Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YDM9

Protein Details
Accession A0A0D1YDM9    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-311ASLWRPPPPHHRRRLEHLKKVKNPANBasic
452-479ERELKEKERREAKHQRRMARKRALDEDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-306RPPPPHHRRRLEHLKKV
456-473KEKERREAKHQRRMARKR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 7, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008011  Complex1_LYR_dom  
IPR046896  Cup1-like_N  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Pfam View protein in Pfam  
PF05347  Complex1_LYR  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50127  UBC_2  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MGAKVPRNFRLLEELEKGEKGLGAEACSYGLADGDDLMMSNWNGTILGPPHSAHENRIYSVNIHCGEQYPDVPPTIQFVSRVNLPCVDQKTGKVDPSKLPCLANWKRDYTMETILIELRRGSGQWEARDLFRRASAKFPVPTDRGVESIANDGVSLFDGVSCQQTRNVRMPRQFAPKRSGVHRLGCLSLYRALLRECGRLSTALGQKAAHGTKGTLRSIVRYRFDKDRDILSPPQVANGITAGYCFLDLLRSCNAGSSQSLARFTQTLESMSIQAQDTATRRAKFASLWRPPPPHHRRRLEHLKKVKNPANYAHDPSDPRIFHHPAPLSSIKSGVRKVPNLIVTQGIPVLKYPGPQPVLINRVVKNKIKWGIKTFNQHKQLEDQRHLAECEDEWDDIVQTRHGVKKGVEEAEEGKWVQSIRDADAHLEKRLAEQMRRNTELSGKFHEIVVAERELKEKERREAKHQRRMARKRALDEDAEMKTTQEEREPSTGDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.4
4 0.37
5 0.29
6 0.26
7 0.2
8 0.2
9 0.17
10 0.16
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.12
33 0.12
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.2
38 0.26
39 0.27
40 0.26
41 0.34
42 0.32
43 0.32
44 0.34
45 0.33
46 0.29
47 0.31
48 0.34
49 0.26
50 0.24
51 0.24
52 0.23
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.19
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.2
67 0.26
68 0.29
69 0.27
70 0.26
71 0.27
72 0.32
73 0.34
74 0.36
75 0.31
76 0.31
77 0.36
78 0.37
79 0.4
80 0.39
81 0.39
82 0.42
83 0.48
84 0.5
85 0.46
86 0.43
87 0.4
88 0.46
89 0.49
90 0.5
91 0.47
92 0.46
93 0.45
94 0.46
95 0.47
96 0.41
97 0.39
98 0.32
99 0.28
100 0.25
101 0.26
102 0.24
103 0.22
104 0.17
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.16
110 0.2
111 0.21
112 0.26
113 0.26
114 0.29
115 0.36
116 0.36
117 0.3
118 0.31
119 0.33
120 0.29
121 0.33
122 0.35
123 0.35
124 0.36
125 0.38
126 0.39
127 0.38
128 0.38
129 0.36
130 0.32
131 0.27
132 0.25
133 0.23
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.14
151 0.18
152 0.22
153 0.31
154 0.38
155 0.41
156 0.46
157 0.51
158 0.53
159 0.6
160 0.61
161 0.56
162 0.54
163 0.53
164 0.52
165 0.51
166 0.53
167 0.47
168 0.46
169 0.45
170 0.41
171 0.37
172 0.34
173 0.3
174 0.23
175 0.22
176 0.18
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.16
188 0.19
189 0.22
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.24
195 0.23
196 0.17
197 0.13
198 0.12
199 0.16
200 0.2
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.22
205 0.28
206 0.32
207 0.32
208 0.3
209 0.34
210 0.38
211 0.4
212 0.4
213 0.36
214 0.35
215 0.33
216 0.35
217 0.33
218 0.28
219 0.29
220 0.24
221 0.23
222 0.2
223 0.18
224 0.14
225 0.12
226 0.1
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.17
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.29
273 0.33
274 0.35
275 0.4
276 0.46
277 0.49
278 0.5
279 0.59
280 0.61
281 0.61
282 0.64
283 0.67
284 0.66
285 0.72
286 0.81
287 0.8
288 0.8
289 0.8
290 0.8
291 0.77
292 0.82
293 0.78
294 0.72
295 0.65
296 0.61
297 0.6
298 0.54
299 0.51
300 0.45
301 0.43
302 0.39
303 0.38
304 0.39
305 0.31
306 0.3
307 0.32
308 0.33
309 0.3
310 0.36
311 0.36
312 0.29
313 0.35
314 0.35
315 0.31
316 0.28
317 0.3
318 0.26
319 0.27
320 0.28
321 0.29
322 0.31
323 0.31
324 0.34
325 0.36
326 0.36
327 0.34
328 0.33
329 0.27
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.15
334 0.11
335 0.1
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.19
341 0.2
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.28
346 0.31
347 0.35
348 0.31
349 0.37
350 0.42
351 0.45
352 0.42
353 0.46
354 0.49
355 0.51
356 0.53
357 0.53
358 0.56
359 0.57
360 0.65
361 0.65
362 0.67
363 0.7
364 0.66
365 0.59
366 0.6
367 0.62
368 0.6
369 0.57
370 0.52
371 0.46
372 0.47
373 0.46
374 0.38
375 0.3
376 0.22
377 0.2
378 0.18
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.11
386 0.12
387 0.16
388 0.2
389 0.21
390 0.24
391 0.22
392 0.29
393 0.35
394 0.36
395 0.33
396 0.3
397 0.32
398 0.31
399 0.32
400 0.25
401 0.18
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.21
409 0.22
410 0.23
411 0.32
412 0.34
413 0.3
414 0.29
415 0.27
416 0.25
417 0.32
418 0.34
419 0.31
420 0.37
421 0.46
422 0.53
423 0.56
424 0.55
425 0.49
426 0.52
427 0.53
428 0.49
429 0.47
430 0.44
431 0.41
432 0.4
433 0.4
434 0.33
435 0.29
436 0.28
437 0.24
438 0.21
439 0.21
440 0.24
441 0.25
442 0.3
443 0.36
444 0.38
445 0.44
446 0.52
447 0.56
448 0.64
449 0.73
450 0.78
451 0.8
452 0.81
453 0.81
454 0.83
455 0.88
456 0.88
457 0.87
458 0.84
459 0.81
460 0.81
461 0.76
462 0.68
463 0.62
464 0.58
465 0.5
466 0.45
467 0.38
468 0.3
469 0.28
470 0.28
471 0.25
472 0.25
473 0.25
474 0.28
475 0.33