Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O94406

Protein Details
Accession O94406    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-330PSSNILKDEKKRKCLQALKRFITFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-71KKAFRRGDWEKEREKKYLQEKQQKDEQRELKKRKLEEERLKYEEKKLR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPCC126.14  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFLKEEIERKRRQLEGTSELPVKKAFRRGDWEKEREKKYLQEKQQKDEQRELKKRKLEEERLKYEEKKLRISRLANKESSRNEELLTETTTPSPAVKASPASTKLSVSENDRLSIPEITKDNLTLTEIIAKLREMKEPIRLFGESEEATIQRYYSLLKYKKLEEIENELLTKGVETIDFEHATTTKPKVSKQVVAFLQHGIRIWDNFLSSKSINSFESSESQMQLKIFRQAKQDLDVLIQLIVDEALNDDIFKSIAEICYRCQKHEFVKANDMYLRLTIGNAPWPIGVTMVGIHERSAHQRLQANPSSNILKDEKKRKCLQALKRFITFQERESSNLPEYTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.58
4 0.56
5 0.55
6 0.53
7 0.49
8 0.46
9 0.41
10 0.37
11 0.36
12 0.41
13 0.4
14 0.41
15 0.5
16 0.56
17 0.63
18 0.69
19 0.72
20 0.73
21 0.78
22 0.77
23 0.73
24 0.69
25 0.67
26 0.67
27 0.69
28 0.69
29 0.71
30 0.72
31 0.73
32 0.78
33 0.77
34 0.73
35 0.73
36 0.71
37 0.71
38 0.76
39 0.78
40 0.78
41 0.77
42 0.75
43 0.75
44 0.76
45 0.76
46 0.77
47 0.78
48 0.77
49 0.75
50 0.76
51 0.69
52 0.68
53 0.64
54 0.58
55 0.58
56 0.55
57 0.58
58 0.6
59 0.64
60 0.65
61 0.68
62 0.7
63 0.66
64 0.63
65 0.63
66 0.59
67 0.6
68 0.53
69 0.44
70 0.37
71 0.32
72 0.32
73 0.27
74 0.25
75 0.19
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.14
87 0.19
88 0.22
89 0.25
90 0.25
91 0.24
92 0.24
93 0.25
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.25
98 0.25
99 0.25
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.19
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.1
113 0.09
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.26
125 0.27
126 0.28
127 0.26
128 0.25
129 0.23
130 0.21
131 0.22
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.18
144 0.2
145 0.24
146 0.26
147 0.28
148 0.33
149 0.34
150 0.33
151 0.27
152 0.31
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.22
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.07
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.16
176 0.24
177 0.27
178 0.33
179 0.32
180 0.38
181 0.37
182 0.39
183 0.38
184 0.32
185 0.29
186 0.23
187 0.21
188 0.15
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.14
205 0.17
206 0.19
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.18
213 0.17
214 0.22
215 0.24
216 0.27
217 0.32
218 0.34
219 0.35
220 0.36
221 0.36
222 0.28
223 0.26
224 0.23
225 0.18
226 0.14
227 0.12
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.12
245 0.13
246 0.15
247 0.25
248 0.26
249 0.28
250 0.3
251 0.33
252 0.37
253 0.46
254 0.52
255 0.48
256 0.56
257 0.55
258 0.54
259 0.51
260 0.45
261 0.36
262 0.27
263 0.24
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.16
269 0.15
270 0.16
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.13
275 0.12
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.14
284 0.19
285 0.23
286 0.22
287 0.26
288 0.32
289 0.37
290 0.43
291 0.49
292 0.48
293 0.45
294 0.48
295 0.46
296 0.41
297 0.41
298 0.37
299 0.38
300 0.42
301 0.51
302 0.56
303 0.62
304 0.69
305 0.73
306 0.79
307 0.8
308 0.82
309 0.82
310 0.84
311 0.81
312 0.78
313 0.72
314 0.64
315 0.64
316 0.55
317 0.48
318 0.46
319 0.42
320 0.4
321 0.42
322 0.44
323 0.37