FuNGI

A0A0D2A8H0

Protein Details

Accession

A0A0D2A8H0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-37	ASTSGPKPKPRAGIQRKSKAEREAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-75	SGPKPKPRAGIQRKSKAEREAFAREEAERQQARLAEAERNAAAAARGGRGGRAGRGGRGG
245-265	ERQKKVKAEKKSRGGGGGALK
302-317	RRRGLKKPGGRGREPK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDSKPSTPKPSASTSGPKPKPRAGIQRKSKAEREAFAREEAERQQARLAEAERNAAAAARGGRGGRAGRGGRGGASTPDRGREQPVGGNSVFGASTGMRPQTSRRDAPEGYSEKLEGQSTIKPDEIGVQGLEEGASSRGGGGGGGGGSGGGRAANRDQQYQYETISDDEAEEDRQPIETIILSSDQDDFEYDDSEDQADTDDDGDGDDKPVDSSRKGKQKEETNPALSKLELRPMMPRTNPDPERQKKVKAEKKSRGGGGGALKKQEPDTRDVDADDSAGDPMDIDEPVVVKEQPSSPEMRRRGLKKPGGRGREPKFANETIEERAERLRMMSDVRRLRRVFRRVRVKSEGPAVSVGEREDSKQTDQSDDPPEIETRRVPKGELFLFQLPPLTPFLVDSATADDEKQPEVKKEPGTDGQMTAPATANPTTTDGDEAKKDVTDGGGSGGGSSAQPKLQMDGTLTATEPTRLPAGLVGKLRLHKSGKVSLDWGGADMEVRYGSRVDFLQDVVMVESRRKNHDAGAGNDQPEGEADADASGDGGAGTSQEKVKREADDLDGTAYTLGHVRQKLVCIPDWARLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.6
3	0.65
4	0.68
5	0.72
6	0.71
7	0.73
8	0.74
9	0.74
10	0.76
11	0.76
12	0.79
13	0.81
14	0.85
15	0.87
16	0.86
17	0.83
18	0.81
19	0.76
20	0.71
21	0.67
22	0.65
23	0.58
24	0.54
25	0.5
26	0.41
27	0.4
28	0.38
29	0.4
30	0.33
31	0.31
32	0.32
33	0.32
34	0.32
35	0.33
36	0.32
37	0.28
38	0.28
39	0.31
40	0.27
41	0.25
42	0.23
43	0.19
44	0.17
45	0.14
46	0.14
47	0.12
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.18
52	0.19
53	0.18
54	0.24
55	0.25
56	0.25
57	0.28
58	0.28
59	0.25
60	0.25
61	0.24
62	0.21
63	0.23
64	0.27
65	0.25
66	0.29
67	0.31
68	0.31
69	0.35
70	0.34
71	0.33
72	0.33
73	0.34
74	0.34
75	0.31
76	0.3
77	0.25
78	0.22
79	0.18
80	0.13
81	0.12
82	0.07
83	0.1
84	0.12
85	0.14
86	0.14
87	0.15
88	0.21
89	0.3
90	0.36
91	0.39
92	0.41
93	0.47
94	0.47
95	0.49
96	0.54
97	0.47
98	0.42
99	0.39
100	0.34
101	0.28
102	0.3
103	0.26
104	0.18
105	0.17
106	0.18
107	0.19
108	0.21
109	0.2
110	0.18
111	0.18
112	0.21
113	0.19
114	0.17
115	0.14
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.03
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.05
141	0.08
142	0.14
143	0.16
144	0.2
145	0.21
146	0.24
147	0.27
148	0.27
149	0.25
150	0.21
151	0.19
152	0.16
153	0.16
154	0.13
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.09
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.09
199	0.11
200	0.12
201	0.17
202	0.24
203	0.33
204	0.37
205	0.41
206	0.45
207	0.53
208	0.6
209	0.64
210	0.62
211	0.58
212	0.56
213	0.54
214	0.47
215	0.37
216	0.32
217	0.24
218	0.23
219	0.19
220	0.18
221	0.22
222	0.25
223	0.29
224	0.27
225	0.29
226	0.28
227	0.37
228	0.38
229	0.39
230	0.46
231	0.47
232	0.55
233	0.55
234	0.58
235	0.57
236	0.66
237	0.67
238	0.67
239	0.73
240	0.72
241	0.77
242	0.75
243	0.68
