.13
912	0.14
913	0.13
914	0.15
915	0.16
916	0.15
917	0.21
918	0.23
919	0.22
920	0.25
921	0.31
922	0.31
923	0.39
924	0.41
925	0.4
926	0.46
927	0.54
928	0.53
929	0.51
930	0.5
931	0.48
932	0.5
933	0.53
934	0.55
935	0.53
936	0.53
937	0.53
938	0.54
939	0.52
940	0.49
941	0.44
942	0.35
943	0.34
944	0.34
945	0.29
946	0.29
947	0.3
948	0.3
949	0.28
950	0.27
951	0.22
952	0.18
953	0.17
954	0.14
955	0.09
956	0.09
957	0.08
958	0.08
959	0.11
960	0.14
961	0.16
962	0.17
963	0.19
964	0.18
965	0.19
966	0.23
967	0.22
968	0.22
969	0.23
970	0.24
971	0.26
972	0.29
973	0.32
974	0.28
975	0.27
976	0.28
977	0.27
978	0.26
979	0.22
980	0.24
981	0.26
982	0.31
983	0.34
984	0.38
985	0.43
986	0.5
987	0.55
988	0.58
989	0.61
990	0.63
991	0.62
992	0.64
993	0.65
994	0.66
995	0.69
996	0.63
997	0.58
998	0.51
999	0.51
1000	0.43
1001	0.38
1002	0.31
1003	0.25
1004	0.24
1005	0.23
1006	0.22
1007	0.25
1008	0.28
1009	0.27
1010	0.29
1011	0.28
1012	0.3
1013	0.31
1014	0.34
1015	0.3
1016	0.36
1017	0.34
1018	0.34

A0A0D1Y6B3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer