FuNGI

O13993

Protein Details

Accession

O13993

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
418-438	IQRQEKNKSYKDKKRLKELFN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 8.5, cyto_mito 6.5, cyto 3.5, plas 2, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005829 C:cytosol GO:0034245 C:mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0001018 F:mitochondrial promoter sequence-specific DNA binding GO:0006390 P:mitochondrial transcription GO:0006391 P:transcription initiation at mitochondrial promoter
KEGG	spo:SPAC26H5.12 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLRRKIQTYLSRSHIRRGLCGLRFFQTQRLHTDYMPIEAYEPYKNELKSKIGKDFIIDLSYKSGTASLFEACVYNGDFLRSKQLLKSFIDHNKGDKILLPMINLYIREIIQRGSFELTDVLSNAKELLQQARLNGDSLTYALLCQASLNPTQRQLGLPVLHELIHNWRSANGKVIDILMHESVFSPEEVKLIMDQLNIPINNFTPSQLQLLGITNSTIVGESENGKDQNGDSSLKEKQPDVETTVTKSANLNALRSSLSSLLTESIDLPIDEVSLEFGNQGDTFNLARQKLLEKSAILSAAEVWKSEHESVLNRGNLQVPKNVSSLFYSWYVQLEQLFKEEISLIDDLALNESLDKKNDRLIYGPFLKLLSSKKLAALTIMEVAQLSTNPRYDRGARVTTLLGGLGRSFEREFLSEQIQRQEKNKSYKDKKRLKELFNDPRKFRQAVKNLRLSNTRDNIVLNPSVDSWPSAIVMKVGSVALCLLLSVAKIEVTAKDLSTGGILKQEVAAFVHTYQYSNGRKVGMIVPHVEFYKLLSRDIEKPHLHPQLLPMLVTPKPWTSWIDGGYYYSRQPLVRLKGALEQVDYLMKASENGQLDELFKAVSSLGKVSWRINQRLFNVLIRIWNSGEKFLSIPPREVKCDMPPYPKNSINPRDKVIWHTRRKELAALKTGAHSQRCDFNYKLEIARAFLNEKFYFPHSLDFRGRAYPLSSHLHHVSNDVCRGLLEFSTGKPLGPKGLNWLKVHLANLFGISKKDFATRQAFVDDNMQEVFDSADRPLDGNKWWSKADDPFQALAACFEIAEAVRSGDHESYISHIPIQQDGTCNGLQHYAALGGDIEGAKQVNLWPSDHPSDVYEAVAEIVRGFLKKDAEAGDEMANFLKDKVTRSVVKPTVMTNVYGVTYVGARKQISEKLENIDGMEKLKVADYANYLTKKVFEALRSLFTQAHEIQDWLSACCNLITHSLPADYIKEGIKDELTPVVWTTLLNLPIVQPYRNYKSRQIRTNLQTVFIEERDRTATVQPHKQATAFPPNFIHSLDATHMFMTCLKCSEQNINFAAVHDSYWTHACDVDQMNSLLREAFVLLHSNNIMERLKQEFEERYKGFLVSKKAIKANDEDLKAKFGNKSYIPLEFPPLPARGALDLKKVLESKYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.56
3	0.53
4	0.54
5	0.55
6	0.51
7	0.55
8	0.5
9	0.5
10	0.53
11	0.51
12	0.51
13	0.5
14	0.47
15	0.48
16	0.52
17	0.49
18	0.44
19	0.5
20	0.42
21	0.38
22	0.35
23	0.29
24	0.23
25	0.23
26	0.25
27	0.21
28	0.22
29	0.22
30	0.27
31	0.28
32	0.31
33	0.34
34	0.39
35	0.44
36	0.49
37	0.54
38	0.52
39	0.52
40	0.5
41	0.5
42	0.45
43	0.4
44	0.34
45	0.26
46	0.27
47	0.26
48	0.23
49	0.19
50	0.18
51	0.14
52	0.15
53	0.15
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.13
58	0.11
59	0.13
60	0.12
61	0.13
62	0.12
63	0.16
64	0.17
65	0.17
66	0.26
67	0.26
68	0.27
69	0.3
70	0.35
71	0.37
72	0.38
73	0.42
74	0.42
75	0.48
76	0.53
77	0.5
78	0.48
79	0.49
80	0.46
81	0.43
82	0.38
83	0.34
84	0.33
85	0.32
86	0.29
87	0.24
88	0.26
89	0.27
90	0.24
91	0.21
92	0.17
93	0.16
94	0.17
95	0.17
96	0.16
97	0.17
98	0.18
99	0.18
100	0.19
101	0.19
102	0.17
103	0.17
104	0.16
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.16
115	0.21
116	0.22
117	0.23
118	0.27
119	0.27
120	0.26
121	0.24
122	0.2
123	0.14
124	0.13
125	0.13
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.1
133	0.11
134	0.17
135	0.22
136	0.23
137	0.26
138	0.28
139	0.29
140	0.28
141	0.28
142	0.29
143	0.26
144	0.25
145	0.24
146	0.23
147	0.22
