Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42648

Protein Details
Accession O42648    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35SKSEEIKYRQKCKDLKARIQEIQKGHydrophilic
251-288AREKAREARRRRSAQNSAKLEKEKAKEKQKDKDQEQDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-280REKAREARRRRSAQNSAKLEKEKAKEKQK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0045027  F:DNA end binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG spo:SPAC10F6.08c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MENPPYHVSISKSEEIKYRQKCKDLKARIQEIQKGNQELLSKYEVIRRAVKRGRLERAILMEQLELQSEAKSREFGQRSEPSPPPPPEGIKIKISTKGAGNPSAKKLKISTEETSDTNVALNNTSEISHKSSNNSQPKDASVNDTDADFEQQNQVVQSKDEKITNTDPIPSPIITNLKTESSKSSGAKKATSNAKITDTMLFNHFSSIQKPKLKAEGSTLKGQALKKTLEDTWNNLTEEEKKPYHEGLLAAREKAREARRRRSAQNSAKLEKEKAKEKQKDKDQEQDTVSDKNQIDEIEKGQKEVDEEPVSEPTTSPILPPKNQEPIRMGGFTVVNRSSNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.54
4 0.57
5 0.6
6 0.62
7 0.69
8 0.73
9 0.75
10 0.79
11 0.8
12 0.8
13 0.81
14 0.82
15 0.79
16 0.8
17 0.79
18 0.74
19 0.72
20 0.68
21 0.6
22 0.52
23 0.48
24 0.43
25 0.36
26 0.34
27 0.29
28 0.23
29 0.22
30 0.28
31 0.29
32 0.3
33 0.38
34 0.38
35 0.44
36 0.5
37 0.56
38 0.6
39 0.64
40 0.68
41 0.64
42 0.64
43 0.58
44 0.57
45 0.52
46 0.43
47 0.36
48 0.28
49 0.23
50 0.2
51 0.17
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.16
60 0.24
61 0.27
62 0.27
63 0.34
64 0.38
65 0.4
66 0.45
67 0.47
68 0.42
69 0.48
70 0.49
71 0.46
72 0.42
73 0.42
74 0.41
75 0.44
76 0.43
77 0.39
78 0.4
79 0.37
80 0.39
81 0.38
82 0.35
83 0.31
84 0.33
85 0.32
86 0.36
87 0.37
88 0.35
89 0.41
90 0.45
91 0.43
92 0.38
93 0.37
94 0.36
95 0.38
96 0.4
97 0.36
98 0.35
99 0.37
100 0.36
101 0.37
102 0.31
103 0.24
104 0.19
105 0.17
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.14
115 0.17
116 0.18
117 0.21
118 0.27
119 0.36
120 0.44
121 0.45
122 0.42
123 0.39
124 0.41
125 0.41
126 0.35
127 0.3
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.13
134 0.15
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.23
152 0.21
153 0.21
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.17
158 0.14
159 0.13
160 0.16
161 0.14
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.26
172 0.29
173 0.3
174 0.32
175 0.31
176 0.34
177 0.38
178 0.4
179 0.36
180 0.33
181 0.33
182 0.31
183 0.31
184 0.28
185 0.21
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.15
194 0.2
195 0.25
196 0.28
197 0.3
198 0.32
199 0.37
200 0.38
201 0.35
202 0.37
203 0.39
204 0.37
205 0.41
206 0.39
207 0.34
208 0.37
209 0.37
210 0.32
211 0.28
212 0.26
213 0.22
214 0.24
215 0.24
216 0.27
217 0.27
218 0.28
219 0.3
220 0.32
221 0.32
222 0.29
223 0.28
224 0.27
225 0.3
226 0.31
227 0.27
228 0.25
229 0.27
230 0.28
231 0.28
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.28
236 0.27
237 0.26
238 0.27
239 0.26
240 0.25
241 0.31
242 0.35
243 0.36
244 0.43
245 0.52
246 0.61
247 0.68
248 0.75
249 0.77
250 0.79
251 0.8
252 0.82
253 0.8
254 0.73
255 0.72
256 0.68
257 0.63
258 0.59
259 0.55
260 0.54
261 0.55
262 0.62
263 0.66
264 0.71
265 0.76
266 0.79
267 0.84
268 0.8
269 0.81
270 0.74
271 0.71
272 0.65
273 0.59
274 0.51
275 0.45
276 0.4
277 0.38
278 0.34
279 0.29
280 0.28
281 0.24
282 0.24
283 0.22
284 0.26
285 0.28
286 0.28
287 0.28
288 0.27
289 0.27
290 0.27
291 0.26
292 0.29
293 0.22
294 0.24
295 0.25
296 0.28
297 0.28
298 0.25
299 0.24
300 0.18
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.23
305 0.28
306 0.31
307 0.38
308 0.42
309 0.5
310 0.52
311 0.56
312 0.51
313 0.5
314 0.51
315 0.46
316 0.39
317 0.32
318 0.33
319 0.29
320 0.31
321 0.28