FuNGI

R7T058

Protein Details

Accession

R7T058

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-30	IDTARPSKAKGKDKEKEKKSKSSSGGQKS	Hydrophilic
359-382	SGAGVERKSRRERDKDKDKDKDGA	Basic
394-414	EAPPAPRQKEEKRERGPRGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-25	RPSKAKGKDKEKEKKSKSSS
224-259	TKKGDKKKDAAGGGKDKMADSGASKKAAKKAAAAAK
291-301	SKPPKAPRERK
368-369	RR
402-411	KEEKRERGPR
466-485	GGRGRGRGRGRGRGRGAPPQ

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	dsq:DICSQDRAFT_136334 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MIDTARPSKAKGKDKEKEKKSKSSSGGQKSQTERLKTVVRRLPPNLPEDIFWQSVGKWVTDETVTWKAYYQGKFKTRLNKENIPSRAYIAFRDEEILATFSREYDGHLFRDKNGNESIAIVEFAPFQKVPNEKKKADSRAGTIEKDEDYISFLESLKEVSSKPFDLDTLETLIASTQPAPLPTTTPLLEALKAEKSAQKDKESILRNHAHYKDPAALAAAAAATKKGDKKKDAAGGGKDKMADSGASKKAAKKAAAAAKAAAHQQQGQAQAGASKDVKATAATSANKQGASKPPKAPRERKGTASGPSVSSSASTSGSAAAPAPASAAPFAAEDYAGIPMRCACPVLSIASRQFEAALSGAGVERKSRRERDKDKDKDKDGAVASTTSSTVVAEAPPAPRQKEEKRERGPRGGGVPTGILQRDAAPPKILARPAQGQTTSEGSAPASAASVALGATDGGDPGTPGGGRGRGRGRGRGRGRGAPPQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.86
3	0.88
4	0.89
5	0.87
6	0.88
7	0.85
8	0.86
9	0.81
10	0.8
11	0.8
12	0.79
13	0.8
14	0.75
15	0.75
16	0.7
17	0.73
18	0.71
19	0.65
20	0.57
21	0.54
22	0.58
23	0.55
24	0.59
25	0.57
26	0.57
27	0.6
28	0.63
29	0.67
30	0.62
31	0.61
32	0.57
33	0.51
34	0.45
35	0.41
36	0.4
37	0.32
38	0.27
39	0.24
40	0.19
41	0.24
42	0.23
43	0.2
44	0.15
45	0.15
46	0.16
47	0.16
48	0.17
49	0.17
50	0.22
51	0.23
52	0.22
53	0.23
54	0.26
55	0.33
56	0.37
57	0.38
58	0.41
59	0.46
60	0.52
61	0.57
62	0.63
63	0.65
64	0.69
65	0.7
66	0.7
67	0.7
68	0.74
69	0.73
70	0.65
71	0.57
72	0.51
73	0.47
74	0.39
75	0.34
76	0.29
77	0.26
78	0.23
79	0.24
80	0.21
81	0.17
82	0.17
83	0.17
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.1
88	0.11
89	0.1
90	0.12
91	0.17
92	0.2
93	0.22
94	0.28
95	0.29
96	0.29
97	0.39
98	0.36
99	0.33
100	0.32
101	0.3
102	0.24
103	0.24
104	0.23
105	0.14
106	0.15
107	0.1
108	0.09
109	0.09
110	0.09
111	0.11
112	0.1
113	0.1
114	0.15
115	0.22
116	0.3
117	0.39
118	0.47
119	0.46
120	0.54
121	0.62
122	0.65
123	0.66
124	0.6
125	0.54
126	0.56
127	0.58
128	0.51
129	0.44
130	0.38
131	0.3
132	0.28
133	0.24
134	0.14
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.11
147	0.14
148	0.14
149	0.15
150	0.15
151	0.14
152	0.15
153	0.16
154	0.15
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.11
169	0.12
170	0.15
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.14
175	0.15
176	0.13
177	0.14
178	0.12
179	0.13
180	0.13
181	0.14
182	0.17
183	0.24
184	0.28
185	0.29
186	0.29
187	0.3
188	0.37
189	0.4
190	0.38
191	0.38
192	0.39
193	0.39
194	0.45
195	0.45
196	0.41
197	0.35
198	0.35
199	0.31
200	0.26
201	0.24
202	0.17
203	0.14
204	0.11
205	0.11
206	0.08
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.06
212	0.1
213	0.16
214	0.21
215	0.23
216	0.27
217	0.33
218	0.38
219	0.41
220	0.4
221	0.4
222	0.41
223	0.4
224	0.37
225	0.32
226	0.25
227	0.22
228	0.17
229	0.13
230	0.08
231	0.14
232	0.15
233	0.17
234	0.18
235	0.2
236	0.25
237	0.29
238	0.28
239	0.23
240	0.28
241	0.32
242	0.34
243	0.32
244	0.27
245	0.24
246	0.25
247	0.25
248	0.2
249	0.14
250	0.12
251	0.13
252	0.15
253	0.16
254	0.15
255	0.14
256	0.12
257	0.13
258	0.12
259	0.13
260	0.11
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.13
269	0.14
270	0.15
271	0.19
272	0.2
273	0.2
274	0.2
275	0.21
276	0.26
277	0.31
278	0.36
279	0.4
280	0.47
281	0.55
282	0.65
283	0.69
284	0.68
285	0.72
286	0.69
287	0.65
288	0.64
289	0.59
290	0.54
291	0.49
292	0.43
293	0.34
294	0.32
295	0.28
296	0.21
297	0.17
298	0.14
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.08
331	0.09
332	0.11
333	0.14
334	0.15
335	0.17
336	0.19
337	0.2
338	0.21
339	0.19
340	0.18
341	0.14
342	0.14
343	0.1
344	0.08
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.11
351	0.14
352	0.21
353	0.29
354	0.37
355	0.46
356	0.56
357	0.65
358	0.73
359	0.81
360	0.84
361	0.87
362	0.87
363	0.82
364	0.78
365	0.69
366	0.65
367	0.56
368	0.47
369	0.38
370	0.29
371	0.25
372	0.19
373	0.19
374	0.12
375	0.11
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.08
381	0.1
382	0.12
383	0.17
384	0.22
385	0.23
386	0.26
387	0.34
388	0.42
389	0.51
390	0.59
391	0.64
392	0.7
393	0.79
394	0.82
395	0.83
396	0.78
397	0.71
398	0.67
399	0.59
400	0.5
401	0.41
402	0.34
403	0.27
404	0.27
405	0.22
406	0.17
407	0.14
408	0.16
409	0.22
410	0.25
411	0.26
412	0.24
413	0.25
414	0.28
415	0.33
416	0.34
417	0.29
418	0.31
419	0.37
420	0.38
421	0.43
422	0.4
423	0.35
424	0.35
425	0.36
426	0.32
427	0.24
428	0.22
429	0.16
430	0.16
431	0.15
432	0.12
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.08
450	0.07
451	0.08
452	0.11
453	0.17
454	0.19
455	0.26
456	0.32
457	0.39
458	0.44
459	0.53
460	0.57
461	0.62
462	0.68
463	0.72
464	0.72
465	0.72
466	0.73

R7T058

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer