FuNGI

A0A0D2B6H1

Protein Details

Accession

A0A0D2B6H1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-47	QQPLENRPVVKRKKPQSDPFFKGPKRNPAFKPQLN	Hydrophilic
139-158	SEFPKPARLHRRDPRAPPPG	Basic
544-567	GTDASTRKKKLKSKHLSSSQPTPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-26	RKK
423-439	KREAEARKRNFKELRKA
501-536	KKSAIPSPSGTPSGRKEKRGTGSDRERARGLKRPGS
550-557	RKKKLKSK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, mito_nucl 12, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNVGSAPAGGTAQQPLENRPVVKRKKPQSDPFFKGPKRNPAFKPQLNNHPAAPLNGQPTSKSQPPQPLTPASQRDTSLAKTAIQENERYSGFTDPRVPAEGIPYKDYKLVTTKRDLLAGLRYHILQLAGDKVVDIRNESEFPKPARLHRRDPRAPPPGHQHQLKTEEPGQPEPKDGLNAAEREELTRRKEIRQREREANLAQIAPSQNTANKRMNAFKKKTQQVFRPEFSAEDKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDSKHCLIGSHQMGAMNSNAAFIFEPGVDASSERVRLVPIEKVYQFKPKRELAQQMTIEEVEAAMKKRGSDPEWLIRQREARIAEASRDLAAKRTKGVFTGAQTQSIAGRTGEEADLDYEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKLAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEEREKREAEARKRNFKELRKALERREHNYNHGTDSEYESSVSLHYCPLLDLTDIRNQTDSEEERERLERERIANIKKEDEDGKKSAIPSPSGTPSGRKEKRGTGSDRERARGLKRPGSPNLSEASGTDASTRKKKLKSKHLSSSQPTPSVSRPMSPANVPGQVRKRPGAGSDTDAGVSDRDGGAMSDASRARKIKLKMSASPPATSPPSRTGSPAPGIVGGAPSPTQAPTAFPSVQEIKNAIPSHGITIKDLMKIVAHPRERRGEFVNLVKEVAKMDKERNVLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.21
3	0.27
4	0.3
5	0.32
6	0.38
7	0.47
8	0.53
9	0.61
10	0.68
11	0.72
12	0.79
13	0.87
14	0.89
15	0.89
16	0.9
17	0.88
18	0.87
19	0.87
20	0.82
21	0.82
22	0.79
23	0.79
24	0.77
25	0.79
26	0.75
27	0.75
28	0.8
29	0.77
30	0.79
31	0.76
32	0.78
33	0.75
34	0.72
35	0.62
36	0.57
37	0.51
38	0.44
39	0.39
40	0.32
41	0.31
42	0.32
43	0.32
44	0.28
45	0.33
46	0.36
47	0.39
48	0.38
49	0.4
50	0.46
51	0.5
52	0.55
53	0.55
54	0.55
55	0.54
56	0.6
57	0.6
58	0.53
59	0.53
60	0.47
61	0.45
62	0.41
63	0.38
64	0.35
65	0.29
66	0.28
67	0.27
68	0.32
69	0.35
70	0.34
71	0.35
72	0.31
73	0.34
74	0.33
75	0.3
76	0.27
77	0.27
78	0.26
79	0.26
80	0.3
81	0.28
82	0.3
83	0.33
84	0.32
85	0.26
86	0.33
87	0.36
88	0.32
89	0.34
90	0.33
91	0.3
92	0.33
93	0.33
94	0.28
95	0.31
96	0.35
97	0.36
98	0.42
99	0.47
100	0.45
101	0.46
102	0.44
103	0.37
104	0.38
105	0.34
106	0.29
107	0.24
108	0.23
109	0.22
110	0.22
111	0.2
112	0.13
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.13
123	0.15
124	0.18
125	0.19
126	0.23
127	0.25
128	0.27
129	0.34
130	0.35
131	0.41
132	0.5
133	0.55
134	0.61
135	0.65
136	0.74
137	0.74
138	0.79
139	0.8
140	0.79
141	0.74
142	0.7
143	0.7
144	0.69
145	0.68
146	0.64
147	0.57
148	0.54
149	0.59
150	0.54
151	0.51
152	0.47
153	0.44
154	0.44
155	0.48
156	0.46
157	0.4
158	0.4
159	0.36
160	0.31
161	0.28
162	0.25
163	0.21
164	0.2
165	0.2
166	0.2
167	0.21
168	0.2
169	0.21
170	0.25
171	0.27
172	0.26
173	0.34
174	0.34
175	0.39
176	0.45
177	0.54
178	0.6
179	0.65
180	0.69
181	0.7
182	0.7
183	0.68
184	0.63
185	0.57
186	0.48
187	0.38
188	0.3
189	0.25
190	0.23
191	0.18
192	0.18
193	0.14
194	0.16
195	0.19
196	0.25
197	0.28
198	0.3
199	0.33
200	0.4
201	0.49
202	0.56
203	0.58
204	0.61
205	0.65
206	0.71
207	0.76
208	0.75
209	0.73
210	0.73
211	0.75
212	0.68
213	0.61
214	0.52
215	0.46
216	0.43
217	0.46
218	0.38
219	0.37
220	0.39
221	0.38
222	0.42
223	0.42
224	0.39
225	0.39
226	0.46
227	0.43
228	0.44
229	0.43
230	0.38
231	0.43
232	0.42
233	0.33
234	0.25
235	0.21
236	0.18
237	0.23
238	0.25
239	0.22
240	0.24
241	0.23
242	0.21
243	0.2
244	0.2
245	0.15
246	0.21
247	0.19
248	0.17
249	0.18
250	0.18
251	0.18
252	0.19
253	0.18
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.1
275	0.11
276	0.14
277	0.14
278	0.17
279	0.19
280	0.21
281	0.23
282	0.32
283	0.33
284	0.33
285	0.38
286	0.37
287	0.41
288	0.44
289	0.51
290	0.45
291	0.5
292	0.48
293	0.42
294	0.39
295	0.33
296	0.28
297	0.19
298	0.14
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.12
306	0.15
307	0.16
308	0.21
309	0.24
310	0.3
311	0.37
312	0.38
313	0.37
314	0.36
315	0.37
316	0.33
317	0.33
318	0.27
319	0.21
320	0.22
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.18
325	0.14
326	0.14
327	0.12
328	0.14
329	0.15
330	0.15
331	0.16
332	0.18
333	0.17
334	0.17
335	0.2
336	0.17
337	0.17
338	0.25
339	0.23
340	0.22
341	0.22
342	0.21
343	0.19
344	0.18
345	0.17
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.04
372	0.03
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.08
378	0.09
379	0.15
380	0.18
381	0.18
382	0.2
383	0.26
384	0.29
385	0.29
386	0.35
387	0.36
388	0.37
389	0.39
390	0.35
391	0.31
392	0.28
393	0.26
394	0.24
395	0.17
396	0.14
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.17
401	0.18
402	0.15
403	0.21
404	0.21
405	0.21
406	0.25
407	0.25
408	0.26
409	0.26
410	0.25
411	0.25
412	0.33
413	0.38
414	0.45
415	0.51
416	0.59
417	0.61
418	0.69
419	0.7
420	0.69
421	0.7
422	0.68
423	0.69
424	0.68
425	0.7
426	0.69
427	0.7
428	0.68
429	0.62
430	0.63
431	0.57
432	0.52
433	0.53
434	0.47
435	0.4
436	0.36
437	0.33
438	0.25
439	0.28
440	0.24
441	0.19
442	0.18
443	0.16
444	0.15
445	0.14
446	0.13
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.11
457	0.16
458	0.17
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.17
463	0.21
464	0.2
465	0.19
466	0.23
467	0.23
468	0.24
469	0.27
470	0.28
471	0.26
472	0.28
473	0.26
474	0.25
475	0.31
476	0.36
477	0.38
478	0.44
479	0.42
480	0.43
481	0.4
482	0.4
483	0.4
484	0.39
485	0.4
486	0.35
487	0.35
488	0.33
489	0.34
490	0.35
491	0.31
492	0.28
493	0.25
494	0.27
495	0.28
496	0.29
497	0.29
498	0.29
499	0.32
500	0.42
501	0.44
502	0.45
503	0.46
504	0.51
505	0.58
506	0.61
507	0.61
508	0.6
509	0.65
510	0.67
511	0.67
512	0.61
513	0.56
514	0.53
515	0.51
516	0.51
517	0.48
518	0.48
519	0.52
520	0.56
521	0.6
522	0.62
523	0.59
524	0.52
525	0.46
526	0.4
527	0.32
528	0.25
529	0.24
530	0.19
531	0.17
532	0.18
533	0.2
534	0.23
535	0.3
536	0.35
537	0.37
538	0.45
539	0.52
540	0.6
541	0.67
542	0.74
543	0.77
544	0.82
545	0.84
546	0.84
547	0.82
548	0.82
549	0.76
550	0.69
551	0.6
552	0.53
553	0.47
554	0.45
555	0.41
556	0.34
557	0.31
558	0.32
559	0.34
560	0.31
561	0.33
562	0.29
563	0.34
564	0.33
565	0.37
566	0.41
567	0.44
568	0.48
569	0.45
570	0.44
571	0.4
572	0.42
573	0.39
574	0.34
575	0.32
576	0.3
577	0.29
578	0.26
579	0.24
580	0.21
581	0.16
582	0.14
583	0.11
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.09
590	0.09
591	0.13
592	0.15
593	0.18
594	0.23
595	0.25
596	0.26
597	0.33
598	0.37
599	0.4
600	0.47
601	0.51
602	0.54
603	0.6
604	0.66
605	0.61
606	0.59
607	0.52
608	0.47
609	0.47
610	0.41
611	0.37
612	0.35
613	0.36
614	0.36
615	0.39
616	0.38
617	0.38
618	0.39
619	0.37
620	0.31
621	0.28
622	0.27
623	0.23
624	0.2
625	0.13
626	0.12
627	0.1
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.11
632	0.11
633	0.13
634	0.15
635	0.21
636	0.21
637	0.2
638	0.26
639	0.3
640	0.32
641	0.32
642	0.3
643	0.26
644	0.33
645	0.34
646	0.28
647	0.26
648	0.25
649	0.28
650	0.3
651	0.3
652	0.23
653	0.28
654	0.3
655	0.28
656	0.28
657	0.23
658	0.2
659	0.23
660	0.3
661	0.34
662	0.39
663	0.42
664	0.49
665	0.58
666	0.59
667	0.59
668	0.56
669	0.55
670	0.53
671	0.56
672	0.55
673	0.46
674	0.46
675	0.42
676	0.37
677	0.32
678	0.31
679	0.29
680	0.26
681	0.31
682	0.37
683	0.39
684	0.4

A0A0D2B6H1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer