Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SYD7

Protein Details
Accession R7SYD7    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-335EVEAEKEKPKKKPKASADEAAHydrophilic
355-379EPAPPTSEPAKKKRRKSTAEAEPAPHydrophilic
392-417AAPTDTAPEKKKRRKSQAASEPPAVVHydrophilic
432-457EADAPLPRRKRSARKPAPLSPKRLLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-373AAVAAAKEADPKVKGKKRVAEEVEAEKEKPKKKPKASADEAAPTPAKAKGKAIAAPAAPAVEPAPPTSEPAKKKRRKSTA
399-407PEKKKRRKS
437-454LPRRKRSARKPAPLSPKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.833, cyto 12.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_106615  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPESTLIDDHVSLQQCKRAVDALLTHATKFEEAKAESELLPGKEQNVWLVVNTKVMHPEKKLKPARIPVKYPIVDPRTSPVCLIVKDPQREYKDLIASQGIKFISRVVDIRHLKGKWKPFEARRLLLKENGLFLADERVVPLLPNLLGKIFFKAKKQPIPVCVTRKDLKGELERAISSTYFHQNQGTCTSVKIGTVSQKPAQVLTNLQTALPEVVKHIKGGWDNVQSFFLKTNSSAALPIWQCDLGTETGARWDGLVVSEKDEDEDMDDDEESDEDEDMKVDAPANAGAKAKAAAVAAAKEADPKVKGKKRVAEEVEAEKEKPKKKPKASADEAAPTPAKAKGKAIAAPAAPAVEPAPPTSEPAKKKRRKSTAEAEPAPAVAPAPASKPAVAAPTDTAPEKKKRRKSQAASEPPAVVSGPAAAPAQPAPAAEADAPLPRRKRSARKPAPLSPKRLLPLPPLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.31
4 0.31
5 0.28
6 0.26
7 0.27
8 0.27
9 0.28
10 0.34
11 0.34
12 0.32
13 0.3
14 0.3
15 0.27
16 0.25
17 0.22
18 0.21
19 0.21
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.24
24 0.26
25 0.28
26 0.23
27 0.24
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.19
35 0.17
36 0.19
37 0.18
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.25
42 0.3
43 0.33
44 0.36
45 0.46
46 0.48
47 0.58
48 0.65
49 0.64
50 0.69
51 0.75
52 0.79
53 0.77
54 0.76
55 0.72
56 0.74
57 0.67
58 0.61
59 0.6
60 0.55
61 0.48
62 0.43
63 0.43
64 0.37
65 0.36
66 0.34
67 0.3
68 0.29
69 0.28
70 0.31
71 0.33
72 0.37
73 0.41
74 0.45
75 0.48
76 0.48
77 0.5
78 0.5
79 0.48
80 0.46
81 0.41
82 0.4
83 0.36
84 0.34
85 0.31
86 0.32
87 0.26
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.25
96 0.27
97 0.31
98 0.37
99 0.36
100 0.4
101 0.45
102 0.51
103 0.48
104 0.53
105 0.58
106 0.58
107 0.67
108 0.69
109 0.68
110 0.66
111 0.65
112 0.6
113 0.55
114 0.52
115 0.42
116 0.37
117 0.32
118 0.25
119 0.19
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.13
137 0.17
138 0.19
139 0.23
140 0.32
141 0.39
142 0.45
143 0.53
144 0.54
145 0.54
146 0.59
147 0.63
148 0.6
149 0.56
150 0.55
151 0.51
152 0.49
153 0.46
154 0.41
155 0.39
156 0.38
157 0.38
158 0.34
159 0.32
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.2
164 0.15
165 0.15
166 0.18
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.24
173 0.23
174 0.18
175 0.16
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.16
182 0.19
183 0.23
184 0.23
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.17
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.17
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.23
212 0.24
213 0.21
214 0.21
215 0.2
216 0.16
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.13
225 0.12
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.12
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.09
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.15
292 0.25
293 0.31
294 0.39
295 0.44
296 0.51
297 0.54
298 0.62
299 0.62
300 0.57
301 0.55
302 0.52
303 0.52
304 0.45
305 0.41
306 0.36
307 0.39
308 0.4
309 0.45
310 0.5
311 0.54
312 0.62
313 0.71
314 0.76
315 0.8
316 0.81
317 0.78
318 0.72
319 0.67
320 0.59
321 0.52
322 0.42
323 0.32
324 0.27
325 0.24
326 0.22
327 0.18
328 0.2
329 0.21
330 0.24
331 0.27
332 0.28
333 0.28
334 0.26
335 0.26
336 0.24
337 0.2
338 0.16
339 0.13
340 0.11
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.12
345 0.12
346 0.16
347 0.2
348 0.27
349 0.33
350 0.43
351 0.54
352 0.58
353 0.68
354 0.76
355 0.82
356 0.82
357 0.84
358 0.84
359 0.84
360 0.86
361 0.78
362 0.71
363 0.6
364 0.52
365 0.44
366 0.33
367 0.22
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.1
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.16
381 0.17
382 0.19
383 0.2
384 0.23
385 0.25
386 0.35
387 0.44
388 0.52
389 0.61
390 0.7
391 0.79
392 0.86
393 0.9
394 0.91
395 0.92
396 0.92
397 0.88
398 0.81
399 0.71
400 0.6
401 0.51
402 0.4
403 0.29
404 0.18
405 0.13
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.13
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.18
422 0.21
423 0.27
424 0.31
425 0.32
426 0.41
427 0.5
428 0.59
429 0.64
430 0.73
431 0.77
432 0.83
433 0.88
434 0.89
435 0.91
436 0.89
437 0.86
438 0.8
439 0.77
440 0.69
441 0.66
442 0.6
443 0.56