Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SYN8

Protein Details
Accession R7SYN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-429AENGRRRREQRQGQGQKRSMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-417GRLAENGRRRRE
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.333, cyto 6.5, cyto_mito 6.166, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011583  Chitinase_II  
IPR029070  Chitinase_insertion_sf  
IPR001223  Glyco_hydro18_cat  
IPR001579  Glyco_hydro_18_chit_AS  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
Gene Ontology GO:0008061  F:chitin binding  
GO:0004568  F:chitinase activity  
GO:0006032  P:chitin catabolic process  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_180789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00704  Glyco_hydro_18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01095  GH18_1  
PS51910  GH18_2  
Amino Acid Sequences MPAPWDVRPANLRRGGEDLHFVVPTQTETVIVSRTHNVARAAATDESEVILFLPPNAAHASLTSPSFSSSPATTRAPTSPIISSADPVAIPTSSVSVAPPPVDANLGASNNTSTNASASQPSSTGPVATPTASSDAGHAPLVMAYYPDWAGRDYPPEKIDFGRFDWIDFAFAVPDQNMNLGWDGSDDAPDLLRRVVARAHESGKHAKLSVGGWTGSKSFSSAVGTPENRATLANNILTLYQQYGLDGIDLDWEYPGQSGNSGNGVSPADSANFLEFLRVLRDTLPPGAKITAATQTVPFAGADGSPLRDVSDFARVLDWVLIMNYDSWGSSDQPGPNAPLSDACSNSTQPGASALAALRAWTAAGFPASQLVLGVPSYGYLSRSSATRLRTRAGGTRASPRVYRSGRLAENGRRRREQRQGQGQKRSMQRFVWDWIDSLLGPPVYDTDKSGLLVNEDGGTDDGQVQFRELVRQGALAPYSSSPGAPAITTNSSSAPASADGTPQSATPAYDGTFGGEDAALLRAAIEDREPRSLFAGAHGFVREWDGCSSTPFLRAGDARQVVAYDDPVSLEMKGQLVRQARMLGVNMFDVTGDTDGWDLTDALRRGLGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.4
4 0.4
5 0.33
6 0.29
7 0.28
8 0.25
9 0.22
10 0.2
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.11
15 0.12
16 0.14
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.22
22 0.24
23 0.27
24 0.26
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.23
30 0.22
31 0.19
32 0.17
33 0.16
34 0.14
35 0.12
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.11
41 0.1
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.21
59 0.23
60 0.23
61 0.26
62 0.28
63 0.28
64 0.27
65 0.28
66 0.25
67 0.24
68 0.26
69 0.23
70 0.22
71 0.2
72 0.19
73 0.16
74 0.14
75 0.13
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.13
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.2
140 0.19
141 0.23
142 0.24
143 0.25
144 0.26
145 0.27
146 0.3
147 0.25
148 0.26
149 0.29
150 0.27
151 0.26
152 0.26
153 0.24
154 0.2
155 0.17
156 0.15
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.08
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.13
184 0.17
185 0.19
186 0.23
187 0.24
188 0.28
189 0.33
190 0.33
191 0.32
192 0.28
193 0.25
194 0.24
195 0.22
196 0.22
197 0.17
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.12
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.14
271 0.15
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.1
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.11
319 0.11
320 0.13
321 0.13
322 0.15
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.11
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.07
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.03
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.12
372 0.15
373 0.2
374 0.25
375 0.26
376 0.27
377 0.29
378 0.31
379 0.34
380 0.34
381 0.34
382 0.31
383 0.37
384 0.39
385 0.38
386 0.38
387 0.33
388 0.39
389 0.36
390 0.36
391 0.32
392 0.35
393 0.34
394 0.37
395 0.41
396 0.41
397 0.5
398 0.55
399 0.57
400 0.57
401 0.6
402 0.63
403 0.68
404 0.69
405 0.68
406 0.71
407 0.77
408 0.78
409 0.84
410 0.81
411 0.78
412 0.77
413 0.71
414 0.64
415 0.55
416 0.5
417 0.43
418 0.42
419 0.39
420 0.32
421 0.27
422 0.23
423 0.22
424 0.18
425 0.16
426 0.14
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.13
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.12
454 0.12
455 0.16
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.16
460 0.15
461 0.16
462 0.16
463 0.13
464 0.13
465 0.11
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.09
473 0.1
474 0.12
475 0.14
476 0.15
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.13
483 0.11
484 0.13
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.14
489 0.14
490 0.12
491 0.14
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.12
496 0.11
497 0.13
498 0.13
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.09
514 0.13
515 0.16
516 0.23
517 0.24
518 0.24
519 0.26
520 0.28
521 0.25
522 0.24
523 0.26
524 0.2
525 0.22
526 0.22
527 0.19
528 0.17
529 0.22
530 0.18
531 0.16
532 0.17
533 0.17
534 0.17
535 0.19
536 0.23
537 0.2
538 0.23
539 0.21
540 0.2
541 0.22
542 0.23
543 0.24
544 0.3
545 0.3
546 0.28
547 0.27
548 0.27
549 0.24
550 0.23
551 0.21
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.13
561 0.15
562 0.16
563 0.21
564 0.26
565 0.27
566 0.28
567 0.29
568 0.28
569 0.29
570 0.29
571 0.25
572 0.21
573 0.21
574 0.18
575 0.15
576 0.14
577 0.12
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.16
589 0.16
590 0.17
591 0.17