148	0.21
149	0.2
150	0.22
151	0.22
152	0.21
153	0.19
154	0.21
155	0.24
156	0.25
157	0.31
158	0.25
159	0.24
160	0.23
161	0.24
162	0.21
163	0.19
164	0.21
165	0.14
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.12
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.11
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.13
183	0.19
184	0.18
185	0.19
186	0.17
187	0.17
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.14
192	0.16
193	0.17
194	0.17
195	0.16
196	0.16
197	0.18
198	0.17
199	0.14
200	0.13
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.08
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.09
209	0.11
210	0.15
211	0.16
212	0.16
213	0.16
214	0.16
215	0.19
216	0.19
217	0.19
218	0.16
219	0.2
220	0.25
221	0.27
222	0.29
223	0.25
224	0.27
225	0.3
226	0.32
227	0.33
228	0.33
229	0.31
230	0.33
231	0.37
232	0.32
233	0.29
234	0.27
235	0.24
236	0.26
237	0.26
238	0.23
239	0.19
240	0.2
241	0.2
242	0.2
243	0.2
244	0.14
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.07
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.06
269	0.08
270	0.09
271	0.12
272	0.17
273	0.15
274	0.16
275	0.17
276	0.21
277	0.22
278	0.25
279	0.23
280	0.19
281	0.21
282	0.23
283	0.22
284	0.18
285	0.15
286	0.13
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.15
293	0.16
294	0.15
295	0.13
296	0.16
297	0.2
298	0.26
299	0.26
300	0.23
301	0.24
302	0.28
303	0.3
304	0.29
305	0.3
306	0.25
307	0.27
308	0.28
309	0.27
310	0.23
311	0.22
312	0.21
313	0.19
314	0.18
315	0.16
316	0.15
317	0.16
318	0.16
319	0.14
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.13
326	0.13
327	0.12
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.1
336	0.1
337	0.07
338	0.07
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.14
343	0.13
344	0.19
345	0.21
346	0.22
347	0.22
348	0.23
349	0.28
350	0.3
351	0.3
352	0.25
353	0.23
354	0.22
355	0.23
356	0.23
357	0.21
358	0.2
359	0.21
360	0.22
361	0.23
362	0.23
363	0.21
364	0.19
365	0.14
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.12
377	0.13
378	0.17
379	0.19
380	0.24
381	0.28
382	0.29
383	0.27
384	0.28
385	0.27
386	0.25
387	0.22
388	0.17
389	0.11
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.09
398	0.11
399	0.12
400	0.13
401	0.18
402	0.19
403	0.21
404	0.27
405	0.29
406	0.29
407	0.31
408	0.37
409	0.39
410	0.45
411	0.51
412	0.55
413	0.62
414	0.71
415	0.78
416	0.8
417	0.79
418	0.8
419	0.82
420	0.76
421	0.76
422	0.76
423	0.77
424	0.77
425	0.78
426	0.7
427	0.68
428	0.68
429	0.6
430	0.54
431	0.53
432	0.53
433	0.57
434	0.61
435	0.62
436	0.6
437	0.61
438	0.61
439	0.56
440	0.54
441	0.47
442	0.41
443	0.33
444	0.32
445	0.3
446	0.27
447	0.24
448	0.16
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.11
454	0.08
455	0.07
456	0.08
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.07
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.06
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.06
497	0.07
498	0.09
499	0.08
500	0.09
501	0.09
502	0.16
503	0.18
504	0.19
505	0.2
506	0.18
507	0.18
508	0.2
509	0.23
510	0.17
511	0.17
512	0.17
513	0.16
514	0.17
515	0.17
516	0.15
517	0.12
518	0.11
519	0.16
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.17
524	0.22
525	0.26
526	0.31
527	0.26
528	0.28
529	0.36
530	0.39
531	0.37
532	0.32
533	0.3
534	0.29
535	0.28
536	0.25
537	0.17
538	0.16
539	0.16
540	0.16
541	0.15
542	0.1
543	0.11
544	0.12
545	0.13
546	0.13
547	0.16
548	0.16
549	0.16
550	0.16
551	0.17
552	0.17
553	0.16
554	0.13
555	0.12
556	0.12
557	0.11
558	0.13
559	0.18
560	0.2
561	0.22
562	0.22
563	0.22
564	0.25
565	0.27
566	0.25
567	0.19
568	0.15
569	0.13
570	0.13
571	0.11
572	0.07
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.1
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.12
583	0.12
584	0.11
585	0.07
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.08
594	0.1
595	0.11
596	0.16
597	0.21
598	0.25
599	0.28
600	0.32
601	0.32
602	0.35
603	0.35
604	0.31
605	0.27
606	0.23
607	0.22
608	0.18
609	0.18
610	0.14
611	0.15
612	0.15
613	0.14
614	0.14
615	0.12
616	0.12
617	0.13
618	0.2
619	0.18
620	0.21
621	0.25
622	0.27
623	0.3
624	0.31
625	0.31
626	0.28
627	0.35
628	0.35
629	0.38
630	0.4
631	0.42
632	0.46
633	0.48
634	0.47
635	0.48
636	0.54
637	0.53
638	0.52
639	0.5
640	0.47
641	0.45
642	0.47
643	0.49
644	0.5
645	0.51
646	0.54
647	0.56
648	0.56
649	0.56
650	0.56
651	0.51
652	0.47
653	0.44
654	0.4
655	0.35
656	0.32
657	0.35
658	0.32
659	0.28
660	0.23
661	0.19
662	0.24
663	0.26
664	0.29
665	0.26
666	0.25
667	0.27
668	0.27
669	0.27
670	0.22
671	0.21
672	0.17
673	0.19
674	0.17
675	0.16
676	0.15
677	0.2
678	0.18
679	0.18
680	0.18
681	0.19
682	0.2
683	0.19
684	0.23
685	0.19
686	0.24
687	0.25
688	0.26
689	0.25
690	0.24
691	0.24
692	0.2
693	0.2
694	0.16
695	0.18
696	0.21
697	0.2
698	0.22
699	0.24
700	0.25
701	0.24
702	0.25
703	0.23
704	0.21
705	0.22
706	0.18
707	0.15
708	0.13
709	0.14
710	0.13
711	0.1
712	0.09
713	0.09
714	0.09
715	0.15
716	0.15
717	0.14
718	0.14
719	0.15
720	0.17
721	0.17
722	0.17
723	0.2
724	0.27
725	0.33
726	0.32
727	0.34
728	0.32
729	0.33
730	0.33
731	0.25
732	0.2
733	0.14
734	0.15
735	0.14
736	0.12
737	0.12
738	0.11
739	0.12
740	0.11
741	0.14
742	0.14
743	0.18
744	0.23
745	0.24
746	0.24
747	0.26
748	0.25
749	0.23
750	0.27
751	0.22
752	0.17
753	0.16
754	0.15
755	0.12
756	0.11
757	0.11
758	0.06
759	0.07
760	0.06
761	0.07
762	0.07
763	0.08
764	0.09
765	0.1
766	0.11
767	0.18
768	0.21
769	0.22
770	0.23
771	0.24
772	0.26
773	0.29
774	0.33
775	0.31
776	0.31
777	0.29
778	0.29
779	0.28
780	0.25
781	0.2
782	0.16
783	0.1
784	0.07
785	0.06
786	0.06
787	0.05
788	0.06
789	0.06
790	0.05
791	0.05
792	0.06
793	0.09
794	0.08
795	0.09
796	0.08
797	0.08
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.11
802	0.13
803	0.14
804	0.15
805	0.17
806	0.15
807	0.15
808	0.16
809	0.19
810	0.17
811	0.17
812	0.16
813	0.15
814	0.13
815	0.12
816	0.11
817	0.08
818	0.07
819	0.07
820	0.06
821	0.05
822	0.06
823	0.06
824	0.05
825	0.05
826	0.06
827	0.05
828	0.06
829	0.07
830	0.11
831	0.12
832	0.13
833	0.15
834	0.2
835	0.23
836	0.23
