Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Z1M6

Protein Details
Accession A0A0D1Z1M6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-270PPPPPPSSSPQKRHNRMPSQPQQRAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11, nucl 8, mito 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTSLPRDKPGGASKGIFEHSNPFNEVAKARKLQAFHDDEQEIIDFEDTYDGLGDQLEETGDDFNDDTFGGGAEGGSGRGTGKDFDFFGKTAQVSDAFEQEHVRYSLQHPGAPVAAPTQAPKPKRTGYEKYQDPGYIPDIQAKSGAWSSKAQVAPQATEDRISTARPVAPAPAPVAEPPKMMSLEEVEAALLAQQQQQQQQQLPPFPMHQPYQFPPQHMQPPPPQPFPQMPPPGPVHQPPPPPPPSSSPQKRHNRMPSQPQQRAQQPLQILQNPNRARHLPQPSLDRVPPMGPGGHPVITHPQQLMDLSEEQRRAYLEEDAKRAKRNHKIFILSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNSADADPEAALNEDFYYQVYSQIRGAPRQHPTQPLGHFAQTYLFQTGNRVRGRKQQIVADNHMQRMQQQVQRAVEAAKLKPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIRRQENTDGRPTTSKEGAPSDRKTILKNIEAVYSTLMRLEDNVRQMPPPPTEGDADSIQTQLEWRQTMQQLNAKLWQDLKILEPIVPGSLVTHPFIAFLSFAKGKKAIPRVFHQIDQEQRVTILTMIVVHLDQLDVIRDARLAPGESQPSPAVREEIDLFSQTVMPCLMQYVSEAPINIIVGLLGLLIDHTNVVQVAHTKIGVAMLTMLLTRAEIVKESGGVSDEEWQQWTTLYNRLFDMLEPVLGSIFPAAVNAGDDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIGVKDRVMETVQQSKTLPAEMSSVRLGNVNLFMRAIGLDVEMLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.39
4 0.37
5 0.38
6 0.38
7 0.41
8 0.41
9 0.35
10 0.28
11 0.3
12 0.3
13 0.33
14 0.33
15 0.3
16 0.3
17 0.33
18 0.34
19 0.33
20 0.36
21 0.36
22 0.38
23 0.39
24 0.38
25 0.39
26 0.46
27 0.48
28 0.43
29 0.47
30 0.42
31 0.38
32 0.38
33 0.35
34 0.25
35 0.18
36 0.16
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.2
85 0.19
86 0.18
87 0.19
88 0.21
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.2
98 0.28
99 0.28
100 0.29
101 0.25
102 0.25
103 0.26
104 0.24
105 0.22
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.15
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.32
114 0.38
115 0.42
116 0.5
117 0.57
118 0.57
119 0.6
120 0.67
121 0.69
122 0.65
123 0.63
124 0.55
125 0.48
126 0.42
127 0.37
128 0.31
129 0.26
130 0.3
131 0.27
132 0.26
133 0.26
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.22
138 0.17
139 0.18
140 0.2
141 0.26
142 0.27
143 0.25
144 0.26
145 0.27
146 0.26
147 0.28
148 0.3
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.21
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.11
187 0.14
188 0.19
189 0.23
190 0.26
191 0.29
192 0.33
193 0.36
194 0.36
195 0.36
196 0.33
197 0.32
198 0.31
199 0.32
200 0.3
201 0.29
202 0.3
203 0.31
204 0.4
205 0.39
206 0.39
207 0.38
208 0.41
209 0.47
210 0.44
211 0.46
212 0.44
213 0.52
214 0.55
215 0.57
216 0.52
217 0.48
218 0.5
219 0.49
220 0.51
221 0.48
222 0.43
223 0.43
224 0.45
225 0.45
226 0.43
227 0.41
228 0.36
229 0.35
230 0.41
231 0.41
232 0.45
233 0.46
234 0.45
235 0.46
236 0.46
237 0.46
238 0.5
239 0.54
240 0.55
241 0.61
242 0.69
243 0.73
244 0.77
245 0.81
246 0.8
247 0.78
248 0.8
249 0.8
250 0.8
251 0.81
252 0.76
253 0.72
254 0.68
255 0.68
256 0.58
257 0.52
258 0.44
259 0.41
260 0.41
261 0.4
262 0.38
263 0.36
264 0.44
265 0.42
266 0.42
267 0.41
268 0.38
269 0.36
270 0.41
271 0.44
272 0.4
273 0.41
274 0.45
275 0.46
276 0.49
277 0.46
278 0.38
279 0.31
280 0.27
281 0.24
282 0.19
283 0.16
284 0.11
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.19
291 0.2
292 0.21
293 0.18
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.16
302 0.17
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.15
307 0.13
308 0.17
309 0.2
310 0.23
311 0.28
312 0.32
313 0.34
314 0.39
315 0.43
316 0.45
317 0.49
318 0.52
319 0.54
320 0.54
321 0.59
322 0.56
323 0.6
324 0.6
325 0.5
326 0.45
327 0.38
328 0.33
329 0.26
330 0.23
331 0.17
332 0.12
333 0.14
334 0.13
335 0.16
336 0.15
337 0.17
338 0.18
339 0.16
340 0.17
341 0.2
342 0.23
343 0.23
344 0.25
