Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P78860

Protein Details
Accession P78860    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34SWAAKRSKDFYRKKSKIDNFRSRAAYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0061668  P:mitochondrial ribosome assembly  
GO:0001510  P:RNA methylation  
GO:0031167  P:rRNA methylation  
KEGG spo:SPBC2G2.15c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01728  FtsJ  
Amino Acid Sequences MFGSKTLFSWAAKRSKDFYRKKSKIDNFRSRAAYKLIELNSKYRFINKEDVVIDVGFAPGSWSQVAKKLVGNKGKVIGIDIQHIAPPEGVLPIYGDIRDPNTLTKLFEALRLLHEPNTNDSIDCRVVDAVISDMLHKATGIRIRDHALSMELCASALHVALTFLKSNGSFICKFYMGDEDADLQNLLKSHFRFVQVMKPKASLKESREAYFVCLERKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.6
4 0.65
5 0.68
6 0.71
7 0.74
8 0.78
9 0.84
10 0.84
11 0.84
12 0.85
13 0.86
14 0.79
15 0.8
16 0.79
17 0.69
18 0.62
19 0.55
20 0.46
21 0.37
22 0.39
23 0.35
24 0.34
25 0.35
26 0.37
27 0.36
28 0.37
29 0.35
30 0.34
31 0.34
32 0.32
33 0.39
34 0.35
35 0.37
36 0.35
37 0.35
38 0.31
39 0.28
40 0.24
41 0.15
42 0.14
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.05
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.19
55 0.25
56 0.32
57 0.37
58 0.38
59 0.34
60 0.35
61 0.35
62 0.32
63 0.26
64 0.22
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.11
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.08
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.18
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.22
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.15
176 0.19
177 0.23
178 0.26
179 0.28
180 0.3
181 0.39
182 0.43
183 0.48
184 0.46
185 0.47
186 0.47
187 0.49
188 0.53
189 0.51
190 0.46
191 0.51
192 0.53
193 0.5
194 0.5
195 0.46
196 0.43
197 0.42
198 0.39