Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74340

Protein Details
Accession O74340    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-395PEIRRIARHRHLPTNVKKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-422EIRRIARHRHLPTNVKKAAEIKREEINSLKRREENIRRHSKKGAVP
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG spo:SPBC1A4.07c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKVKTITRGTSLTRLNDQDPVKRNLDPSLHPFERAREYTRALNATKMDRMFAAPFLGQLGRGHQDGVYSLARDTKTLIDCASGSGDGAVKLWDASERCERWTSKAHEGIVRGLVFSNQGDVLSCASDRYVYMLNKQDGKVKRSYLGDSSLLDIDTSKGGDLFATSGENVSIWDYSRDTPVTKFEWGADTLPVVKFNYTETSVLASAGMDRSIVIYDLRTSSPLTKLITKLRTNSISWNPMEAFNFVAGSEDHNLYMYDMRNLKRALHVYKDHVSAVMSVDFSPTGQEFVSGSYDKTIRIYNVREGHSRDVYHTKRMQRVTAVKFSMDAQYIFSGSDDSNVRLWRARASSRASIRSTREENRLKYLDSLRERYKHIPEIRRIARHRHLPTNVKKAAEIKREEINSLKRREENIRRHSKKGAVPYEKERERHVVGIQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.48
4 0.47
5 0.48
6 0.49
7 0.51
8 0.47
9 0.46
10 0.46
11 0.45
12 0.47
13 0.44
14 0.44
15 0.48
16 0.46
17 0.46
18 0.46
19 0.44
20 0.48
21 0.46
22 0.45
23 0.4
24 0.43
25 0.46
26 0.5
27 0.51
28 0.43
29 0.44
30 0.43
31 0.42
32 0.44
33 0.38
34 0.33
35 0.28
36 0.3
37 0.26
38 0.23
39 0.22
40 0.16
41 0.15
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.13
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.15
52 0.14
53 0.18
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.21
62 0.21
63 0.22
64 0.22
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.1
80 0.1
81 0.14
82 0.22
83 0.23
84 0.26
85 0.32
86 0.33
87 0.34
88 0.43
89 0.44
90 0.45
91 0.49
92 0.49
93 0.46
94 0.47
95 0.44
96 0.4
97 0.33
98 0.25
99 0.2
100 0.17
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.14
117 0.14
118 0.19
119 0.26
120 0.29
121 0.33
122 0.34
123 0.39
124 0.38
125 0.42
126 0.42
127 0.37
128 0.38
129 0.37
130 0.39
131 0.33
132 0.32
133 0.29
134 0.25
135 0.25
136 0.21
137 0.18
138 0.15
139 0.13
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.13
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.1
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.18
213 0.23
214 0.29
215 0.3
216 0.31
217 0.34
218 0.35
219 0.34
220 0.37
221 0.35
222 0.33
223 0.31
224 0.31
225 0.27
226 0.25
227 0.25
228 0.2
229 0.15
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.1
244 0.12
245 0.16
246 0.17
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.24
251 0.29
252 0.28
253 0.3
254 0.33
255 0.33
256 0.37
257 0.37
258 0.33
259 0.28
260 0.25
261 0.19
262 0.18
263 0.13
264 0.1
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.08
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.18
286 0.21
287 0.26
288 0.32
289 0.35
290 0.37
291 0.4
292 0.43
293 0.42
294 0.39
295 0.36
296 0.39
297 0.39
298 0.43
299 0.46
300 0.47
301 0.5
302 0.52
303 0.51
304 0.49
305 0.56
306 0.54
307 0.55
308 0.49
309 0.42
310 0.4
311 0.39
312 0.34
313 0.27
314 0.21
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.11
321 0.09
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.23
331 0.27
332 0.28
333 0.31
334 0.37
335 0.44
336 0.47
337 0.53
338 0.51
339 0.52
340 0.53
341 0.55
342 0.55
343 0.53
344 0.56
345 0.58
346 0.58
347 0.6
348 0.58
349 0.52
350 0.51
351 0.52
352 0.51
353 0.5
354 0.53
355 0.52
356 0.54
357 0.58
358 0.58
359 0.59
360 0.59
361 0.61
362 0.64
363 0.64
364 0.71
365 0.73
366 0.76
367 0.74
368 0.74
369 0.73
370 0.74
371 0.73
372 0.72
373 0.73
374 0.74
375 0.79
376 0.8
377 0.76
378 0.67
379 0.62
380 0.61
381 0.62
382 0.61
383 0.56
384 0.49
385 0.53
386 0.53
387 0.53
388 0.52
389 0.53
390 0.53
391 0.54
392 0.56
393 0.53
394 0.57
395 0.65
396 0.68
397 0.68
398 0.71
399 0.76
400 0.76
401 0.76
402 0.78
403 0.75
404 0.72
405 0.72
406 0.72
407 0.7
408 0.71
409 0.75
410 0.78
411 0.77
412 0.72
413 0.67
414 0.63
415 0.58
416 0.55