837	0.22
838	0.19
839	0.2
840	0.2
841	0.18
842	0.13
843	0.1
844	0.1
845	0.09
846	0.08
847	0.05
848	0.06
849	0.06
850	0.07
851	0.07
852	0.1
853	0.11
854	0.11
855	0.14
856	0.15
857	0.16
858	0.17
859	0.18
860	0.17
861	0.15
862	0.16
863	0.14
864	0.13
865	0.11
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.14
870	0.18
871	0.24
872	0.28
873	0.31
874	0.41
875	0.41
876	0.42
877	0.4
878	0.37
879	0.38
880	0.34
881	0.32
882	0.22
883	0.2
884	0.18
885	0.17
886	0.15
887	0.09
888	0.09
889	0.09
890	0.11
891	0.13
892	0.13
893	0.15
894	0.19
895	0.24
896	0.27
897	0.31
898	0.31
899	0.32
900	0.34
901	0.32
902	0.3
903	0.27
904	0.23
905	0.2
906	0.18
907	0.14
908	0.12
909	0.12
910	0.13
911	0.11
912	0.13
913	0.14
914	0.17
915	0.23
916	0.24
917	0.25
918	0.23
919	0.23
920	0.22
921	0.23
922	0.22
923	0.17
924	0.22
925	0.24
926	0.28
927	0.28
928	0.29
929	0.27
930	0.25
931	0.29
932	0.24
933	0.24
934	0.21
935	0.2
936	0.18
937	0.21
938	0.21
939	0.16
940	0.17
941	0.13
942	0.13
943	0.13
944	0.13
945	0.1
946	0.13
947	0.14
948	0.14
949	0.15
950	0.15
951	0.15
952	0.16
953	0.17
954	0.14
955	0.14
956	0.14
957	0.14
958	0.15
959	0.16
960	0.16
961	0.15
962	0.15
963	0.17
964	0.16
965	0.15
966	0.14
967	0.14
968	0.13
969	0.12
970	0.14
971	0.15
972	0.15
973	0.15
974	0.14
975	0.14
976	0.2
977	0.22
978	0.2
979	0.19
980	0.26
981	0.34
982	0.4
983	0.44
984	0.49
985	0.58
986	0.66
987	0.71
988	0.71
989	0.73
990	0.72
991	0.77
992	0.68
993	0.6
994	0.52
995	0.46
996	0.43
997	0.34
998	0.32
999	0.23
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.24
1003	0.23
1004	0.24
1005	0.3
1006	0.34
1007	0.42
1008	0.45
1009	0.47
1010	0.47
1011	0.47
1012	0.45
1013	0.45
1014	0.49
1015	0.41
1016	0.39
1017	0.37
1018	0.38
1019	0.38
1020	0.35
1021	0.3
1022	0.19
1023	0.2
1024	0.2
1025	0.2
1026	0.18
1027	0.17
1028	0.17
1029	0.15
1030	0.19
1031	0.19
1032	0.18
1033	0.17
1034	0.18
1035	0.21
1036	0.25
1037	0.34
1038	0.33
1039	0.37
1040	0.37
1041	0.38
1042	0.37
1043	0.35
1044	0.34
1045	0.25
1046	0.22
1047	0.17
1048	0.15
1049	0.14
1050	0.16
1051	0.16
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.14
1055	0.19
1056	0.22
1057	0.23
1058	0.23
1059	0.23
1060	0.25
1061	0.24
1062	0.25
1063	0.18
1064	0.15
1065	0.13
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.1
1069	0.13
1070	0.13
1071	0.15
1072	0.16
1073	0.16
1074	0.15
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.16
1078	0.19
1079	0.21
1080	0.23
1081	0.24
1082	0.29
1083	0.33
1084	0.38
1085	0.46
1086	0.44
1087	0.43
1088	0.42
1089	0.42
1090	0.42
1091	0.39
1092	0.41
1093	0.4
1094	0.45
1095	0.47
1096	0.51
1097	0.52
1098	0.51
1099	0.51
1100	0.52
1101	0.52
1102	0.5
1103	0.48
1104	0.44
1105	0.46
1106	0.44
1107	0.42
1108	0.37
1109	0.33
1110	0.37
1111	0.35
1112	0.4
1113	0.38
1114	0.41
1115	0.42
1116	0.39
1117	0.42
1118	0.36
1119	0.37
1120	0.35
1121	0.34
1122	0.3
1123	0.26
1124	0.27
1125	0.25
1126	0.29
1127	0.3
1128	0.32
1129	0.34
1130	0.34
1131	0.39
1132	0.39
1133	0.36
1134	0.36

O13993

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer