FuNGI

R7SZW4

Protein Details

Accession

R7SZW4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-28	TLFNPRPSRPTLPKKETPVAD	Hydrophilic
118-138	NDWARPVKLNRKDPHRNDPTM	Hydrophilic
177-205	VEQKEDKGKDKDKKPKRFQKKTRQVFLVP	Basic
596-620	SAASSDGPPRPKKRKAPGELEDRMV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
182-198	DKGKDKDKKPKRFQKKT
602-611	GPPRPKKRKA

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	dsq:DICSQDRAFT_161683 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAKKGAPTLFNPRPSRPTLPKKETPVADTPSPGSSSQPALTPNPQSAPGTPKKPPAATASPATRPAPQRRAPAPKTEDDTAPKQPDGPFTEYRLMSSKLNGWKYDVMKFESRKKVEINDWARPVKLNRKDPHRNDPTMQPAQQALAHMVGSDGKLVIGQDGKVVMVDALGRPVREPVEQKEDKGKDKDKKPKRFQKKTRQVFLVPEATRQLRREEKFPWVIEDGMQKETWVGKMEDVSKSQTYAMFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKPSHHIPNLEEAESLMTKLQKRKDATQWALRQKTEQAAASGSSLVHNASQSLGPGGKKLRTVDSGPGGLFGDGDDDDEGGDSKRRVKRELGAEGFLDELDFEETFADDEDKMDHDDKEDEETKELEERLKREYKTANKLREGFIDESDDEEDESKLTGAGKNLQKTLKKLEKGGGYDESDDEKNPYASSQEEEEEEEEPPQVHTGPAILPPESKPGAPLGTQTPPGPPTGAKAMVNGTVPVKTETPSRATSPVPGHSGHSIVAKRATSPKVPKPKTGMPSRAGSPLASPTGASPPASRATSPGRADSPPSGVNPPPEGKLLKRKADDASAASSDGPPRPKKRKAPGELEDRMVIEWLRNTPNATTRECIMHFTRYLTDDAKKAKFTALVKEVAQLSNGVLVLRPAYRGGNAGAPSPPAAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.67
3	0.67
4	0.71
5	0.72
6	0.76
7	0.78
8	0.8
9	0.82
10	0.77
11	0.72
12	0.69
13	0.64
14	0.58
15	0.52
16	0.46
17	0.4
18	0.38
19	0.32
20	0.27
21	0.24
22	0.25
23	0.24
24	0.24
25	0.25
26	0.28
27	0.33
28	0.34
29	0.34
30	0.33
31	0.34
32	0.34
33	0.33
34	0.38
35	0.4
36	0.43
37	0.44
38	0.5
39	0.54
40	0.54
41	0.54
42	0.53
43	0.52
44	0.5
45	0.52
46	0.5
47	0.48
48	0.51
49	0.49
50	0.47
51	0.49
52	0.54
53	0.56
54	0.57
55	0.62
56	0.66
57	0.75
58	0.72
59	0.74
60	0.7
61	0.67
62	0.67
63	0.61
64	0.58
65	0.53
66	0.55
67	0.53
68	0.51
69	0.45
70	0.42
71	0.41
72	0.43
73	0.43
74	0.43
75	0.38
76	0.39
77	0.45
78	0.41
79	0.42
80	0.39
81	0.35
82	0.3
83	0.3
84	0.32
85	0.33
86	0.38
87	0.36
88	0.36
89	0.4
90	0.42
91	0.45
92	0.42
93	0.39
94	0.42
95	0.46
96	0.52
97	0.56
98	0.55
99	0.53
100	0.53
101	0.54
102	0.52
103	0.58
104	0.55
105	0.53
106	0.57
107	0.55
108	0.52
109	0.5
110	0.5
111	0.5
112	0.52
113	0.54
114	0.55
115	0.64
116	0.74
117	0.77
118	0.82
119	0.8
120	0.76
121	0.7
122	0.7
123	0.69
124	0.65
125	0.59
126	0.5
127	0.41
128	0.37
129	0.35
130	0.28
131	0.21
132	0.15
133	0.13
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.05
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.06
152	0.05
153	0.06
154	0.05
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.13
160	0.15
161	0.17
162	0.21
163	0.22
164	0.32
165	0.33
166	0.35
167	0.42
168	0.45
169	0.48
170	0.53
171	0.56
172	0.55
173	0.64
174	0.73
175	0.73
176	0.8
177	0.84
178	0.88
179	0.9
180	0.92
181	0.93
182	0.94
183	0.95
184	0.94
185	0.91
186	0.86
187	0.78
188	0.72
189	0.66
190	0.64
191	0.53
192	0.45
193	0.4
194	0.37
195	0.37
196	0.33
197	0.34
198	0.34
199	0.35
200	0.38
201	0.37
202	0.42
203	0.45
204	0.44
205	0.41
206	0.34
207	0.32
208	0.3
209	0.32
210	0.26
211	0.22
212	0.21
213	0.17
214	0.16
215	0.17
216	0.16
217	0.14
218	0.12
219	0.11
220	0.14
221	0.18
222	0.19
223	0.19
224	0.22
225	0.19
226	0.2
227	0.2
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.15
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.1
239	0.1
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.17
245	0.21
246	0.27
247	0.26
248	0.33
249	0.38
250	0.47
251	0.54
252	0.54
253	0.6
254	0.62
255	0.69
256	0.73
257	0.78
258	0.71
259	0.7
260	0.64
261	0.63
262	0.58
263	0.5
264	0.39
265	0.28
266	0.26
267	0.2
268	0.17
269	0.1
270	0.1
271	0.13
272	0.18
273	0.23
274	0.27
275	0.31
276	0.37
277	0.44
278	0.5
279	0.53
280	0.57
281	0.61
282	0.63
283	0.64
284	0.58
285	0.51
286	0.44
287	0.41
288	0.34
289	0.27
290	0.18
291	0.15
292	0.15
293	0.14
294	0.13
295	0.1
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.08
307	0.07
308	0.1
309	0.12
310	0.12
311	0.14
312	0.16
313	0.18
314	0.19
315	0.2
316	0.22
317	0.22
318	0.22
319	0.19
320	0.19
321	0.16
322	0.13
323	0.11
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.04
334	0.06
335	0.06
336	0.13
337	0.17
338	0.19
339	0.22
340	0.24
341	0.3
342	0.36
343	0.43
344	0.38
345	0.36
346	0.34
347	0.32
348	0.29
349	0.23
350	0.15
351	0.07
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.11
371	0.15
372	0.18
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.17
377	0.18
378	0.18
379	0.17
380	0.16
381	0.17
382	0.22
383	0.28
384	0.28
385	0.3
386	0.37
387	0.41
388	0.49
389	0.56
390	0.56
391	0.56
392	0.58
393	0.55
394	0.5
395	0.47
396	0.38
397	0.31
398	0.27
399	0.21
400	0.2
401	0.19
402	0.16
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.08
412	0.08
413	0.16
414	0.2
415	0.22
416	0.26
417	0.3
418	0.32
419	0.33
420	0.42
421	0.42
422	0.41
423	0.41
424	0.42
425	0.42
426	0.41
427	0.42
428	0.36
429	0.29
430	0.28
431	0.27
432	0.24
433	0.2
434	0.18
435	0.16
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.14
448	0.14
449	0.13
450	0.12
451	0.11
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.1
461	0.12
462	0.11
463	0.12
464	0.13
465	0.19
466	0.18
467	0.17
468	0.15
469	0.15
470	0.17
471	0.16
472	0.17
473	0.16
474	0.18
475	0.2
476	0.19
477	0.2
478	0.19
479	0.2
480	0.19
481	0.15
482	0.15
483	0.18
484	0.21
485	0.18
486	0.19
487	0.19
488	0.2
489	0.21
490	0.19
491	0.15
492	0.13
493	0.14
494	0.15
495	0.14
496	0.13
497	0.16
498	0.18
499	0.21
500	0.23
501	0.25
502	0.26
503	0.26
504	0.31
505	0.31
506	0.32
507	0.3
508	0.28
509	0.28
510	0.26
511	0.26
512	0.22
513	0.23
514	0.21
515	0.2
516	0.23
517	0.21
518	0.22
519	0.28
520	0.31
521	0.33
522	0.41
523	0.48
524	0.56
525	0.59
526	0.62
527	0.63
528	0.68
529	0.68
530	0.7
531	0.67
532	0.6
533	0.61
534	0.57
535	0.54
536	0.46
537	0.38
538	0.3
539	0.26
540	0.24
541	0.19
542	0.17
543	0.14
544	0.18
545	0.19
546	0.18
547	0.15
548	0.17
549	0.22
550	0.23
551	0.21
552	0.21
553	0.27
554	0.34
555	0.35
556	0.35
557	0.34
558	0.34
559	0.38
560	0.36
561	0.34
562	0.28
563	0.29
564	0.29
565	0.28
566	0.31
567	0.32
568	0.32
569	0.29
570	0.31
571	0.31
572	0.32
573	0.41
574	0.46
575	0.49
576	0.49
577	0.51
578	0.51
579	0.53
580	0.51
581	0.43
582	0.4
583	0.33
584	0.31
585	0.28
586	0.26
587	0.24
588	0.25
589	0.3
590	0.34
591	0.42
592	0.51
593	0.6
594	0.69
595	0.76
596	0.83
597	0.84
598	0.86
599	0.85
600	0.86
601	0.8
602	0.74
603	0.64
604	0.54
605	0.45
606	0.36
607	0.27
608	0.19
609	0.18
610	0.19
611	0.2
612	0.21
613	0.23
614	0.25
615	0.32
616	0.34
617	0.35
618	0.33
619	0.32
620	0.36
621	0.35
622	0.37
623	0.33
624	0.35
625	0.32
626	0.33
627	0.34
628	0.3
629	0.33
630	0.32
631	0.32
632	0.32
633	0.39
634	0.4
635	0.39
636	0.38
637	0.38
638	0.4
639	0.39
640	0.42
641	0.4
642	0.39
643	0.38
644	0.41
645	0.41
646	0.35
647	0.33
648	0.24
649	0.19
650	0.18
651	0.18
652	0.13
653	0.1
654	0.11
655	0.13
656	0.13
657	0.14
658	0.12
659	0.14
660	0.15
661	0.17
662	0.18
663	0.22
664	0.22
665	0.23
666	0.23
667	0.22

R7SZW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer