Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74968

Protein Details
Accession O74968    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138EEIETRKKDRKNRREMLKRTSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-158RKKDRKNRREMLKRTSALQPAAPKPTHKKPVPKRNVG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPBC4B4.07c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12246  RRM1_U1A_like  
cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MDPQTNSHQEVQQPSPKETDSQTPSETLYIRNIEEKIRLTMLKRILEHLFGSYGKVIDVQARKTLRMRGQAFVVFDNLENASRALKDLQGYPLYGKPMMIQYSKSKSDIIVQRESPEEIETRKKDRKNRREMLKRTSALQPAAPKPTHKKPVPKRNVGAERKSTINEDLLPPNKVLLLQNIPQEVNADVLTQIFEAFSGFQEVRMVPGRRGIAFVEYDSDREATVAKNGTTGMSLSGNQIKVTFARKAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.42
4 0.4
5 0.36
6 0.39
7 0.37
8 0.37
9 0.37
10 0.34
11 0.34
12 0.34
13 0.32
14 0.25
15 0.25
16 0.23
17 0.22
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.28
22 0.28
23 0.26
24 0.26
25 0.27
26 0.26
27 0.31
28 0.35
29 0.36
30 0.34
31 0.35
32 0.34
33 0.34
34 0.32
35 0.27
36 0.23
37 0.18
38 0.19
39 0.16
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.15
45 0.18
46 0.19
47 0.25
48 0.26
49 0.28
50 0.31
51 0.37
52 0.36
53 0.42
54 0.43
55 0.38
56 0.4
57 0.41
58 0.39
59 0.32
60 0.28
61 0.19
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.16
82 0.15
83 0.12
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.2
89 0.25
90 0.27
91 0.27
92 0.24
93 0.22
94 0.28
95 0.32
96 0.31
97 0.3
98 0.29
99 0.29
100 0.3
101 0.3
102 0.23
103 0.18
104 0.14
105 0.12
106 0.19
107 0.2
108 0.26
109 0.32
110 0.37
111 0.45
112 0.55
113 0.64
114 0.67
115 0.73
116 0.77
117 0.81
118 0.83
119 0.81
120 0.79
121 0.69
122 0.61
123 0.58
124 0.5
125 0.4
126 0.36
127 0.34
128 0.27
129 0.32
130 0.3
131 0.28
132 0.32
133 0.4
134 0.46
135 0.46
136 0.54
137 0.59
138 0.7
139 0.76
140 0.77
141 0.73
142 0.74
143 0.79
144 0.76
145 0.72
146 0.65
147 0.58
148 0.52
149 0.49
150 0.41
151 0.32
152 0.27
153 0.22
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.22
159 0.2
160 0.19
161 0.19
162 0.16
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.22
171 0.18
172 0.15
173 0.12
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.15
191 0.22
192 0.24
193 0.2
194 0.26
195 0.28
196 0.26
197 0.28
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.1
211 0.15
212 0.17
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.16
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.22
229 0.26