345 0.23
346 0.23
347 0.22
348 0.2
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.06
370 0.06
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.16
376 0.17
377 0.19
378 0.23
379 0.24
380 0.27
381 0.31
382 0.33
383 0.33
384 0.35
385 0.36
386 0.34
387 0.33
388 0.31
389 0.27
390 0.24
391 0.2
392 0.19
393 0.14
394 0.14
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.13
399 0.16
400 0.22
401 0.24
402 0.25
403 0.25
404 0.34
405 0.42
406 0.43
407 0.42
408 0.41
409 0.45
410 0.49
411 0.51
412 0.5
413 0.45
414 0.4
415 0.39
416 0.33
417 0.27
418 0.27
419 0.28
420 0.23
421 0.25
422 0.28
423 0.27
424 0.28
425 0.28
426 0.22
427 0.2
428 0.2
429 0.18
430 0.22
431 0.26
432 0.28
433 0.34
434 0.4
435 0.45
436 0.45
437 0.47
438 0.43
439 0.44
440 0.45
441 0.42
442 0.36
443 0.28
444 0.26
445 0.22
446 0.18
447 0.12
448 0.09
449 0.11
450 0.11
451 0.19
452 0.22
453 0.23
454 0.26
455 0.28
456 0.31
457 0.31
458 0.38
459 0.37
460 0.45
461 0.51
462 0.53
463 0.56
464 0.55
465 0.54
466 0.52
467 0.49
468 0.47
469 0.4
470 0.38
471 0.35
472 0.35
473 0.34
474 0.31
475 0.28
476 0.23
477 0.27
478 0.31
479 0.34
480 0.35
481 0.35
482 0.37
483 0.38
484 0.37
485 0.38
486 0.37
487 0.33
488 0.34
489 0.31
490 0.28
491 0.27
492 0.26
493 0.21
494 0.17
495 0.14
496 0.12
497 0.11
498 0.08
499 0.09
500 0.11
501 0.13
502 0.16
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.22
507 0.25
508 0.24
509 0.23
510 0.2
511 0.2
512 0.21
513 0.22
514 0.22
515 0.18
516 0.18
517 0.16
518 0.14
519 0.12
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.17
527 0.2
528 0.23
529 0.27
530 0.29
531 0.28
532 0.29
533 0.34
534 0.3
535 0.28
536 0.26
537 0.25
538 0.21
539 0.2
540 0.2
541 0.18
542 0.17
543 0.16
544 0.15
545 0.13
546 0.12
547 0.11
548 0.09
549 0.07
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.08
559 0.07
560 0.11
561 0.14
562 0.15
563 0.17
564 0.18
565 0.2
566 0.27
567 0.36
568 0.36
569 0.37
570 0.42
571 0.49
572 0.51
573 0.52
574 0.49
575 0.46
576 0.47
577 0.48
578 0.43
579 0.33
580 0.3
581 0.28
582 0.24
583 0.17
584 0.12
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.16
606 0.2
607 0.2
608 0.22
609 0.23
610 0.22
611 0.23
612 0.22
613 0.19
614 0.15
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.18
619 0.17
620 0.16
621 0.15
622 0.18
623 0.15
624 0.13
625 0.11
626 0.1
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.07
631 0.08
632 0.09
633 0.11
634 0.12
635 0.12
636 0.11
637 0.12
638 0.12
639 0.11
640 0.08
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.04
645 0.03
646 0.02
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.04
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.08
657 0.1
658 0.11
659 0.11
660 0.11
661 0.11
662 0.12
663 0.11
664 0.08
665 0.07
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.05
671 0.05
672 0.06
673 0.07
674 0.07
675 0.08
676 0.09
677 0.1
678 0.1
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.11
684 0.15
685 0.17
686 0.17
687 0.18
688 0.18
689 0.17
690 0.17
691 0.19
692 0.16
693 0.2
694 0.21
695 0.21
696 0.21
697 0.23
698 0.23
699 0.21
700 0.24
701 0.17
702 0.16
703 0.14
704 0.14
705 0.12
706 0.11
707 0.11
708 0.06
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.05
729 0.04
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.06
734 0.09
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.14
739 0.15
740 0.19
741 0.22
742 0.21
743 0.24
744 0.27
745 0.28
746 0.3
747 0.29
748 0.27
749 0.26
750 0.27
751 0.27
752 0.32
753 0.31
754 0.32
755 0.32
756 0.33
757 0.33
758 0.32
759 0.27
760 0.18
761 0.23
762 0.21
763 0.24
764 0.23
765 0.22
766 0.2
767 0.22
768 0.21
769 0.18
770 0.24
771 0.22
772 0.2
773 0.2
774 0.19
775 0.17
776 0.17
777 0.15
778 0.09
779 0.08