Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O94400

Protein Details
Accession O94400    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-364DPNSTSHDRRQKRPTRRHIPCSNKSSGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047157  PHRF1-like  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG spo:SPCC126.07c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd15536  PHD_PHRF1  
cd16448  RING-H2  
Amino Acid Sequences MNAEEDPKPADSDSSEECIICLSNLPNCPLDQWDSSSVPASISSTLDGLRIAKIPCGHYFHNHCLESWCRVANTCPLCRTEFLKVDVLEFVKGPWYRAYPVEEKTQSVANAGEPFEDEGSETCRCVICGRSDHAEVLLLCDGCDDAYHTYCLNMDAVPIEEFYCPNCVLLNYQENETLSSRISLSRRGQTRRRRVGAAARASRVSQQQQRAWTRAWNAIRNRAWDALNSDLSYYGMQQERLPARDVSSELLRRRIESARLRSNQLNEPVEQPRVVQTPVTNASEQQAWNDFDEILHANSSVHSVATEATISNPRPSSGRFQQTPIEEHHQQDTRFVNDPNSTSHDRRQKRPTRRHIPCSNKSSGSSTVLGNNSSSKSENSFLASLISNINQPSTSRIDTSFMLSLQHEIKNSHSEASDGTSDVHLTPLFSNLSPRPSHVPLSPREISNDNLDDHLIELSEPGEIVDNHLVNDTSMHQRRTSGRHDLVHSSKKVSYETKYRIERLVNAALKPYYREAKISKDQFALFNKNICRSVYTALSDGTLSLEGPQQHKISKTIREKVVNCIQSLSND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.18
11 0.21
12 0.24
13 0.25
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.28
18 0.25
19 0.27
20 0.29
21 0.29
22 0.3
23 0.3
24 0.27
25 0.22
26 0.21
27 0.18
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.22
41 0.25
42 0.29
43 0.34
44 0.34
45 0.39
46 0.45
47 0.5
48 0.55
49 0.52
50 0.47
51 0.47
52 0.48
53 0.44
54 0.4
55 0.34
56 0.27
57 0.27
58 0.29
59 0.33
60 0.36
61 0.37
62 0.37
63 0.37
64 0.39
65 0.4
66 0.41
67 0.4
68 0.38
69 0.37
70 0.4
71 0.37
72 0.35
73 0.36
74 0.33
75 0.26
76 0.21
77 0.18
78 0.18
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.23
84 0.26
85 0.32
86 0.31
87 0.33
88 0.4
89 0.38
90 0.37
91 0.36
92 0.36
93 0.3
94 0.26
95 0.24
96 0.17
97 0.19
98 0.17
99 0.16
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.08
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.19
115 0.23
116 0.26
117 0.3
118 0.31
119 0.31
120 0.29
121 0.29
122 0.23
123 0.21
124 0.2
125 0.15
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.16
157 0.21
158 0.19
159 0.2
160 0.22
161 0.21
162 0.23
163 0.23
164 0.19
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.25
172 0.31
173 0.38
174 0.45
175 0.53
176 0.6
177 0.7
178 0.72
179 0.72
180 0.67
181 0.64
182 0.66
183 0.66
184 0.65
185 0.58
186 0.5
187 0.47
188 0.44
189 0.43
190 0.38
191 0.36
192 0.33
193 0.35
194 0.37
195 0.45
196 0.48
197 0.48
198 0.45
199 0.42
200 0.39
201 0.4
202 0.41
203 0.4
204 0.39
205 0.45
206 0.46
207 0.45
208 0.45
209 0.4
210 0.36
211 0.3
212 0.29
213 0.24
214 0.22
215 0.19
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.17
226 0.19
227 0.2
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.2
233 0.16
234 0.18
235 0.22
236 0.21
237 0.27
238 0.26
239 0.25
240 0.28
241 0.28
242 0.31
243 0.34
244 0.4
245 0.43
246 0.45
247 0.48
248 0.47
249 0.48
250 0.45
251 0.43
252 0.37
253 0.29
254 0.31
255 0.29
256 0.28
257 0.24
258 0.2
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.12
263 0.1
264 0.14
265 0.17
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.06
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.21
304 0.25
305 0.32
306 0.31
307 0.33
308 0.37
309 0.38
310 0.39
311 0.36
312 0.35
313 0.3
314 0.3
315 0.32
316 0.31
317 0.29
318 0.31
319 0.29
320 0.26
321 0.26
322 0.26
323 0.24
324 0.22
325 0.23
326 0.21
327 0.25
328 0.27
329 0.27
330 0.33
331 0.4
332 0.43
333 0.5
334 0.58
335 0.63
336 0.69
337 0.77
338 0.81
339 0.83
340 0.87
341 0.89
342 0.88
343 0.88
344 0.86
345 0.82
346 0.76
347 0.67
348 0.6
349 0.54
350 0.46
351 0.39
352 0.32
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.22
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.13
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.16
370 0.15
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.09
378 0.1
379 0.13
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.19
385 0.2
386 0.22
387 0.2
388 0.15
389 0.16
390 0.14
391 0.16
392 0.17
393 0.18
394 0.16
395 0.16
396 0.18
397 0.22
398 0.22
399 0.21
400 0.18
401 0.17
402 0.16
403 0.18
404 0.17
405 0.12
406 0.13
407 0.11
408 0.12
409 0.11
410 0.12
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.12
416 0.11
417 0.16
418 0.17
419 0.22
420 0.21
421 0.24
422 0.27
423 0.29
424 0.32
425 0.31
426 0.36
427 0.34
428 0.42
429 0.42
430 0.37
431 0.37
432 0.37
433 0.34
434 0.34
435 0.33
436 0.26
437 0.24
438 0.23
439 0.19
440 0.18
441 0.16
442 0.09
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.07
450 0.06
451 0.1
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.13
458 0.15
459 0.14
460 0.2
461 0.25
462 0.27
463 0.27
464 0.32
465 0.37
466 0.43
467 0.46
468 0.47
469 0.48
470 0.51
471 0.54
472 0.58
473 0.6
474 0.62
475 0.58
476 0.52
477 0.48
478 0.45
479 0.46
480 0.42
481 0.4
482 0.42
483 0.47
484 0.52
485 0.56
486 0.57
487 0.58
488 0.56
489 0.54
490 0.51
491 0.53
492 0.48
493 0.42
494 0.44
495 0.4
496 0.38
497 0.36
498 0.35
499 0.31
500 0.29
501 0.34
502 0.33
503 0.41
504 0.5
505 0.53
506 0.52
507 0.5
508 0.51
509 0.51
510 0.54
511 0.54
512 0.46
513 0.47
514 0.47
515 0.48
516 0.48
517 0.43
518 0.39
519 0.34
520 0.36
521 0.34
522 0.33
523 0.29
524 0.27
525 0.26
526 0.23
527 0.2
528 0.18
529 0.13
530 0.1
531 0.09
532 0.13
533 0.16
534 0.18
535 0.23
536 0.24
537 0.28
538 0.3
539 0.36
540 0.39
541 0.46
542 0.54
543 0.58
544 0.63
545 0.69
546 0.68
547 0.71
548 0.74
549 0.67
550 0.58
551 0.52