Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P24488

Protein Details
Accession P24488    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34YVNAKQYHRILKRREARAKLEERLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-62KRREARAKLEERLRGVQTTKKPYLHESRHKHAMRRPRGPGG
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018362  CCAAT-binding_factor_CS  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0000792  C:heterochromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0140585  F:promoter-enhancer loop anchoring activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000979  F:RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:1903715  P:regulation of aerobic respiration  
GO:0006109  P:regulation of carbohydrate metabolic process  
KEGG spo:SPBC725.11c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00686  NFYA_HAP2_1  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MNPYEPVEGLYVNAKQYHRILKRREARAKLEERLRGVQTTKKPYLHESRHKHAMRRPRGPGGRFLTADKVSKLRAQEAAEAAANGGSTGDDVNATNANDATVPATVSSEVTHTSEGYADSNDSRPSSISNSSESPAPINSATASMSPANNTSGNNITSPNVRGELDMSGNIAMSGGPTNTASTSGPVPHDMTVLPQTDSNTSNLMSSGSQLGSFATASTNGNNSTTTTTSSAAHPGSFHKGTNDYSSTLAGNEHSAFPGLDVYHDDSVSAGAAFIPHNPMDSIDHLDVNDPTATGLPVLPASDIDPLNLTGNTQDSMIIGQQTYPSHGSSGTMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.3
4 0.4
5 0.45
6 0.52
7 0.58
8 0.63
9 0.72
10 0.79
11 0.83
12 0.8
13 0.79
14 0.81
15 0.8
16 0.78
17 0.76
18 0.71
19 0.66
20 0.64
21 0.58
22 0.52
23 0.48
24 0.47
25 0.48
26 0.52
27 0.54
28 0.52
29 0.52
30 0.56
31 0.63
32 0.66
33 0.67
34 0.66
35 0.67
36 0.74
37 0.76
38 0.75
39 0.71
40 0.72
41 0.72
42 0.73
43 0.71
44 0.71
45 0.75
46 0.7
47 0.73
48 0.68
49 0.64
50 0.56
51 0.51
52 0.47
53 0.42
54 0.42
55 0.35
56 0.31
57 0.27
58 0.29
59 0.29
60 0.26
61 0.27
62 0.27
63 0.29
64 0.28
65 0.28
66 0.25
67 0.22
68 0.19
69 0.14
70 0.12
71 0.08
72 0.06
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.14
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.2
120 0.19
121 0.17
122 0.13
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.19
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.21
224 0.21
225 0.21
226 0.19
227 0.22
228 0.23
229 0.27
230 0.27
231 0.21
232 0.21
233 0.22
234 0.2
235 0.17
236 0.16
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.09
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.1
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.16
269 0.21
270 0.19
271 0.2
272 0.19
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.17
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.12
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.11
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.15
309 0.15
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.18