Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42904

Protein Details
Accession O42904    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-393LPVPDDRPKRRRGGRRIRKMKEQYAVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-387RPKRRRGGRRIRKMK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
IPR012976  NOSIC  
IPR027105  Prp31  
IPR019175  Prp31_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0097526  C:spliceosomal tri-snRNP complex  
GO:0005687  C:U4 snRNP  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
KEGG spo:SPBC119.13c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PF09785  Prp31_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MSLADELLADLDDIEETTESTITDELGPDAKKRRLELQLEEGNGISAELENDLDITKISDSAQKLPSEVANKFNDNNENIYQLLNSTRLRDIIEGTEKYKGTEKQAITGNIEDDLEYHLIVDSNSIAMEIDDEILRLHRLVKEWYHDRFPELSSLVLNAFDYCKTVSSLLNDLDNSKTKLSFLPSATVMVIATTATTTVGKPLPDEMIKNVKNCCEAIQQLGEEKQKIIEYVQSRISVVAPNLSAVVGSTTAANLIGIAGGLTRLGKFPACNLPALGKRRLTTIGINNPAVSGDYGFLYMSEIVQKTPPDVRKQAIRMTAAKVALAARIDSIHEYPDGSFGISARKEVERKIEKLLEPPSQKPTVALPVPDDRPKRRRGGRRIRKMKEQYAVTELRRLQNRVAFGKEEAEVFNFDETEGLGMLGQEGEGKIRAVSIDSRTKLRLPKARKAQLQSMAQKNPLAASGLQSSLSFTPIQGIELVNPLLQRQQKVEEANKWFRDGVFTQIKKDSNEPKNKFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.15
14 0.16
15 0.2
16 0.28
17 0.33
18 0.36
19 0.38
20 0.45
21 0.49
22 0.55
23 0.56
24 0.58
25 0.58
26 0.56
27 0.53
28 0.45
29 0.36
30 0.3
31 0.23
32 0.13
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.09
46 0.14
47 0.16
48 0.23
49 0.27
50 0.26
51 0.27
52 0.28
53 0.31
54 0.32
55 0.31
56 0.32
57 0.32
58 0.35
59 0.36
60 0.39
61 0.4
62 0.36
63 0.39
64 0.33
65 0.31
66 0.28
67 0.27
68 0.22
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.22
80 0.28
81 0.27
82 0.27
83 0.32
84 0.3
85 0.31
86 0.35
87 0.32
88 0.31
89 0.37
90 0.36
91 0.36
92 0.43
93 0.44
94 0.4
95 0.39
96 0.33
97 0.25
98 0.25
99 0.19
100 0.13
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.1
126 0.13
127 0.17
128 0.2
129 0.27
130 0.33
131 0.36
132 0.39
133 0.38
134 0.39
135 0.37
136 0.34
137 0.3
138 0.25
139 0.21
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.13
155 0.17
156 0.16
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.2
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.2
168 0.22
169 0.2
170 0.21
171 0.21
172 0.21
173 0.2
174 0.18
175 0.14
176 0.09
177 0.08
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.24
195 0.26
196 0.28
197 0.28
198 0.27
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.2
209 0.2
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.08
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.19
261 0.25
262 0.29
263 0.3
264 0.25
265 0.25
266 0.26
267 0.28
268 0.26
269 0.24
270 0.27
271 0.3
272 0.32
273 0.32
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.22
278 0.15
279 0.08
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.17
295 0.21
296 0.24
297 0.27
298 0.29
299 0.34
300 0.37
301 0.4
302 0.38
303 0.38
304 0.35
305 0.35
306 0.36
307 0.3
308 0.26
309 0.22
310 0.18
311 0.16
312 0.13
313 0.1
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.17
333 0.18
334 0.2
335 0.3
336 0.31
337 0.33
338 0.38
339 0.41
340 0.39
341 0.43
342 0.47
343 0.44
344 0.42
345 0.43
346 0.43
347 0.39
348 0.38
349 0.33
350 0.3
351 0.3
352 0.28
353 0.25
354 0.23
355 0.27
356 0.31
357 0.37
358 0.4
359 0.41
360 0.47
361 0.52
362 0.58
363 0.62
364 0.69
365 0.73
366 0.79
367 0.82
368 0.86
369 0.91
370 0.88
371 0.89
372 0.87
373 0.84
374 0.8
375 0.72
376 0.64
377 0.6
378 0.59
379 0.5
380 0.47
381 0.43
382 0.41
383 0.43
384 0.42
385 0.39
386 0.37
387 0.42
388 0.39
389 0.39
390 0.34
391 0.3
392 0.3
393 0.27
394 0.24
395 0.2
396 0.17
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.13
422 0.18
423 0.26
424 0.28
425 0.31
426 0.33
427 0.39
428 0.43
429 0.49
430 0.52
431 0.52
432 0.6
433 0.67
434 0.74
435 0.77
436 0.77
437 0.76
438 0.76
439 0.77
440 0.76
441 0.73
442 0.68
443 0.63
444 0.58
445 0.49
446 0.41
447 0.33
448 0.27
449 0.18
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.18
456 0.16
457 0.17
458 0.14
459 0.11
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.17
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.19
472 0.23
473 0.24
474 0.25
475 0.29
476 0.34
477 0.42
478 0.48
479 0.5
480 0.56
481 0.63
482 0.61
483 0.59
484 0.55
485 0.47
486 0.46
487 0.39
488 0.39
489 0.4
490 0.39
491 0.42
492 0.47
493 0.5
494 0.47
495 0.54
496 0.56
497 0.55
498 0.65