Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7T004

Protein Details
Accession R7T004    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-41GDAPDPKRRRLSRSEKRSTPESEBasic
371-390EQLKEARRRARDGRKWILLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-32KRRRLSRS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_61289  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MAFSSRTSEFRQMVRQRAGDAPDPKRRRLSRSEKRSTPESEKQELLNKEYVKEAYNILNHISTLTRMLTSVRKAYLNVDTRNPPLLRQATRTIDITGGDQSWSDVRSLTNEERDQIDLQARVILSRCKDRVAQLEEVEKRRVELAASRQNPLVRFLPARLRQDDATATSDFVAAHHSSITWFLSRRLAETGQHLRDMQEERMKRQMERTRTLGSGATREAVFLGANQSNLTPPSPAESSASGSWLGNASNLASSFAASIGSSASPFEPSHSASTIKPGTGAAAGSDWMSETDEEELELSASQIQQFEEENANILQSVQDTLQSVQQAEARLMEISALQMELVAHLTKQTEQTEQLYEDAIATAATVEKGNEQLKEARRRARDGRKWILLFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.58
3 0.54
4 0.55
5 0.55
6 0.53
7 0.54
8 0.54
9 0.58
10 0.61
11 0.63
12 0.68
13 0.69
14 0.68
15 0.7
16 0.73
17 0.73
18 0.79
19 0.84
20 0.81
21 0.81
22 0.8
23 0.77
24 0.75
25 0.74
26 0.7
27 0.65
28 0.6
29 0.58
30 0.59
31 0.55
32 0.5
33 0.47
34 0.41
35 0.36
36 0.38
37 0.36
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.23
46 0.21
47 0.2
48 0.18
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.18
56 0.21
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.26
61 0.3
62 0.36
63 0.38
64 0.37
65 0.39
66 0.4
67 0.41
68 0.47
69 0.44
70 0.36
71 0.37
72 0.41
73 0.38
74 0.39
75 0.44
76 0.42
77 0.44
78 0.44
79 0.37
80 0.3
81 0.28
82 0.24
83 0.19
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.11
94 0.17
95 0.19
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.27
100 0.29
101 0.27
102 0.23
103 0.24
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.16
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.35
118 0.36
119 0.38
120 0.33
121 0.4
122 0.43
123 0.44
124 0.43
125 0.35
126 0.3
127 0.27
128 0.25
129 0.18
130 0.18
131 0.23
132 0.3
133 0.32
134 0.33
135 0.34
136 0.36
137 0.36
138 0.34
139 0.27
140 0.2
141 0.2
142 0.21
143 0.28
144 0.32
145 0.36
146 0.34
147 0.35
148 0.32
149 0.33
150 0.32
151 0.25
152 0.22
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.23
177 0.28
178 0.25
179 0.26
180 0.25
181 0.22
182 0.25
183 0.26
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.23
188 0.3
189 0.31
190 0.28
191 0.34
192 0.38
193 0.38
194 0.41
195 0.43
196 0.39
197 0.38
198 0.39
199 0.32
200 0.26
201 0.21
202 0.18
203 0.15
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.06
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.16
258 0.18
259 0.16
260 0.22
261 0.22
262 0.2
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.09
302 0.07
303 0.08
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.21
338 0.25
339 0.27
340 0.27
341 0.26
342 0.22
343 0.2
344 0.17
345 0.15
346 0.12
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.14
356 0.17
357 0.18
358 0.2
359 0.28
360 0.36
361 0.46
362 0.52
363 0.55
364 0.59
365 0.66
366 0.73
367 0.76
368 0.77
369 0.77
370 0.8
371 0.8
372 0.76
373 0.69
374 0.61
375 0.51
376 0.42
377 0.32
378 0.25
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.09
383 0.08
384 0.07