Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HE05

Protein Details
Accession Q9HE05    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51NIAPEPKKPDLKKRFIGSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10, plas 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG spo:SPAC20H4.10  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDLEKIRLKRLAKLQQTNSEANSSKEPKESNIAPEPKKPDLKKRFIGSKATTSNSEQKEISPPVTSGAPKHRLFSKDEWMHFITCQALNITLSETDSSKYYLEGFKKDLEEEGSPLLFNENNVDSALLSRLSTTGNNTFSYLLQSWSFLYQYKKRLPKDENQDFKIHYLSLLKSLLVSYAGIVVMLPDTFNSETIDLAEVLIGAEGIPLEFLSEFVQRFEHENLDELFIPVLESLSLKIGLMNVDTVQMNVMQIILQLVSLKPIALLLPKLPSWNPTNNAGEIEYKTFLGRISSLSVFTQDVASRYFSNSTERSAQNISSSISSLKLTMSTYQDVLFQIFNTLIRTSTSLRESVLDFFAMVVNANHKRQSIQVNHFDITSDACMLNFSHVLSRLSEPFLDIGCSKIDRVQVEYFRRNPRVDIKEETKLNADQKASESFYSKPAEGSNNFISDIFFLNLAFHHYGVNATFKALEQLVQSIRDSEKLKERLETEQQNMSGSFQATRLTAQLSRLDQRLDLDRSFVHCYEIMLTQTSDTSRSFSFLNFVAIWLSRLADGQSSTYPKMPLSLPFNENAPEAFKCLPEYFIETITDYMLSLFKTSSSTLTLHSLEPLCEFCVSFLTQANYIKNPYLRAKLAEILYFGVQTHVGRSELLLDVVRTSKVATRWLLPALMAFYIEIESTGQSTQFYDKFNIRFYICEVFRTIWKQPAYFGKLEQEQKTNLPFFVKFVALMLNDATYLLDEALLKLTEIHNLQSLLADAISNSNSNQNVQESQSNLAAAERQASTYCQLGNETIFMLKLFTSSIPKAFCAVEIVDRLAAMLNYNLQALCGPKCSNLKVEDPTKYHFNAKTLLSIIFDVYLNLCNEPAFVEAVAHDGRSYSKEIFERATSIMTKHNLKSSFDIEAIKEFVNRVEAFRLQEATEEEDMGDIPDYFLDPLMFTIMKDPVVLPRSGISIDRSTIKAHLLSDATDPFNRTPLTLDDVTPNDTLREEINTFLKSKRNKHSRNSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.72
3 0.74
4 0.78
5 0.74
6 0.66
7 0.63
8 0.54
9 0.47
10 0.48
11 0.44
12 0.41
13 0.42
14 0.42
15 0.38
16 0.45
17 0.45
18 0.44
19 0.49
20 0.55
21 0.53
22 0.59
23 0.62
24 0.63
25 0.69
26 0.68
27 0.69
28 0.7
29 0.76
30 0.77
31 0.79
32 0.81
33 0.77
34 0.8
35 0.75
36 0.74
37 0.7
38 0.65
39 0.6
40 0.56
41 0.59
42 0.53
43 0.51
44 0.42
45 0.38
46 0.43
47 0.43
48 0.39
49 0.32
50 0.29
51 0.27
52 0.31
53 0.3
54 0.28
55 0.34
56 0.41
57 0.39
58 0.43
59 0.47
60 0.46
61 0.51
62 0.52
63 0.53
64 0.53
65 0.54
66 0.56
67 0.52
68 0.5
69 0.44
70 0.39
71 0.33
72 0.25
73 0.24
74 0.19
75 0.18
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.21
90 0.24
91 0.27
92 0.29
93 0.32
94 0.34
95 0.34
96 0.33
97 0.3
98 0.27
99 0.25
100 0.25
101 0.21
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.14
106 0.13
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.16
122 0.2
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.27
129 0.23
130 0.19
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.18
135 0.19
136 0.17
137 0.23
138 0.28
139 0.36
140 0.44
141 0.52
142 0.56
143 0.64
144 0.67
145 0.69
146 0.74
147 0.76
148 0.76
149 0.71
150 0.7
151 0.62
152 0.57
153 0.5
154 0.39
155 0.3
156 0.25
157 0.22
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.12
165 0.11
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.06
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.16
207 0.18
208 0.19
209 0.16
210 0.19
211 0.19
212 0.21
213 0.2
214 0.17
215 0.15
216 0.12
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.12
258 0.15
259 0.15
260 0.18
261 0.21
262 0.27
263 0.28
264 0.31
265 0.33
266 0.32
267 0.32
268 0.3
269 0.28
270 0.23
271 0.23
272 0.18
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.15
296 0.19
297 0.19
298 0.21
299 0.26
300 0.25
301 0.27
302 0.27
303 0.27
304 0.23
305 0.23
306 0.21
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.12
335 0.16
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.12
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.1
351 0.13
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.2
357 0.28
358 0.31
359 0.35
360 0.42
361 0.44
362 0.44
363 0.43
364 0.4
365 0.32
366 0.25
367 0.18
368 0.11
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.08
377 0.1
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.13
395 0.13
396 0.17
397 0.2
398 0.26
399 0.32
400 0.38
401 0.42
402 0.46
403 0.5
404 0.46
405 0.45
406 0.48
407 0.46
408 0.45
409 0.45
410 0.42
411 0.44
412 0.44
413 0.42
414 0.36
415 0.33
416 0.31
417 0.29
418 0.24
419 0.19
420 0.2
421 0.21
422 0.2
423 0.18
424 0.18
425 0.15
426 0.2
427 0.2
428 0.19
429 0.16
430 0.17
431 0.2
432 0.19
433 0.23
434 0.2
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.17
439 0.14
440 0.14
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.06
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.14
469 0.16
470 0.16
471 0.23
472 0.27
473 0.27
474 0.28
475 0.3
476 0.3
477 0.35
478 0.37
479 0.31
480 0.3
481 0.29
482 0.28
483 0.26
484 0.22
485 0.16
486 0.13
487 0.11
488 0.08
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.13
497 0.14
498 0.16
499 0.17
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.19
504 0.19
505 0.17
506 0.16
507 0.15
508 0.18
509 0.2
510 0.19
511 0.15
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.14
516 0.11
517 0.1
518 0.09
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.11
530 0.1
531 0.12
532 0.1
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.1
537 0.08
538 0.08
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.11
547 0.12
548 0.14
549 0.14
550 0.13
551 0.15
552 0.14
553 0.16
554 0.19
555 0.22
556 0.21
557 0.21
558 0.22
559 0.21
560 0.2
561 0.17
562 0.14
563 0.1
564 0.12
565 0.12
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.11
571 0.16
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.13
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.15
593 0.16
594 0.14
595 0.16
596 0.16
597 0.14
598 0.14
599 0.13
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.07
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.11
608 0.11
609 0.13
610 0.16
611 0.18
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.18
616 0.21
617 0.23
618 0.24
619 0.24
620 0.24
621 0.25
622 0.27
623 0.27
624 0.23
625 0.2
626 0.17
627 0.16
628 0.14
629 0.12
630 0.09
631 0.08
632 0.07
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.09
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.07
647 0.08
648 0.1
649 0.12
650 0.16
651 0.17
652 0.18
653 0.2
654 0.21
655 0.21
656 0.17
657 0.16
658 0.13
659 0.11
660 0.09
661 0.07
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.1
674 0.12
675 0.14
676 0.16
677 0.21
678 0.23
679 0.25
680 0.27
681 0.24
682 0.23
683 0.24
684 0.29
685 0.25
686 0.24
687 0.24
688 0.22
689 0.25
690 0.28
691 0.28
692 0.26
693 0.28
694 0.26
695 0.28
696 0.35
697 0.37
698 0.34
699 0.33
700 0.31
701 0.36
702 0.42
703 0.41
704 0.36
705 0.33
706 0.35
707 0.38
708 0.34
709 0.28
710 0.26
711 0.23
712 0.21
713 0.21
714 0.19
715 0.14
716 0.13
717 0.15
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.07
725 0.05
726 0.05
727 0.04
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.08
735 0.08
736 0.11
737 0.12
738 0.12
739 0.13
740 0.13
741 0.14
742 0.13
743 0.13
744 0.1
745 0.09
746 0.08
747 0.06
748 0.07
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.11
753 0.12
754 0.13
755 0.15
756 0.16
757 0.17
758 0.19
759 0.22
760 0.19
761 0.21
762 0.21
763 0.19
764 0.17
765 0.15
766 0.14
767 0.11
768 0.13
769 0.11
770 0.11
771 0.11
772 0.13
773 0.14
774 0.14
775 0.15
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.12
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.09
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.08
790 0.13
791 0.14
792 0.18
793 0.19
794 0.2
795 0.21
796 0.21
797 0.19
798 0.17
799 0.16
800 0.16
801 0.16
802 0.17
803 0.15
804 0.14
805 0.14
806 0.12
807 0.11
808 0.08
809 0.07
810 0.08
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.08
815 0.09
816 0.11
817 0.12
818 0.14
819 0.15
820 0.19
821 0.24
822 0.26
823 0.3
824 0.32
825 0.36
826 0.39
827 0.45
828 0.47
829 0.46
830 0.48
831 0.47
832 0.46
833 0.48
834 0.44
835 0.4
836 0.37
837 0.35
838 0.35
839 0.32
840 0.3
841 0.24
842 0.22
843 0.2
844 0.16
845 0.15
846 0.11
847 0.1
848 0.13
849 0.13
850 0.12
851 0.12
852 0.11
853 0.11
854 0.11
855 0.11
856 0.09
857 0.08
858 0.08
859 0.08
860 0.11
861 0.12
862 0.11
863 0.09
864 0.09
865 0.11
866 0.13
867 0.16
868 0.14
869 0.19
870 0.22
871 0.24
872 0.27
873 0.27
874 0.27
875 0.25
876 0.27
877 0.23
878 0.23
879 0.26
880 0.28
881 0.33
882 0.33
883 0.39
884 0.38
885 0.4
886 0.43
887 0.4
888 0.38
889 0.34
890 0.34
891 0.28
892 0.28
893 0.27
894 0.23
895 0.21
896 0.18
897 0.17
898 0.2
899 0.2
900 0.19
901 0.21
902 0.24
903 0.26
904 0.28
905 0.29
906 0.23
907 0.25
908 0.25
909 0.26
910 0.24
911 0.21
912 0.18
913 0.17
914 0.16
915 0.14
916 0.13
917 0.08
918 0.07
919 0.07
920 0.08
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.07
925 0.08
926 0.11
927 0.11
928 0.1
929 0.13
930 0.14
931 0.14
932 0.15
933 0.15
934 0.19
935 0.23
936 0.23
937 0.2
938 0.2
939 0.22
940 0.22
941 0.23
942 0.21
943 0.2
944 0.23
945 0.25
946 0.25
947 0.25
948 0.26
949 0.27
950 0.25
951 0.22
952 0.24
953 0.22
954 0.22
955 0.24
956 0.26
957 0.27
958 0.26
959 0.29
960 0.25
961 0.29
962 0.28
963 0.24
964 0.24
965 0.24
966 0.29
967 0.27
968 0.27
969 0.28
970 0.3
971 0.33
972 0.31
973 0.28
974 0.22
975 0.21
976 0.2
977 0.16
978 0.19
979 0.17
980 0.2
981 0.24
982 0.25
983 0.27
984 0.3
985 0.37
986 0.4
987 0.48
988 0.56
989 0.62
990 0.69