Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SHV4

Protein Details
Accession R7SHV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-236CGEKGHIQRNCKKPPRGQQAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-206IKGWGRRGERVAADRRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7, mito 7, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_176113  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSAIDSKLLSQLAPRDYDGKEAQAGLRFAAMAKLYHTQLVASSIAANLAWIMVLNKLTDDATRWAGPHIIDLADGKIVWLNVDAFETAFKAHFCAVDDKKAALSELVKLCKASHKLGTAKDYTANFNAIAARTPLSDEDKRARYVDGLPYKIQNEFAVTAHKVDTLEKAQKVALRMDQQLAERAEAMPKIKGWGRRGERVAADRRGPEKRSCFNCGEKGHIQRNCKKPPRGQQAAASTATPPNPTPSSNPSTSDELVALRSQLKELSDRIAAVSLAKEKEGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.27
4 0.34
5 0.32
6 0.28
7 0.26
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.27
12 0.21
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.1
19 0.13
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.15
28 0.11
29 0.11
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.11
47 0.13
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.17
82 0.19
83 0.23
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.23
88 0.21
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.23
98 0.26
99 0.23
100 0.22
101 0.26
102 0.3
103 0.33
104 0.36
105 0.32
106 0.3
107 0.31
108 0.28
109 0.25
110 0.22
111 0.2
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.13
123 0.13
124 0.16
125 0.21
126 0.23
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.19
131 0.21
132 0.26
133 0.25
134 0.25
135 0.24
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.23
140 0.15
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.22
166 0.25
167 0.24
168 0.2
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.16
178 0.22
179 0.24
180 0.33
181 0.37
182 0.44
183 0.46
184 0.47
185 0.48
186 0.48
187 0.52
188 0.47
189 0.45
190 0.42
191 0.45
192 0.47
193 0.47
194 0.47
195 0.47
196 0.51
197 0.54
198 0.55
199 0.55
200 0.55
201 0.59
202 0.54
203 0.54
204 0.52
205 0.55
206 0.58
207 0.58
208 0.6
209 0.61
210 0.69
211 0.73
212 0.75
213 0.75
214 0.75
215 0.81
216 0.83
217 0.83
218 0.77
219 0.75
220 0.72
221 0.68
222 0.6
223 0.5
224 0.41
225 0.35
226 0.32
227 0.26
228 0.2
229 0.21
230 0.22
231 0.24
232 0.27
233 0.32
234 0.37
235 0.37
236 0.4
237 0.39
238 0.42
239 0.41
240 0.37
241 0.31
242 0.25
243 0.24
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.19
252 0.2
253 0.23
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.19
259 0.17
260 0.19
261 0.2
262 0.19