Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O94290

Protein Details
Accession O94290    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-217LDPMRDYIHREKRRKLKHESSDRSDKSDSNRHSRHHRRHSRSRRHRDLDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-213REKRRKLKHESSDRSDKSDSNRHSRHHRRHSRSRRHR
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG spo:SPBC887.05c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNSIRQIERLNEQELDKPFSSSWHQDYSDSAYIYIGNLDFDLNEDDILCVFSEFGEPVDINLVRDKETGKSKGFAFLKYEDQRSTVLAVDNMTNVKLLDRLVRVDHVASYKVPQKEKEPANLVPLGESGSSLSVSTINTSNLPDHDYKTIIQNEVEQTLSPKDEKDLLDPMRDYIHREKRRKLKHESSDRSDKSDSNRHSRHHRRHSRSRRHRDLDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.35
4 0.33
5 0.29
6 0.3
7 0.34
8 0.33
9 0.34
10 0.34
11 0.35
12 0.33
13 0.35
14 0.39
15 0.38
16 0.32
17 0.28
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.11
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.08
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.07
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.23
55 0.27
56 0.25
57 0.28
58 0.27
59 0.34
60 0.35
61 0.32
62 0.29
63 0.27
64 0.34
65 0.34
66 0.37
67 0.29
68 0.29
69 0.27
70 0.25
71 0.23
72 0.16
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.16
98 0.19
99 0.21
100 0.21
101 0.23
102 0.3
103 0.33
104 0.36
105 0.35
106 0.32
107 0.34
108 0.34
109 0.3
110 0.22
111 0.2
112 0.15
113 0.1
114 0.09
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.21
136 0.23
137 0.21
138 0.2
139 0.22
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.25
154 0.25
155 0.29
156 0.29
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.3
161 0.33
162 0.42
163 0.48
164 0.55
165 0.63
166 0.69
167 0.79
168 0.82
169 0.82
170 0.82
171 0.83
172 0.87
173 0.87
174 0.85
175 0.86
176 0.79
177 0.75
178 0.66
179 0.59
180 0.55
181 0.56
182 0.54
183 0.54
184 0.58
185 0.58
186 0.67
187 0.75
188 0.78
189 0.8
190 0.84
191 0.84
192 0.89
193 0.94
194 0.94
195 0.95
196 0.95
197 0.95