244	0.59
245	0.51
246	0.44
247	0.4
248	0.38
249	0.31
250	0.27
251	0.26
252	0.25
253	0.27
254	0.26
255	0.21
256	0.18
257	0.2
258	0.21
259	0.21
260	0.21
261	0.2
262	0.16
263	0.15
264	0.11
265	0.08
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.08
282	0.1
283	0.11
284	0.14
285	0.16
286	0.25
287	0.28
288	0.31
289	0.35
290	0.38
291	0.44
292	0.5
293	0.55
294	0.52
295	0.6
296	0.63
297	0.64
298	0.65
299	0.66
300	0.62
301	0.64
302	0.59
303	0.51
304	0.48
305	0.43
306	0.39
307	0.32
308	0.29
309	0.22
310	0.24
311	0.21
312	0.16
313	0.16
314	0.15
315	0.13
316	0.11
317	0.1
318	0.08
319	0.12
320	0.14
321	0.22
322	0.29
323	0.31
324	0.38
325	0.38
326	0.45
327	0.51
328	0.57
329	0.58
330	0.6
331	0.69
332	0.66
333	0.73
334	0.73
335	0.66
336	0.6
337	0.58
338	0.5
339	0.4
340	0.36
341	0.29
342	0.22
343	0.2
344	0.17
345	0.11
346	0.1
347	0.1
348	0.12
349	0.13
350	0.15
351	0.18
352	0.19
353	0.21
354	0.21
355	0.25
356	0.26
357	0.25
358	0.24
359	0.22
360	0.22
361	0.2
362	0.2
363	0.19
364	0.19
365	0.23
366	0.23
367	0.22
368	0.23
369	0.28
370	0.28
371	0.27
372	0.27
373	0.25
374	0.25
375	0.24
376	0.24
377	0.18
378	0.17
379	0.17
380	0.13
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.13
394	0.16
395	0.16
396	0.17
397	0.21
398	0.26
399	0.28
400	0.3
401	0.34
402	0.34
403	0.38
404	0.36
405	0.33
406	0.29
407	0.28
408	0.26
409	0.22
410	0.18
411	0.13
412	0.14
413	0.13
414	0.13
415	0.11
416	0.13
417	0.13
418	0.13
419	0.16
420	0.15
421	0.17
422	0.17
423	0.18
424	0.16
425	0.15
426	0.15
427	0.12
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.09
442	0.1
443	0.12
444	0.13
445	0.14
446	0.15
447	0.17
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.16
452	0.15
453	0.16
454	0.14
455	0.12
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.13
460	0.16
461	0.19
462	0.21
463	0.22
464	0.25
465	0.3
466	0.31
467	0.34
468	0.34
469	0.34
470	0.38
471	0.43
472	0.42
473	0.4
474	0.41
475	0.37
476	0.36
477	0.31
478	0.26
479	0.19
480	0.15
481	0.13
482	0.11
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.1
490	0.1
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.13
498	0.15
499	0.13
500	0.17
501	0.22
502	0.24
503	0.3
504	0.32
505	0.32
506	0.33
507	0.41
508	0.43
509	0.43
510	0.48
511	0.47
512	0.45
513	0.44
514	0.4
515	0.32
516	0.25
517	0.22
518	0.14
519	0.09
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.03
530	0.04
531	0.05
532	0.07
533	0.12
534	0.17
535	0.19
536	0.24
537	0.28
538	0.31
539	0.34
540	0.35
541	0.36
542	0.37
543	0.36
544	0.34
545	0.3
546	0.27
547	0.23
548	0.19
549	0.14
550	0.12
551	0.13
552	0.17
553	0.18
554	0.22
555	0.24
556	0.28
557	0.33
558	0.36
559	0.37
560	0.38
561	0.39
562	0.43

A0A0D2A8H0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer