Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2BDJ8

Protein Details
Accession A0A0D2BDJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-82GVWRDQRSRKHSRSRSPVRDGBasic
168-188IYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-103SRKHSRSRSPVRDGANGSIRTRSPPRRSDHDRGRN
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, cyto 6.5, cyto_pero 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences METGMKDDVTNEKMVTETDRDREIRIKSEKNEAGRESDRIETGIEVRESATPMVTVTGTGVGVWRDQRSRKHSRSRSPVRDGANGSIRTRSPPRRSDHDRGRNREPAKVEDTKSTHNTKHGIAGSGQPSVNGDRMAVDEDDEDALLRNMMGFTTFKSTQNTKVPGNQIYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.23
6 0.28
7 0.29
8 0.31
9 0.37
10 0.36
11 0.39
12 0.44
13 0.48
14 0.46
15 0.55
16 0.57
17 0.56
18 0.59
19 0.52
20 0.51
21 0.46
22 0.45
23 0.38
24 0.35
25 0.3
26 0.24
27 0.23
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.09
51 0.11
52 0.15
53 0.2
54 0.27
55 0.35
56 0.45
57 0.52
58 0.61
59 0.67
60 0.73
61 0.79
62 0.83
63 0.83
64 0.8
65 0.77
66 0.7
67 0.66
68 0.58
69 0.51
70 0.47
71 0.4
72 0.34
73 0.3
74 0.27
75 0.26
76 0.31
77 0.35
78 0.35
79 0.4
80 0.45
81 0.51
82 0.59
83 0.65
84 0.69
85 0.71
86 0.73
87 0.72
88 0.73
89 0.72
90 0.65
91 0.6
92 0.52
93 0.45
94 0.42
95 0.41
96 0.37
97 0.34
98 0.36
99 0.36
100 0.38
101 0.38
102 0.33
103 0.32
104 0.33
105 0.27
106 0.31
107 0.27
108 0.24
109 0.21
110 0.24
111 0.22
112 0.22
113 0.21
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.09
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.05
139 0.07
140 0.14
141 0.16
142 0.18
143 0.23
144 0.26
145 0.32
146 0.4
147 0.43
148 0.39
149 0.44
150 0.47
151 0.45
152 0.46
153 0.43
154 0.41
155 0.42
156 0.46
157 0.48
158 0.5
159 0.49
160 0.51
161 0.56
162 0.61
163 0.65
164 0.69
165 0.7
166 0.73
167 0.78
168 0.82
169 0.81
170 0.77
171 0.71
172 0.63
173 0.56
174 0.53
175 0.49
176 0.44
177 0.39