FuNGI

A0A0D1YPE0

Protein Details

Accession

A0A0D1YPE0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-72	AVKRTKPLTRTSPKRPAHTAASSRSKRRKLKDEPSLEAI	Hydrophilic
90-110	SQKQSSQKRKLQQTYAHRKTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-64	KPLTRTSPKRPAHTAASSRSKRRKLK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MAAAKMKEDDLEAIYGPPLSSDEENGSSAEIETAVKRTKPLTRTSPKRPAHTAASSRSKRRKLKDEPSLEAIDLSGQSGMQEPYFLSSGSQKQSSQKRKLQQTYAHRKTFERLDDLDVMLNQPNGKQDFVLHEVVEKRSNGAGSKREFLRAAPLPGKHPTRATRASRKMLDIADLPSAISERKDSDFQMPELPGITSSATTSATDITSIFEEPIVPISSRRRSGSTSSLSSANSMFILENEADLMEQFEPLEVGVCCPICQQPVRDSESVFVPDNLRSLSFKQQQAFCTKHQVADAKQVYQERGYPDIDWEDLEKSRIPKQMYLLKKLINRQTTSVYLDKLDEKIKAAKGNGKAIRQYLANGVVDVAQPGYYGPKGTRIMVTLITDSLTDTLKAALQSDSVLRAAGVGGYVSAVLVPELTLQLVMADLNLSDAAEGRRVLNESTKIGVLLNPDDDHIERDDDDDDDDDDDDDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.14
3	0.13
4	0.11
5	0.1
6	0.12
7	0.12
8	0.14
9	0.18
10	0.19
11	0.2
12	0.2
13	0.19
14	0.16
15	0.15
16	0.13
17	0.1
18	0.09
19	0.1
20	0.15
21	0.18
22	0.19
23	0.21
24	0.25
25	0.32
26	0.36
27	0.43
28	0.49
29	0.56
30	0.65
31	0.73
32	0.79
33	0.78
34	0.8
35	0.78
36	0.73
37	0.7
38	0.7
39	0.67
40	0.65
41	0.69
42	0.69
43	0.73
44	0.77
45	0.79
46	0.79
47	0.81
48	0.83
49	0.83
50	0.86
51	0.87
52	0.85
53	0.81
54	0.78
55	0.7
56	0.6
57	0.49
58	0.38
59	0.29
60	0.2
61	0.15
62	0.09
63	0.06
64	0.07
65	0.09
66	0.1
67	0.08
68	0.09
69	0.08
70	0.11
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.14
75	0.2
76	0.23
77	0.26
78	0.26
79	0.34
80	0.44
81	0.54
82	0.58
83	0.61
84	0.66
85	0.74
86	0.8
87	0.8
88	0.79
89	0.8
90	0.81
91	0.83
92	0.79
93	0.71
94	0.64
95	0.6
96	0.59
97	0.52
98	0.46
99	0.38
100	0.37
101	0.37
102	0.36
103	0.32
104	0.25
105	0.22
106	0.18
107	0.17
108	0.12
109	0.11
110	0.16
111	0.16
112	0.16
113	0.14
114	0.15
115	0.18
116	0.22
117	0.23
118	0.18
119	0.2
120	0.23
121	0.25
122	0.27
123	0.22
124	0.19
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.22
129	0.26
130	0.26
131	0.32
132	0.31
133	0.33
134	0.32
135	0.29
136	0.32
137	0.29
138	0.31
139	0.3
140	0.3
141	0.31
142	0.37
143	0.4
144	0.34
145	0.36
146	0.36
147	0.39
148	0.46
149	0.51
150	0.55
151	0.59
152	0.64
153	0.61
154	0.59
155	0.55
156	0.46
157	0.4
158	0.32
159	0.26
160	0.19
161	0.17
162	0.14
163	0.11
164	0.11
165	0.09
166	0.08
167	0.07
168	0.08
169	0.11
170	0.12
171	0.14
172	0.2
173	0.21
174	0.22
175	0.25
176	0.22
177	0.2
178	0.2
179	0.18
180	0.12
181	0.1
182	0.1
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.09
204	0.15
205	0.19
206	0.22
207	0.23
208	0.24
209	0.25
210	0.29
211	0.33
212	0.32
213	0.3
214	0.29
215	0.29
216	0.27
217	0.25
218	0.21
219	0.15
220	0.11
221	0.09
222	0.07
223	0.05
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.09
247	0.11
248	0.13
249	0.16
250	0.22
251	0.27
252	0.26
253	0.26
254	0.25
255	0.25
256	0.25
257	0.21
258	0.17
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.13
266	0.21
267	0.26
268	0.29
269	0.32
270	0.36
271	0.38
272	0.42
273	0.43
274	0.36
275	0.39
276	0.36
277	0.34
278	0.33
279	0.34
280	0.3
281	0.36
282	0.36
283	0.28
284	0.31
285	0.31
286	0.29
287	0.26
288	0.27
289	0.2
290	0.21
291	0.2
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.17
296	0.15
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.13
301	0.14
302	0.15
303	0.21
304	0.25
305	0.26
306	0.26
307	0.32
308	0.39
309	0.42
310	0.46
311	0.44
312	0.44
313	0.46
314	0.51
315	0.53
316	0.51
317	0.47
318	0.43
319	0.43
320	0.41
321	0.41
322	0.36
323	0.3
324	0.24
325	0.24
326	0.23
327	0.22
328	0.22
329	0.18
330	0.18
331	0.23
332	0.25
333	0.27
334	0.28
335	0.32
336	0.34
337	0.43
338	0.45
339	0.43
340	0.43
341	0.41
342	0.4
343	0.34
344	0.31
345	0.25
346	0.25
347	0.21
348	0.18
349	0.17
350	0.16
351	0.15
352	0.14
353	0.1
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.16
362	0.18
363	0.2
364	0.21
365	0.2
366	0.22
367	0.23
368	0.24
369	0.18
370	0.17
371	0.15
372	0.14
373	0.12
374	0.12
375	0.1
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.11
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.06
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.03
402	0.03
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.07
420	0.08
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.16
426	0.18
427	0.23
428	0.26
429	0.25
430	0.27
431	0.27
432	0.25
433	0.23
434	0.23
435	0.2
436	0.19
437	0.2
438	0.18
439	0.19
440	0.21
441	0.21
442	0.22
443	0.21
444	0.2
445	0.17
446	0.18
447	0.19
448	0.17
449	0.18
450	0.17
451	0.15
452	0.14
453	0.14
454	0.13

A0A0D1YPE0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer