Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SMI9

Protein Details
Accession R7SMI9    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38SSPAKSSRTSRQKAAPKQPLPHydrophilic
245-267QAPSETQKPRKVRMKRVPKGVVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-302KPRKVRMKRVPKGVVPGVTPPPDPERWLKKSERTTSGQGGRRRKGGAGGGA
310-326TGGAGGKKSGGGKGKKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_71995  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MPPRPATKPTTKSGPQKSSPAKSSRTSRQKAAPKQPLPVADRLKRLFTSLCAQIDGGHFANAIKTCDKILRLDKHDPDALQTKLFLLLQTDQYAAALAMADAPSGLPGDTESTVKDHTFEKAYSLYRLHREADASEAMKELKDRSDEVDRGVLHLEAQLAYRQGNYQTAFELYNQLLDTADPNSEEHSDILTNLEAAQKHVDFLTSGFLHALDALPPAVSSTLESAPPPVAQPHQQQQAVLASAQAPSETQKPRKVRMKRVPKGVVPGVTPPPDPERWLKKSERTTSGQGGRRRKGGAGGGATQGAMESTGGAGGKKSGGGKGKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.7
3 0.75
4 0.78
5 0.77
6 0.76
7 0.73
8 0.68
9 0.67
10 0.71
11 0.71
12 0.73
13 0.7
14 0.69
15 0.71
16 0.76
17 0.79
18 0.81
19 0.81
20 0.74
21 0.75
22 0.73
23 0.71
24 0.65
25 0.63
26 0.61
27 0.56
28 0.6
29 0.57
30 0.56
31 0.49
32 0.48
33 0.4
34 0.35
35 0.34
36 0.32
37 0.31
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.26
42 0.26
43 0.21
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.17
48 0.16
49 0.17
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.19
54 0.2
55 0.23
56 0.3
57 0.36
58 0.42
59 0.5
60 0.52
61 0.53
62 0.55
63 0.49
64 0.44
65 0.41
66 0.36
67 0.28
68 0.24
69 0.2
70 0.19
71 0.19
72 0.15
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.09
82 0.07
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.04
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.26
115 0.25
116 0.22
117 0.22
118 0.2
119 0.2
120 0.19
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.14
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.23
136 0.2
137 0.2
138 0.2
139 0.16
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.17
219 0.23
220 0.29
221 0.35
222 0.36
223 0.35
224 0.35
225 0.35
226 0.31
227 0.25
228 0.18
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.07
234 0.08
235 0.16
236 0.23
237 0.28
238 0.36
239 0.41
240 0.51
241 0.6
242 0.68
243 0.72
244 0.75
245 0.81
246 0.81
247 0.86
248 0.84
249 0.77
250 0.76
251 0.7
252 0.62
253 0.52
254 0.49
255 0.44
256 0.39
257 0.36
258 0.31
259 0.31
260 0.3
261 0.31
262 0.35
263 0.39
264 0.42
265 0.49
266 0.52
267 0.56
268 0.64
269 0.69
270 0.67
271 0.64
272 0.65
273 0.67
274 0.7
275 0.68
276 0.66
277 0.68
278 0.66
279 0.65
280 0.61
281 0.53
282 0.5
283 0.48
284 0.47
285 0.41
286 0.39
287 0.36
288 0.34
289 0.32
290 0.26
291 0.2
292 0.13
293 0.09
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.13
305 0.18
306 0.27