Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O13856

Protein Details
Accession O13856    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-71ISLVEQWSTKRHKKSCRNISVNESGHydrophilic
331-356SSDSEFSSPKKKKKVGNQGKKPLGTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-351KKKKKVGNQGKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.833, cyto 9, cyto_mito 6.165
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR017422  WDR55  
Gene Ontology GO:0031080  C:nuclear pore outer ring  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MGGTINAAIKQKFENEIFDLACFGENQVLLGFSNGRVSSYQYDVAQISLVEQWSTKRHKKSCRNISVNESGTEFISVGSDGVLKIADTSTGRVSSKWIVDKNKEISPYSVVQWIENDMVFATGDDNGCVSVWDKRTEGGIIHTHNDHIDYISSISPFEERYFVATSGDGVLSVIDARNFKKPILSEEQDEEMTCGAFTRDQHSKKKFAVGTASGVITLFTKGDWGDHTDRILSPIRSHDFSIETITRADSDSLYVGGSDGCIRLLHILPNKYERIIGQHSSRSTVDAVDVTTEGNFLVSCSGTELAFWPVDQKEGDESSSSDNLDSDEDSSSDSEFSSPKKKKKVGNQGKKPLGTDFFDGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.33
4 0.31
5 0.29
6 0.26
7 0.21
8 0.2
9 0.15
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.11
18 0.11
19 0.09
20 0.14
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.18
25 0.2
26 0.23
27 0.25
28 0.21
29 0.24
30 0.23
31 0.22
32 0.19
33 0.15
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.2
41 0.29
42 0.36
43 0.44
44 0.52
45 0.62
46 0.73
47 0.81
48 0.85
49 0.87
50 0.86
51 0.81
52 0.81
53 0.79
54 0.7
55 0.6
56 0.5
57 0.4
58 0.32
59 0.28
60 0.2
61 0.11
62 0.09
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.18
81 0.2
82 0.24
83 0.28
84 0.32
85 0.36
86 0.4
87 0.47
88 0.48
89 0.48
90 0.46
91 0.42
92 0.37
93 0.34
94 0.32
95 0.26
96 0.26
97 0.23
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.1
118 0.12
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.17
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.13
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.07
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.2
170 0.27
171 0.27
172 0.24
173 0.25
174 0.27
175 0.25
176 0.24
177 0.19
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.06
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.1
186 0.18
187 0.23
188 0.32
189 0.36
190 0.41
191 0.41
192 0.48
193 0.44
194 0.39
195 0.39
196 0.32
197 0.3
198 0.26
199 0.25
200 0.18
201 0.16
202 0.14
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.2
218 0.23
219 0.18
220 0.17
221 0.22
222 0.25
223 0.25
224 0.25
225 0.24
226 0.21
227 0.21
228 0.25
229 0.19
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.09
252 0.15
253 0.2
254 0.22
255 0.25
256 0.3
257 0.31
258 0.29
259 0.29
260 0.24
261 0.25
262 0.27
263 0.29
264 0.29
265 0.33
266 0.33
267 0.36
268 0.36
269 0.31
270 0.26
271 0.22
272 0.19
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.17
301 0.18
302 0.2
303 0.17
304 0.18
305 0.21
306 0.23
307 0.22
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.16
324 0.26
325 0.34
326 0.42
327 0.52
328 0.59
329 0.67
330 0.76
331 0.83
332 0.84
333 0.86
334 0.89
335 0.89
336 0.91
337 0.86
338 0.77
339 0.72
340 0.65
341 0.58