Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74309

Protein Details
Accession O74309    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-443ASSPESKRRKCPKKFVARPPVPHPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000417  C:HIR complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0140861  P:DNA repair-dependent chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0140673  P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling  
GO:0045815  P:transcription initiation-coupled chromatin remodeling  
KEGG spo:SPBC15D4.03  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MHIFVPKLLENHQFSSISSSKDFVAVSAETNVYILSKDFFYPKSSEKRIIQSLNGHKTTHLSFDSPISCIRFTYDGSCLAVATEAGTFLYHSEKWDKAFQVLSGPAYEVCWSQQGHILATSWKQISIYVKDEGLRTETIVKKTEHADSNHQPAVSIEESKEAVESTSQSSEISFKLIKVIEGHHTFVGGLAFDPMGQFLASQSFDHTLKVWKLSTFGVEKSIAKPFEQMPTGNRFLRLSWSPDGAHIASVNAVNEGAYVIAIVQRDTWTYDINLVGHQGPLECATFNPYLYEDPFQKSIIASAAHDGCVSIWNTACARPMAVIHELSCSSFVDLQWSTSGFELYGVSLDGNLMLLQFEESEFGEKMDTIHYPDDLSYFNSSRSKAHVNKNAAADRTTSPTQGQPESPSKSILLRPPPSIASSPESKRRKCPKKFVARPPVPHPTSLYSQIRIGCPYLKPKLVISKSFGTLIVKNHNQLSLLKCTFSNLDGNDCSWFSYLPNAIVLANGTSVFWAVATEDSSIYIYSPAGRLLLPPVVVAATPCFLECCGDFLCCIVSTGLLYIWNIKNFEAIHSPVSTLPLFHSNFSVSKIARGPSIEQFFVTKQGHPVAIMSDGNAFAFIRDSSSWLRVSEGWWMIGSQYWGPLASESNEESPLGFLERCTDEEIIKAGRGRFLQRLVKALMLRQGYDNYEMLVSIRHLENRLMSSAKLDLEYDFRENLILYAKKIAEEGMKDKMDELCKELLGPLRIPHNGIDTVKVGNRLWSPTIAGNNKRNLLKDIIIHTAKYRDMQRITSQYSDLLRRSALL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.38
4 0.34
5 0.3
6 0.28
7 0.25
8 0.26
9 0.26
10 0.18
11 0.19
12 0.15
13 0.16
14 0.18
15 0.17
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.16
26 0.17
27 0.21
28 0.25
29 0.32
30 0.4
31 0.44
32 0.51
33 0.53
34 0.59
35 0.64
36 0.64
37 0.61
38 0.61
39 0.65
40 0.67
41 0.64
42 0.56
43 0.48
44 0.48
45 0.45
46 0.41
47 0.33
48 0.25
49 0.24
50 0.29
51 0.3
52 0.27
53 0.29
54 0.27
55 0.25
56 0.23
57 0.25
58 0.21
59 0.21
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.2
66 0.18
67 0.16
68 0.12
69 0.1
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.11
77 0.1
78 0.14
79 0.19
80 0.21
81 0.24
82 0.3
83 0.31
84 0.3
85 0.31
86 0.28
87 0.29
88 0.29
89 0.27
90 0.21
91 0.21
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.12
96 0.11
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.19
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.2
107 0.24
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.19
112 0.24
113 0.26
114 0.28
115 0.25
116 0.26
117 0.28
118 0.29
119 0.27
120 0.24
121 0.2
122 0.18
123 0.24
124 0.28
125 0.29
126 0.33
127 0.32
128 0.32
129 0.35
130 0.4
131 0.38
132 0.37
133 0.42
134 0.44
135 0.51
136 0.5
137 0.47
138 0.4
139 0.34
140 0.36
141 0.28
142 0.24
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.16
160 0.13
161 0.12
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.2
167 0.24
168 0.25
169 0.27
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.2
174 0.18
175 0.1
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.18
195 0.19
196 0.22
197 0.22
198 0.19
199 0.21
200 0.21
201 0.24
202 0.21
203 0.2
204 0.2
205 0.21
206 0.22
207 0.22
208 0.28
209 0.24
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.25
214 0.26
215 0.25
216 0.23
217 0.28
218 0.33
219 0.31
220 0.31
221 0.26
222 0.25
223 0.29
224 0.28
225 0.26
226 0.24
227 0.26
228 0.25
229 0.25
230 0.28
231 0.22
232 0.2
233 0.15
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.14
278 0.17
279 0.14
280 0.16
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.06
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.13
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.19
370 0.25
371 0.29
372 0.37
373 0.42
374 0.45
375 0.48
376 0.52
377 0.51
378 0.44
379 0.38
380 0.32
381 0.25
382 0.26
383 0.22
384 0.18
385 0.16
386 0.18
387 0.19
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.22
392 0.25
393 0.25
394 0.23
395 0.21
396 0.22
397 0.25
398 0.25
399 0.28
400 0.27
401 0.27
402 0.28
403 0.28
404 0.28
405 0.26
406 0.23
407 0.18
408 0.21
409 0.23
410 0.31
411 0.37
412 0.37
413 0.46
414 0.55
415 0.63
416 0.66
417 0.74
418 0.75
419 0.79
420 0.87
421 0.88
422 0.88
423 0.84
424 0.81
425 0.76
426 0.75
427 0.65
428 0.56
429 0.47
430 0.39
431 0.35
432 0.38
433 0.33
434 0.25
435 0.26
436 0.27
437 0.26
438 0.23
439 0.22
440 0.17
441 0.17
442 0.22
443 0.23
444 0.23
445 0.23
446 0.24
447 0.32
448 0.33
449 0.33
450 0.32
451 0.31
452 0.3
453 0.3
454 0.29
455 0.22
456 0.21
457 0.21
458 0.24
459 0.22
460 0.23
461 0.23
462 0.23
463 0.22
464 0.22
465 0.22
466 0.23
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.21
471 0.21
472 0.2
473 0.2
474 0.12
475 0.16
476 0.15
477 0.16
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.11
482 0.11
483 0.08
484 0.1
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.09
519 0.1
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.16
553 0.16
554 0.18
555 0.18
556 0.2
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.17
561 0.18
562 0.16
563 0.18
564 0.16
565 0.13
566 0.13
567 0.18
568 0.18
569 0.18
570 0.19
571 0.18
572 0.19
573 0.22
574 0.24
575 0.17
576 0.2
577 0.23
578 0.22
579 0.22
580 0.23
581 0.23
582 0.26
583 0.3
584 0.26
585 0.24
586 0.25
587 0.24
588 0.29
589 0.28
590 0.22
591 0.21
592 0.23
593 0.23
594 0.21
595 0.21
596 0.15
597 0.16
598 0.15
599 0.12
600 0.11
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.06
606 0.08
607 0.07
608 0.08
609 0.08
610 0.12
611 0.14
612 0.17
613 0.19
614 0.18
615 0.2
616 0.18
617 0.18
618 0.22
619 0.21
620 0.18
621 0.17
622 0.17
623 0.15
624 0.16
625 0.17
626 0.1
627 0.1
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.11
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.16
638 0.15
639 0.15
640 0.13
641 0.13
642 0.12
643 0.1
644 0.09
645 0.12
646 0.14
647 0.16
648 0.18
649 0.19
650 0.16
651 0.18
652 0.2
653 0.17
654 0.18
655 0.2
656 0.18
657 0.21
658 0.23
659 0.26
660 0.29
661 0.35
662 0.4
663 0.39
664 0.43
665 0.4
666 0.42
667 0.39
668 0.37
669 0.36
670 0.3
671 0.29
672 0.26
673 0.27
674 0.25
675 0.27
676 0.24
677 0.19
678 0.17
679 0.16
680 0.14
681 0.13
682 0.11
683 0.11
684 0.13
685 0.15
686 0.17
687 0.18
688 0.21
689 0.22
690 0.25
691 0.23
692 0.21
693 0.21
694 0.21
695 0.21
696 0.18
697 0.16
698 0.15
699 0.17
700 0.2
701 0.21
702 0.19
703 0.18
704 0.17
705 0.17
706 0.16
707 0.2
708 0.18
709 0.17
710 0.23
711 0.23
712 0.23
713 0.23
714 0.24
715 0.21
716 0.24
717 0.26
718 0.28
719 0.29
720 0.29
721 0.3
722 0.33
723 0.34
724 0.31
725 0.31
726 0.26
727 0.25
728 0.26
729 0.27
730 0.27
731 0.25
732 0.26
733 0.25
734 0.28
735 0.29
736 0.31
737 0.29
738 0.28
739 0.29
740 0.28
741 0.28
742 0.24
743 0.27
744 0.28
745 0.3
746 0.26
747 0.27
748 0.29
749 0.3
750 0.3
751 0.28
752 0.28
753 0.29
754 0.38
755 0.41
756 0.46
757 0.49
758 0.54
759 0.59
760 0.6
761 0.58
762 0.53
763 0.5
764 0.45
765 0.44
766 0.41
767 0.43
768 0.42
769 0.4
770 0.39
771 0.38
772 0.36
773 0.36
774 0.37
775 0.37
776 0.39
777 0.43
778 0.49
779 0.53
780 0.56
781 0.53
782 0.5
783 0.45
784 0.47
785 0.48
786 0.42
787 0.35