Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O13788

Protein Details
Accession O13788    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-500KLYMKRECQNARKKIEQQLQSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR041984  Rsc8/Ssr1/Ssr2_ZZ  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
IPR032451  SMARCC_C  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR000433  Znf_ZZ  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
GO:1905168  P:positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPAC17G6.10  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PF04433  SWIRM  
PF16495  SWIRM-assoc_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51293  SANT  
PS50934  SWIRM  
PS50135  ZF_ZZ_2  
CDD cd00167  SANT  
cd02336  ZZ_RSC8  
Amino Acid Sequences MSNVTENKHDLHENGVPDSAQPMELDVSKKEDTEPEVRDEAKEFLLSQLPQVEVPEWAQWFDFSKVHEIEKKQNPEFFDGKNTSKTPEVYKEYRDFMISTFRLNSKVYLTFTACRRNLAGDVCAVLRVHRFLEQWGLINYNVNPDTRPSKIGPPSTSHFQILADTPRGLVPLLPPPSSSIPRSKAVTIEDPSIVRTNIYDPSLDDVLKGKGSTPNQKPSLSNLHENNIDQSDSPQHCYCCGNKFNESYYQSQTAQKYNVCISCYQQNRFPSPTTIADYKEVAIQNKIEDDDTWTAQELVLLSEGVEMYSDDWAKVASHVNTKSVEECILKFLNLPSSDKALFKMDKVHTNPVVDSLQGKNPILSVVSFLAKMVPPSSFTQKSSAKEEESDKVKGESVYPKPESESYDVEMNGKSLEDSDSLSELYLTNEEKKMASIIKDSVNVQIKLIESKLSHFDYLDQHIRLKSQELDAFAQATYREKLYMKRECQNARKKIEQQLQSKDTAANGLPVQSSAETSVIPASSMSPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.22
5 0.23
6 0.18
7 0.14
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.15
12 0.17
13 0.17
14 0.22
15 0.22
16 0.23
17 0.23
18 0.25
19 0.27
20 0.32
21 0.34
22 0.34
23 0.37
24 0.38
25 0.37
26 0.36
27 0.33
28 0.26
29 0.24
30 0.19
31 0.18
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.2
38 0.21
39 0.19
40 0.15
41 0.17
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.18
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.24
52 0.25
53 0.3
54 0.36
55 0.37
56 0.44
57 0.51
58 0.58
59 0.56
60 0.58
61 0.56
62 0.55
63 0.55
64 0.46
65 0.46
66 0.42
67 0.41
68 0.44
69 0.42
70 0.39
71 0.38
72 0.39
73 0.36
74 0.39
75 0.43
76 0.42
77 0.48
78 0.49
79 0.48
80 0.47
81 0.43
82 0.35
83 0.28
84 0.34
85 0.27
86 0.25
87 0.25
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.22
93 0.25
94 0.25
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.33
99 0.41
100 0.38
101 0.36
102 0.35
103 0.33
104 0.33
105 0.3
106 0.27
107 0.18
108 0.19
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.21
124 0.18
125 0.2
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.22
133 0.21
134 0.24
135 0.21
136 0.28
137 0.35
138 0.4
139 0.4
140 0.41
141 0.44
142 0.46
143 0.46
144 0.39
145 0.33
146 0.27
147 0.26
148 0.23
149 0.22
150 0.19
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.1
158 0.15
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.21
163 0.25
164 0.28
165 0.29
166 0.28
167 0.29
168 0.32
169 0.34
170 0.32
171 0.3
172 0.3
173 0.33
174 0.29
175 0.27
176 0.25
177 0.23
178 0.24
179 0.23
180 0.19
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.1
197 0.14
198 0.19
199 0.28
200 0.32
201 0.39
202 0.42
203 0.44
204 0.43
205 0.43
206 0.48
207 0.42
208 0.43
209 0.36
210 0.35
211 0.35
212 0.35
213 0.32
214 0.23
215 0.2
216 0.14
217 0.13
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.2
222 0.19
223 0.21
224 0.23
225 0.24
226 0.24
227 0.27
228 0.27
229 0.29
230 0.3
231 0.31
232 0.36
233 0.36
234 0.33
235 0.31
236 0.31
237 0.29
238 0.32
239 0.32
240 0.28
241 0.27
242 0.24
243 0.23
244 0.23
245 0.24
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.22
250 0.27
251 0.26
252 0.28
253 0.29
254 0.32
255 0.34
256 0.33
257 0.28
258 0.27
259 0.27
260 0.26
261 0.24
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.19
267 0.18
268 0.16
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.1
303 0.11
304 0.17
305 0.18
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.21
310 0.19
311 0.19
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.18
320 0.18
321 0.2
322 0.17
323 0.2
324 0.22
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.21
329 0.19
330 0.26
331 0.26
332 0.32
333 0.35
334 0.4
335 0.38
336 0.38
337 0.37
338 0.32
339 0.3
340 0.22
341 0.21
342 0.17
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.17
347 0.16
348 0.16
349 0.14
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.11
362 0.15
363 0.22
364 0.23
365 0.25
366 0.31
367 0.35
368 0.38
369 0.42
370 0.42
371 0.36
372 0.37
373 0.39
374 0.39
375 0.38
376 0.36
377 0.31
378 0.28
379 0.28
380 0.25
381 0.25
382 0.27
383 0.29
384 0.35
385 0.36
386 0.35
387 0.36
388 0.38
389 0.38
390 0.34
391 0.32
392 0.26
393 0.27
394 0.27
395 0.26
396 0.24
397 0.2
398 0.16
399 0.13
400 0.1
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.15
416 0.16
417 0.16
418 0.17
419 0.18
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.21
424 0.24
425 0.26
426 0.26
427 0.31
428 0.35
429 0.33
430 0.3
431 0.29
432 0.27
433 0.27
434 0.27
435 0.23
436 0.16
437 0.19
438 0.25
439 0.25
440 0.24
441 0.22
442 0.25
443 0.26
444 0.32
445 0.36
446 0.32
447 0.33
448 0.33
449 0.34
450 0.32
451 0.32
452 0.28
453 0.27
454 0.29
455 0.29
456 0.31
457 0.3
458 0.3
459 0.26
460 0.24
461 0.19
462 0.19
463 0.17
464 0.15
465 0.17
466 0.19
467 0.26
468 0.34
469 0.44
470 0.47
471 0.53
472 0.61
473 0.68
474 0.76
475 0.79
476 0.79
477 0.77
478 0.8
479 0.79
480 0.8
481 0.8
482 0.79
483 0.77
484 0.78
485 0.74
486 0.67
487 0.61
488 0.52
489 0.44
490 0.39
491 0.3
492 0.24
493 0.21
494 0.2
495 0.19
496 0.18
497 0.19
498 0.16
499 0.16
500 0.14
501 0.14
502 0.12
503 0.12
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.11