FuNGI

O13845

Protein Details

Accession

O13845

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-126	TNSSSHRTPRHHRRSYSPRSDY	Hydrophilic
152-172	DRSSRSSRSRHPSSRSRHRYD	Basic
174-200	YSRSPPYSSRHSRSRRRYEERSSRSSR	Hydrophilic
210-234	RDDDRSHERKRSRSRPRERSSKLSE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
155-163	SRSSRSRHP
217-230	ERKRSRSRPRERSS

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:1990446 F:U1 snRNP binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
KEGG	spo:SPAC19G12.07c -
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MQLDAEALAEAPFRKQEVPQNQENQQKASSSFHESSLTSSTHSHPSNPPPPPTRLHDRSFKPVSKNYESEGRLTPPPVSMGYRYARSSKQSFQREDSGYNDDVVTNSSSHRTPRHHRRSYSPRSDYGSRSPSPHSSVDSHQSRSPVRSRDRDRSSRSSRSRHPSSRSRHRYDDYSRSPPYSSRHSRSRRRYEERSSRSSRAHDYDYEDLRDDDRSHERKRSRSRPRERSSKLSEEERDRRTVFVSQLANRLTSRELYDFFEQAGPVRDAQIVRDKISGRSKGVAYVEFCHEDSVQAAIALSGKRLLGLPVIVQLTEAEKNRKAREAAELARAASAEIPFHRLCVSNIHFNLTDEDVKAIFEPFGDIEFVHLQRDDQNRSKGFGYIQYRNPISARNALEKMNGFDLAGRNMRVCLGNDKFTTETTSSMLKRFDETLARQERSQPSQRNGGSSTYESQDYREAAPLSPTEEESRPITRDELMKKLARSEDISDNSKLVSEPEPPIRSRCALLENMFNPAEETSPNWVQELEQDVKEECDEKYGKVVHIAVVPNELGQIFVKFENADFAEKAITGLHQRWFGGRTIKASILPETDYYFKFPNAKTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.2
3	0.3
4	0.39
5	0.45
6	0.52
7	0.58
8	0.63
9	0.7
10	0.68
11	0.62
12	0.53
13	0.49
14	0.43
15	0.41
16	0.37
17	0.37
18	0.35
19	0.34
20	0.34
21	0.32
22	0.32
23	0.31
24	0.28
25	0.21
26	0.23
27	0.24
28	0.29
29	0.3
30	0.32
31	0.35
32	0.44
33	0.51
34	0.55
35	0.6
36	0.58
37	0.61
38	0.62
39	0.62
40	0.63
41	0.61
42	0.61
43	0.62
44	0.62
45	0.67
46	0.7
47	0.69
48	0.66
49	0.66
50	0.69
51	0.67
52	0.64
53	0.58
54	0.58
55	0.53
56	0.5
57	0.46
58	0.42
59	0.37
60	0.36
61	0.34
62	0.26
63	0.26
64	0.25
65	0.24
66	0.22
67	0.25
68	0.28
69	0.31
70	0.32
71	0.35
72	0.36
73	0.4
74	0.43
75	0.45
76	0.51
77	0.56
78	0.59
79	0.59
80	0.63
81	0.6
82	0.57
83	0.53
84	0.49
85	0.4
86	0.36
87	0.31
88	0.23
89	0.2
90	0.19
91	0.16
92	0.11
93	0.11
94	0.13
95	0.15
96	0.19
97	0.25
98	0.31
99	0.41
100	0.52
101	0.62
102	0.68
103	0.71
104	0.77
105	0.82
106	0.85
107	0.85
108	0.79
109	0.73
110	0.71
111	0.71
112	0.65
113	0.63
114	0.59
115	0.5
116	0.47
117	0.46
118	0.44
119	0.43
120	0.4
121	0.36
122	0.32
123	0.34
124	0.41
125	0.41
126	0.4
127	0.38
128	0.4
129	0.39
130	0.41
131	0.44
132	0.43
133	0.47
134	0.54
135	0.59
136	0.65
137	0.72
138	0.75
139	0.76
140	0.78
141	0.78
142	0.78
143	0.79
144	0.77
145	0.76
146	0.77
147	0.79
148	0.77
149	0.76
150	0.75
151	0.77
152	0.81
153	0.81
154	0.79
155	0.76
156	0.72
157	0.73
158	0.71
159	0.71
160	0.67
161	0.65
162	0.61
163	0.55
164	0.52
165	0.48
166	0.44
167	0.44
168	0.45
169	0.44
170	0.52
171	0.6
172	0.69
173	0.76
174	0.83
175	0.83
176	0.83
177	0.85
178	0.86
179	0.87
180	0.84
181	0.82
182	0.78
183	0.73
184	0.68
185	0.63
186	0.58
187	0.51
188	0.47
189	0.4
190	0.39
191	0.4
192	0.38
193	0.36
194	0.31
195	0.27
196	0.24
197	0.23
198	0.19
199	0.17
200	0.24
201	0.29
202	0.31
203	0.39
204	0.44
205	0.52
206	0.61
207	0.68
208	0.7
209	0.75
210	0.83
211	0.86
212	0.89
213	0.9
214	0.85
215	0.83
216	0.79
217	0.76
218	0.69
219	0.64
220	0.61
221	0.59
222	0.61
223	0.55
224	0.52
225	0.45
226	0.42
227	0.37
228	0.35
229	0.27
230	0.26
231	0.26
232	0.24
233	0.28
234	0.28
235	0.27
236	0.24
237	0.24
238	0.19
239	0.16
240	0.16
241	0.13
242	0.14
243	0.17
244	0.18
245	0.17
246	0.17
247	0.16
248	0.14
249	0.13
250	0.15
251	0.12
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.11
256	0.13
257	0.2
258	0.19
259	0.19
260	0.23
261	0.22
262	0.26
263	0.33
264	0.33
265	0.26
266	0.28
267	0.27
268	0.27
269	0.27
270	0.24
271	0.19
272	0.18
273	0.19
274	0.17
275	0.17
276	0.15
277	0.14
278	0.12
279	0.11
280	0.09
281	0.07
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.11
303	0.12
304	0.13
305	0.17
306	0.21
307	0.22
308	0.26
309	0.25
310	0.23
311	0.27
312	0.3
313	0.29
314	0.3
315	0.29
316	0.26
317	0.25
318	0.24
319	0.18
320	0.13
321	0.11
322	0.07
323	0.07
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.19
331	0.21
332	0.24
333	0.24
334	0.27
335	0.26
336	0.26
337	0.27
338	0.21
339	0.2
340	0.13
341	0.13
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.07
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.16
360	0.21
361	0.25
362	0.28
363	0.35
364	0.35
365	0.37
366	0.38
367	0.33
368	0.29
369	0.31
370	0.32
371	0.31
372	0.34
373	0.38
374	0.37
375	0.37
376	0.36
377	0.32
378	0.29
379	0.3
380	0.28
381	0.28
382	0.3
383	0.29
384	0.31
385	0.29
386	0.28
387	0.22
388	0.19
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.16
393	0.16
394	0.15
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.15
400	0.19
401	0.2
402	0.25
403	0.24
404	0.27
405	0.27
406	0.26
407	0.28
408	0.21
409	0.19
410	0.16
411	0.21
412	0.2
413	0.22
414	0.23
415	0.2
416	0.21
417	0.22
418	0.23
419	0.23
420	0.25
421	0.31
422	0.37
423	0.38
424	0.36
425	0.42
426	0.45
427	0.47
428	0.53
429	0.51
430	0.47
431	0.55
432	0.55
433	0.52
434	0.48
435	0.43
436	0.37
437	0.33
438	0.32
439	0.25
440	0.26
441	0.23
442	0.22
443	0.23
444	0.21
445	0.2
446	0.21
447	0.21
448	0.19
449	0.21
450	0.2
451	0.19
452	0.18
453	0.19
454	0.18
455	0.18
456	0.2
457	0.21
458	0.24
459	0.22
460	0.23
461	0.23
462	0.22
463	0.28
464	0.3
465	0.32
466	0.35
467	0.38
468	0.37
469	0.41
470	0.4
471	0.36
472	0.36
473	0.34
474	0.37
475	0.38
476	0.41
477	0.37
478	0.34
479	0.31
480	0.29
481	0.24
482	0.18
483	0.16
484	0.16
485	0.2
486	0.28
487	0.31
488	0.32
489	0.35
490	0.37
491	0.36
492	0.34
493	0.32
494	0.28
495	0.3
496	0.31
497	0.35
498	0.32
499	0.35
500	0.34
501	0.31
502	0.27
503	0.22
504	0.21
505	0.13
506	0.15
507	0.17
508	0.2
509	0.21
510	0.2
511	0.2
512	0.19
513	0.22
514	0.26
515	0.23
516	0.21
517	0.22
518	0.22
519	0.23
520	0.24
521	0.22
522	0.16
523	0.19
524	0.2
525	0.19
526	0.25
527	0.27
528	0.26
529	0.29
530	0.3
531	0.25
532	0.29
533	0.3
534	0.24
535	0.24
536	0.23
537	0.19
538	0.19
539	0.16
540	0.12
541	0.11
542	0.11
543	0.1
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.17
549	0.18
550	0.2
551	0.18
552	0.18
553	0.18
554	0.18
555	0.18
556	0.13
557	0.13
558	0.15
559	0.19
560	0.22
561	0.24
562	0.25
563	0.27
564	0.29
565	0.31
566	0.34
567	0.33
568	0.33
569	0.35
570	0.37
571	0.37
572	0.37
573	0.36
574	0.31
575	0.3
576	0.28
577	0.27
578	0.29
579	0.27
580	0.29
581	0.28
582	0.29
583	0.34

O13845

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer