Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7T0P4

Protein Details
Accession R7T0P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-274INKDVDKKSKFSRKRHNEDEGDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-76RKKKLEELRKKMRSSAKANRA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_136310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSSGLTGTAEKAGEMLNKLVDAAEDFVDEMNPTHEDEQEGGAEGAEDGDADAMAARKKKLEELRKKMRSSAKANRASVIEESAKAKMTAREAARLERQRKLAETLRQKADAEERGEDMERQKNWEYTIEENDEWEKKLAKKARRADFSFNDDADAARRKYKKDLDHLKPDLESYNRQKEIALGLAAGTLTKQGQASGSSAVTAFDPSSGVMTGPTSLQQQLAAENLYRDANSLLYADNKPSEDAIDRVISKINKDVDKKSKFSRKRHNEDEGDITYINERNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.03
37 0.03
38 0.04
39 0.06
40 0.09
41 0.12
42 0.13
43 0.16
44 0.17
45 0.25
46 0.34
47 0.44
48 0.52
49 0.6
50 0.7
51 0.76
52 0.77
53 0.77
54 0.76
55 0.73
56 0.72
57 0.72
58 0.71
59 0.71
60 0.71
61 0.65
62 0.57
63 0.51
64 0.42
65 0.36
66 0.27
67 0.2
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.17
72 0.18
73 0.16
74 0.18
75 0.23
76 0.22
77 0.28
78 0.28
79 0.32
80 0.39
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.47
85 0.43
86 0.44
87 0.45
88 0.43
89 0.43
90 0.49
91 0.51
92 0.5
93 0.5
94 0.48
95 0.44
96 0.42
97 0.39
98 0.32
99 0.26
100 0.23
101 0.22
102 0.23
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.22
108 0.24
109 0.23
110 0.24
111 0.27
112 0.25
113 0.22
114 0.26
115 0.25
116 0.23
117 0.23
118 0.24
119 0.21
120 0.19
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.22
125 0.28
126 0.33
127 0.41
128 0.49
129 0.56
130 0.61
131 0.63
132 0.63
133 0.6
134 0.6
135 0.53
136 0.44
137 0.36
138 0.29
139 0.25
140 0.2
141 0.2
142 0.14
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.27
147 0.34
148 0.37
149 0.44
150 0.53
151 0.55
152 0.63
153 0.63
154 0.58
155 0.51
156 0.46
157 0.38
158 0.3
159 0.29
160 0.26
161 0.32
162 0.32
163 0.32
164 0.31
165 0.29
166 0.28
167 0.24
168 0.17
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.26
239 0.29
240 0.32
241 0.36
242 0.45
243 0.5
244 0.55
245 0.59
246 0.63
247 0.68
248 0.71
249 0.76
250 0.79
251 0.8
252 0.83
253 0.87
254 0.87
255 0.82
256 0.77
257 0.74
258 0.65
259 0.57
260 0.46
261 0.38
262 0.31
263 0.3
264 0.26
265 0.24
266 0.22
267 0.26
268 0.33
269 0.41
270 0.41
271 0.45
272 0.54
273 0.58
274 0.65
275 0.67
276 0.69
277 0.67
278 0.7
279 0.73
280 0.66
281 0.6
282 0.55
283 0.52
284 0.47
285 0.44
286 0.41
287 0.36
288 0.36
289 0.33