Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q10200

Protein Details
Accession Q10200    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-37KSYNMKKRPVIGTRRHFARKEBasic
51-78AGERKKYLQNQSYERRKQKNEHGNNLTLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 12.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPBC11C11.01  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKKNNERVNTNPSLISKSYNMKKRPVIGTRRHFARKEIESDSDDEDDIFLAGERKKYLQNQSYERRKQKNEHGNNLTLQEELLRHEAYEKNEEIANENDVDQVNLMKYFVHMDNISPVTTNGSLKESLRKYSSIIAVNIFSETGDLKKGIAIFQDLSDAEQAVQYLSNCKIDGRLISATITNHPKRLPNAEHLESSTKTKDESQDKDKLTKLDRAKLEWLIQGLNCEKGSIGNLLCFAVEHVNNHVEITDAFLKEFFNDQPTDDTKVYDDDYINERGEKKLSLIYLMNDILFNGISGTSLVWRYRFSFEPHVERLLDDLYLFSKRLGGRIKEDIFCKKVVKVIEVWKTWIAFQEETLERAWRNFSGNTPQSPQINSAALKVETKNSWTAISEETEGLQDDEEYNGIPVDVNELLNVEFISQIPMSTETSSSSSPQPTEERKAKFKPSFTQGTFVSKRMRMHAEDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.35
4 0.39
5 0.46
6 0.51
7 0.54
8 0.57
9 0.62
10 0.66
11 0.71
12 0.71
13 0.73
14 0.74
15 0.78
16 0.79
17 0.82
18 0.82
19 0.74
20 0.69
21 0.69
22 0.64
23 0.61
24 0.57
25 0.53
26 0.48
27 0.49
28 0.47
29 0.39
30 0.32
31 0.26
32 0.21
33 0.16
34 0.13
35 0.1
36 0.07
37 0.1
38 0.12
39 0.15
40 0.17
41 0.19
42 0.25
43 0.32
44 0.42
45 0.45
46 0.52
47 0.58
48 0.67
49 0.76
50 0.8
51 0.82
52 0.82
53 0.82
54 0.82
55 0.84
56 0.84
57 0.83
58 0.84
59 0.81
60 0.76
61 0.7
62 0.64
63 0.54
64 0.42
65 0.32
66 0.24
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.14
71 0.13
72 0.17
73 0.21
74 0.23
75 0.28
76 0.26
77 0.24
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.24
82 0.22
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.11
96 0.12
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.13
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.25
113 0.24
114 0.26
115 0.28
116 0.28
117 0.27
118 0.3
119 0.34
120 0.29
121 0.28
122 0.26
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.17
127 0.11
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.14
166 0.18
167 0.25
168 0.23
169 0.24
170 0.25
171 0.28
172 0.29
173 0.36
174 0.34
175 0.34
176 0.4
177 0.4
178 0.39
179 0.38
180 0.38
181 0.32
182 0.31
183 0.25
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.23
188 0.27
189 0.32
190 0.35
191 0.42
192 0.43
193 0.46
194 0.46
195 0.43
196 0.39
197 0.41
198 0.38
199 0.38
200 0.38
201 0.37
202 0.37
203 0.35
204 0.34
205 0.28
206 0.25
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.16
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.16
253 0.17
254 0.18
255 0.16
256 0.14
257 0.12
258 0.15
259 0.17
260 0.17
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.19
293 0.22
294 0.29
295 0.33
296 0.38
297 0.39
298 0.39
299 0.36
300 0.34
301 0.3
302 0.22
303 0.18
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.08
310 0.12
311 0.12
312 0.18
313 0.24
314 0.25
315 0.29
316 0.37
317 0.4
318 0.39
319 0.43
320 0.44
321 0.4
322 0.4
323 0.37
324 0.3
325 0.3
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.32
330 0.37
331 0.36
332 0.38
333 0.36
334 0.35
335 0.33
336 0.32
337 0.27
338 0.2
339 0.19
340 0.24
341 0.23
342 0.24
343 0.24
344 0.22
345 0.18
346 0.2
347 0.21
348 0.15
349 0.18
350 0.18
351 0.21
352 0.29
353 0.33
354 0.35
355 0.37
356 0.39
357 0.38
358 0.38
359 0.37
360 0.3
361 0.3
362 0.27
363 0.24
364 0.24
365 0.23
366 0.24
367 0.23
368 0.24
369 0.21
370 0.24
371 0.25
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.22
376 0.19
377 0.21
378 0.2
379 0.17
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.12
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.07
404 0.06
405 0.07
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.14
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.18
416 0.19
417 0.2
418 0.23
419 0.25
420 0.24
421 0.28
422 0.33
423 0.37
424 0.45
425 0.51
426 0.54
427 0.59
428 0.66
429 0.72
430 0.72
431 0.72
432 0.71
433 0.71
434 0.74
435 0.67
436 0.66
437 0.58
438 0.61
439 0.57
440 0.53
441 0.52
442 0.47
443 0.48
444 0.49
445 0.53
446 0.47