Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O59719

Protein Details
Accession O59719    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
847-868SQVVSGKYGSRPSKKKKKRSGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
856-867SRPSKKKKKRSG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019350  RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0001179  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor binding  
GO:0001163  F:RNA polymerase I transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
GO:0006361  P:transcription initiation at RNA polymerase I promoter  
KEGG spo:SPBC3B8.11  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10214  Rrn6  
Amino Acid Sequences MSTWPIDAISKKPSVSLDYGIIGACQLLNPSGYHRAEKVENNEWTFARYDSYTGVELVDLDKRWDILSLNPNYKLPKLTELPAEATNSTRKATSSSFGLSVCRYVPRNLFSTLAKESQLASSAESIYNPHILNTFCLGKTAPSDKNRYTTTECLACSKISNETAENLLFLCLSSPWIFRASPTLQNTATFEEFPFYLNVSAFEFAEDPIWKFSQPVRQLVFSNGEPSLLFALSSCELVIFQVTYDLMFLDEPNTPGCLSAIPLRFLYADDVYNSDSFANVSVHPTDNSFFLTTSSSGRWTIWQFLDDGYRECFGSSFKESLQQALCSAPTSSIAYHEEEINPDNTIYRAKWEEYFGGVILHNAFFILHVSLGEVPDFHLLFHCSSDVRILQVVNESMPIKSEFFILTTESVLWMDIQHPQKPLLEWKHNRKLDPTLKITVTATFSQNIYVSVYSQMNGVVQQIHFSKDRALPVSGSHPFLLLNEVQVPIRSLIIQPCYFFESSEFDRQGPFDSPFWSAIIDKADGSLSLHILCEKSSLKIYNLEELTGSSQVAMKFKTITPSVNTSEDDSANDQEIISTPNSDFQQLSLSRLYHVLCSNRNKKNTITLDEFASKVPDFVEAFDSINHDVIITLSELYDGFPLKGTFTNVAEIISHLEGTELSFYFPYMFGINYNNASFFYTSVDSIASLIHRRWESNTDKSVEIPCFQSSQRRSIKNVIHYLFLSSIGVSREKIFDPSLSRKEIDSTDLLTFIKPFYDTEGLELNEDVRNILENWEIGKISSTYVIGDSAVETEDPSSSQFSDFYISQQQSSVLPSSQIATVFSQEDVPNFSSLYSESSSQTIPIMSQVVSGKYGSRPSKKKKKRSGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.32
4 0.28
5 0.26
6 0.27
7 0.24
8 0.21
9 0.16
10 0.13
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.14
18 0.22
19 0.25
20 0.27
21 0.28
22 0.32
23 0.37
24 0.43
25 0.46
26 0.46
27 0.5
28 0.51
29 0.53
30 0.48
31 0.44
32 0.39
33 0.32
34 0.26
35 0.21
36 0.19
37 0.17
38 0.2
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.19
54 0.28
55 0.34
56 0.39
57 0.4
58 0.43
59 0.45
60 0.46
61 0.42
62 0.36
63 0.35
64 0.34
65 0.36
66 0.38
67 0.38
68 0.39
69 0.38
70 0.37
71 0.3
72 0.29
73 0.31
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.21
78 0.22
79 0.24
80 0.24
81 0.23
82 0.24
83 0.25
84 0.25
85 0.27
86 0.24
87 0.23
88 0.22
89 0.23
90 0.22
91 0.25
92 0.3
93 0.31
94 0.34
95 0.34
96 0.35
97 0.31
98 0.34
99 0.33
100 0.3
101 0.28
102 0.25
103 0.24
104 0.23
105 0.24
106 0.19
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.19
120 0.21
121 0.23
122 0.18
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.23
127 0.27
128 0.31
129 0.34
130 0.41
131 0.43
132 0.49
133 0.5
134 0.51
135 0.5
136 0.46
137 0.46
138 0.43
139 0.41
140 0.38
141 0.38
142 0.33
143 0.28
144 0.26
145 0.25
146 0.22
147 0.24
148 0.21
149 0.21
150 0.23
151 0.21
152 0.2
153 0.15
154 0.13
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.08
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.21
167 0.22
168 0.29
169 0.32
170 0.35
171 0.32
172 0.34
173 0.35
174 0.33
175 0.3
176 0.23
177 0.2
178 0.17
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.19
200 0.25
201 0.28
202 0.34
203 0.34
204 0.36
205 0.37
206 0.39
207 0.39
208 0.3
209 0.29
210 0.22
211 0.2
212 0.17
213 0.17
214 0.15
215 0.1
216 0.09
217 0.06
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.14
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.12
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.2
293 0.17
294 0.17
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.19
306 0.19
307 0.23
308 0.23
309 0.2
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.12
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.11
403 0.13
404 0.15
405 0.16
406 0.17
407 0.18
408 0.19
409 0.25
410 0.26
411 0.34
412 0.38
413 0.47
414 0.56
415 0.58
416 0.58
417 0.53
418 0.56
419 0.53
420 0.52
421 0.46
422 0.4
423 0.38
424 0.38
425 0.35
426 0.28
427 0.23
428 0.19
429 0.16
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.09
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.15
454 0.16
455 0.18
456 0.18
457 0.18
458 0.16
459 0.17
460 0.22
461 0.2
462 0.19
463 0.17
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.15
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.07
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.17
485 0.17
486 0.16
487 0.15
488 0.15
489 0.18
490 0.23
491 0.23
492 0.2
493 0.2
494 0.21
495 0.22
496 0.2
497 0.18
498 0.13
499 0.14
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.14
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.08
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.13
524 0.14
525 0.15
526 0.21
527 0.22
528 0.25
529 0.24
530 0.23
531 0.2
532 0.19
533 0.2
534 0.14
535 0.13
536 0.07
537 0.09
538 0.1
539 0.12
540 0.12
541 0.11
542 0.12
543 0.13
544 0.17
545 0.16
546 0.17
547 0.19
548 0.23
549 0.25
550 0.26
551 0.26
552 0.24
553 0.25
554 0.23
555 0.21
556 0.18
557 0.16
558 0.15
559 0.14
560 0.12
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.12
568 0.13
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.18
573 0.18
574 0.2
575 0.19
576 0.19
577 0.18
578 0.2
579 0.21
580 0.17
581 0.2
582 0.21
583 0.26
584 0.35
585 0.44
586 0.49
587 0.53
588 0.53
589 0.51
590 0.56
591 0.56
592 0.52
593 0.49
594 0.42
595 0.42
596 0.41
597 0.4
598 0.3
599 0.27
600 0.21
601 0.15
602 0.13
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.14
607 0.12
608 0.13
609 0.13
610 0.15
611 0.13
612 0.13
613 0.12
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.09
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.15
634 0.16
635 0.15
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.13
640 0.11
641 0.1
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.11
658 0.13
659 0.15
660 0.15
661 0.14
662 0.14
663 0.16
664 0.15
665 0.12
666 0.14
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.17
678 0.18
679 0.19
680 0.22
681 0.29
682 0.33
683 0.39
684 0.44
685 0.41
686 0.4
687 0.42
688 0.43
689 0.38
690 0.33
691 0.28
692 0.24
693 0.23
694 0.24
695 0.31
696 0.29
697 0.37
698 0.44
699 0.45
700 0.49
701 0.55
702 0.61
703 0.61
704 0.66
705 0.58
706 0.52
707 0.48
708 0.46
709 0.37
710 0.31
711 0.22
712 0.13
713 0.14
714 0.13
715 0.14
716 0.13
717 0.14
718 0.16
719 0.16
720 0.19
721 0.18
722 0.2
723 0.26
724 0.34
725 0.37
726 0.38
727 0.38
728 0.36
729 0.39
730 0.36
731 0.33
732 0.27
733 0.25
734 0.22
735 0.22
736 0.22
737 0.19
738 0.18
739 0.14
740 0.13
741 0.11
742 0.1
743 0.14
744 0.18
745 0.17
746 0.2
747 0.24
748 0.23
749 0.23
750 0.23
751 0.19
752 0.17
753 0.17
754 0.14
755 0.09
756 0.11
757 0.11
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.15
763 0.15
764 0.13
765 0.15
766 0.13
767 0.13
768 0.14
769 0.13
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.1
774 0.1
775 0.09
776 0.08
777 0.09
778 0.08
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.11
785 0.11
786 0.12
787 0.12
788 0.12
789 0.16
790 0.16
791 0.18
792 0.25
793 0.25
794 0.25
795 0.25
796 0.26
797 0.22
798 0.25
799 0.25
800 0.16
801 0.16
802 0.16
803 0.17
804 0.18
805 0.18
806 0.16
807 0.15
808 0.17
809 0.17
810 0.17
811 0.19
812 0.18
813 0.19
814 0.21
815 0.21
816 0.2
817 0.19
818 0.18
819 0.15
820 0.15
821 0.18
822 0.16
823 0.16
824 0.16
825 0.19
826 0.19
827 0.18
828 0.19
829 0.15
830 0.13
831 0.13
832 0.14
833 0.12
834 0.16
835 0.17
836 0.18
837 0.19
838 0.2
839 0.2
840 0.22
841 0.31
842 0.36
843 0.44
844 0.52
845 0.62
846 0.73
847 0.81
848 0.89