Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q09882

Protein Details
Accession Q09882    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-408DSEAFRRRQELRRERRRQAEKDLRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-229KFRHKKVPRGPPSP
389-425RRRQELRRERRRQAEKDLRLSRMGAEKRAKLAEKDRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPCC188.11  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MALLSEELSSILPNPDFDDEEEDYVERETSHADERQIGVKFHIPPYGQRKGWFPSSPEDFGDGGAFPEIHVAQYPLDMGRKRSAKSAGNTLALQVTSSGAVDYNAIARQGHEHGELVQASFRDLIPLRARLGVGEISLEKPSDEQKQEVANKTKLALQKILSKQIAQSQPKSAVVQQRDDPVYIRYTPSNQMGQALSKQRIIKMVTAEQDPMEPPKFRHKKVPRGPPSPPPPVLHSPPRKVSAQEQQDWQIPPSISNWKNPKGYTIPLDKRLAADGRGLNDVEINDGFAKFSEALYTVERQAREEVRYRAIMRQKMAEKEKQEKEQRLFMLAQKAREDRMGRNAASSGPSHAKPRSTSVSSEERSRSRAGSFSHHSESENEDEDSEAFRRRQELRRERRRQAEKDLRLSRMGAEKRAKLAEKDRPRDVAERVALGLSKPSMSSDTMIDSRLFNQASGLGSGFQDEDSYNVYDKPWRAAPSSTLYRPGATLSRQVDASAELERITSESRYDVLGNAHKKFKGSDEVVESRAGPVTFEKDIADPFGVDTFLNNVSSKKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.19
4 0.2
5 0.25
6 0.23
7 0.24
8 0.25
9 0.22
10 0.2
11 0.19
12 0.18
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.27
22 0.33
23 0.34
24 0.32
25 0.29
26 0.32
27 0.34
28 0.33
29 0.37
30 0.32
31 0.37
32 0.45
33 0.51
34 0.47
35 0.46
36 0.49
37 0.48
38 0.55
39 0.51
40 0.46
41 0.45
42 0.49
43 0.49
44 0.45
45 0.43
46 0.35
47 0.31
48 0.29
49 0.21
50 0.15
51 0.13
52 0.12
53 0.08
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.11
63 0.16
64 0.18
65 0.21
66 0.28
67 0.33
68 0.34
69 0.39
70 0.44
71 0.46
72 0.48
73 0.54
74 0.51
75 0.49
76 0.48
77 0.43
78 0.38
79 0.3
80 0.26
81 0.16
82 0.12
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.18
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.19
112 0.21
113 0.24
114 0.24
115 0.25
116 0.25
117 0.21
118 0.23
119 0.17
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.14
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.31
134 0.37
135 0.44
136 0.47
137 0.42
138 0.41
139 0.4
140 0.42
141 0.38
142 0.36
143 0.32
144 0.28
145 0.35
146 0.38
147 0.44
148 0.4
149 0.37
150 0.35
151 0.39
152 0.45
153 0.41
154 0.4
155 0.36
156 0.39
157 0.4
158 0.4
159 0.36
160 0.35
161 0.33
162 0.35
163 0.33
164 0.35
165 0.35
166 0.34
167 0.3
168 0.25
169 0.24
170 0.22
171 0.21
172 0.17
173 0.19
174 0.21
175 0.24
176 0.24
177 0.21
178 0.22
179 0.21
180 0.21
181 0.24
182 0.26
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.26
187 0.29
188 0.29
189 0.27
190 0.25
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.21
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.26
203 0.33
204 0.34
205 0.45
206 0.5
207 0.59
208 0.67
209 0.76
210 0.75
211 0.74
212 0.77
213 0.75
214 0.74
215 0.69
216 0.63
217 0.54
218 0.5
219 0.49
220 0.49
221 0.49
222 0.49
223 0.47
224 0.48
225 0.49
226 0.45
227 0.41
228 0.42
229 0.41
230 0.41
231 0.39
232 0.37
233 0.36
234 0.4
235 0.38
236 0.33
237 0.28
238 0.22
239 0.19
240 0.2
241 0.26
242 0.23
243 0.29
244 0.35
245 0.36
246 0.39
247 0.38
248 0.4
249 0.34
250 0.35
251 0.33
252 0.37
253 0.35
254 0.37
255 0.39
256 0.35
257 0.32
258 0.32
259 0.28
260 0.19
261 0.19
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.24
292 0.24
293 0.24
294 0.27
295 0.27
296 0.3
297 0.34
298 0.35
299 0.31
300 0.34
301 0.36
302 0.4
303 0.43
304 0.43
305 0.41
306 0.47
307 0.51
308 0.53
309 0.57
310 0.57
311 0.55
312 0.55
313 0.51
314 0.45
315 0.41
316 0.35
317 0.38
318 0.33
319 0.33
320 0.3
321 0.31
322 0.28
323 0.31
324 0.31
325 0.23
326 0.3
327 0.33
328 0.29
329 0.29
330 0.29
331 0.25
332 0.24
333 0.22
334 0.17
335 0.16
336 0.17
337 0.21
338 0.22
339 0.24
340 0.24
341 0.28
342 0.31
343 0.3
344 0.3
345 0.31
346 0.38
347 0.37
348 0.41
349 0.4
350 0.35
351 0.36
352 0.36
353 0.32
354 0.25
355 0.28
356 0.24
357 0.27
358 0.3
359 0.32
360 0.34
361 0.33
362 0.33
363 0.3
364 0.32
365 0.28
366 0.25
367 0.2
368 0.17
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.14
373 0.15
374 0.13
375 0.14
376 0.19
377 0.25
378 0.33
379 0.42
380 0.52
381 0.59
382 0.7
383 0.78
384 0.81
385 0.86
386 0.88
387 0.82
388 0.83
389 0.82
390 0.79
391 0.8
392 0.77
393 0.69
394 0.61
395 0.56
396 0.47
397 0.45
398 0.4
399 0.38
400 0.38
401 0.37
402 0.4
403 0.44
404 0.43
405 0.39
406 0.45
407 0.47
408 0.52
409 0.56
410 0.56
411 0.55
412 0.56
413 0.56
414 0.5
415 0.48
416 0.39
417 0.34
418 0.3
419 0.27
420 0.24
421 0.2
422 0.19
423 0.12
424 0.1
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.12
431 0.16
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.17
436 0.17
437 0.21
438 0.2
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.16
443 0.16
444 0.15
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.07
452 0.08
453 0.1
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.14
458 0.18
459 0.2
460 0.23
461 0.26
462 0.27
463 0.29
464 0.31
465 0.34
466 0.37
467 0.43
468 0.41
469 0.42
470 0.39
471 0.37
472 0.36
473 0.35
474 0.31
475 0.25
476 0.31
477 0.27
478 0.28
479 0.28
480 0.27
481 0.25
482 0.22
483 0.21
484 0.15
485 0.14
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.12
494 0.13
495 0.15
496 0.15
497 0.15
498 0.2
499 0.27
500 0.32
501 0.36
502 0.41
503 0.4
504 0.41
505 0.41
506 0.4
507 0.42
508 0.39
509 0.4
510 0.43
511 0.45
512 0.45
513 0.45
514 0.4
515 0.32
516 0.32
517 0.25
518 0.18
519 0.17
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.21
524 0.19
525 0.2
526 0.22
527 0.2
528 0.15
529 0.15
530 0.16
531 0.15
532 0.13
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.15
537 0.15