Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D2B705

Protein Details
Accession A0A0D2B705    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29IPTSADPRSRRPVKRARGANTHydrophilic
119-152RERREKDEEKTRKNREKRMKKKGKNKGSEKDGATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-148ERERREKDEEKTRKNREKRMKKKGKNKGSEK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSADPRSRRPVKRARGANTALAAQAYEVETLFLDPERPVHIPPVSSETKRTVAAPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRVMDEEAKKEEEDEAWARQERERREKDEEKTRKNREKRMKKKGKNKGSEKDGATNKESEAANGNKLNGVKRTVGGGGLQIPRRGSRDDDQGSDFGVAEVAKEVGITIHDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.45
4 0.53
5 0.58
6 0.65
7 0.71
8 0.74
9 0.8
10 0.82
11 0.78
12 0.78
13 0.74
14 0.69
15 0.6
16 0.51
17 0.41
18 0.32
19 0.25
20 0.15
21 0.13
22 0.09
23 0.08
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.19
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.27
44 0.27
45 0.28
46 0.28
47 0.28
48 0.26
49 0.26
50 0.28
51 0.26
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.15
57 0.11
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.07
73 0.07
74 0.12
75 0.19
76 0.27
77 0.31
78 0.35
79 0.41
80 0.5
81 0.57
82 0.62
83 0.62
84 0.57
85 0.53
86 0.5
87 0.46
88 0.42
89 0.36
90 0.3
91 0.23
92 0.22
93 0.19
94 0.19
95 0.17
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.23
105 0.26
106 0.34
107 0.38
108 0.41
109 0.48
110 0.54
111 0.58
112 0.64
113 0.67
114 0.67
115 0.72
116 0.77
117 0.78
118 0.79
119 0.83
120 0.83
121 0.85
122 0.86
123 0.88
124 0.89
125 0.89
126 0.92
127 0.93
128 0.92
129 0.91
130 0.9
131 0.87
132 0.83
133 0.81
134 0.73
135 0.7
136 0.65
137 0.59
138 0.51
139 0.43
140 0.36
141 0.34
142 0.31
143 0.23
144 0.24
145 0.22
146 0.24
147 0.24
148 0.25
149 0.22
150 0.24
151 0.26
152 0.23
153 0.24
154 0.21
155 0.2
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.16
160 0.15
161 0.18
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.25
166 0.27
167 0.29
168 0.3
169 0.3
170 0.3
171 0.38
172 0.4
173 0.42
174 0.42
175 0.4
176 0.38
177 0.33
178 0.28
179 0.18
180 0.15
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07