Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q09100

Protein Details
Accession Q09100    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-34MDSLNNKEGQPDKKRKKHESEKEGENEVHydrophilic
39-65VTKPVPPSKKLMRKLRKAGKIDKDGNWHydrophilic
70-93LEEAKKKEEKRLKRLDAKYGRKEEBasic
297-317YGEDRSKRMRNKSPMARSGRFHydrophilic
325-347QEDKPNFKRARKIDPRSVRPGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-23KKRKK
44-63PPSKKLMRKLRKAGKIDKDG
71-90EEAKKKEEKRLKRLDAKYGR
333-336RARK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034225  Nop13/Rnp24_RRM1  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003730  F:mRNA 3'-UTR binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0008266  F:poly(U) RNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG spo:SPAC3G6.04  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12396  RRM1_Nop13p_fungi  
cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MEPIQKMDSLNNKEGQPDKKRKKHESEKEGENEVLEIDVTKPVPPSKKLMRKLRKAGKIDKDGNWTPEALEEAKKKEEKRLKRLDAKYGRKEEGESQEESKRSPWGIWVGNLSFHTTKEILTDFFVRETSEMIKEVSEENIKPITTEQITRIHMPMSKEKRFQNKGFAYVDFATEDALKLALQCSEKALNGRNILIKSNTDFSGRPSKPANTLSKTASIQSSKKEPSSILFVGNLDFETTDADLKEHFGQVGQIRRVRLMTFEDTGKCKGFGFVDFPDIDTCMKAMELGHNSWRLEYGEDRSKRMRNKSPMARSGRFNDAESLGQEDKPNFKRARKIDPRSVRPGAALAKAQRSSAAIVEPAGQKIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.55
3 0.56
4 0.6
5 0.66
6 0.71
7 0.81
8 0.85
9 0.89
10 0.91
11 0.91
12 0.91
13 0.88
14 0.88
15 0.83
16 0.77
17 0.66
18 0.55
19 0.44
20 0.34
21 0.25
22 0.16
23 0.11
24 0.08
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.14
29 0.19
30 0.25
31 0.27
32 0.35
33 0.43
34 0.52
35 0.61
36 0.69
37 0.74
38 0.79
39 0.87
40 0.89
41 0.88
42 0.86
43 0.86
44 0.85
45 0.84
46 0.81
47 0.75
48 0.73
49 0.67
50 0.62
51 0.54
52 0.44
53 0.34
54 0.28
55 0.26
56 0.2
57 0.21
58 0.22
59 0.25
60 0.31
61 0.36
62 0.36
63 0.44
64 0.52
65 0.56
66 0.63
67 0.7
68 0.73
69 0.78
70 0.82
71 0.83
72 0.83
73 0.83
74 0.82
75 0.78
76 0.71
77 0.62
78 0.59
79 0.55
80 0.53
81 0.46
82 0.39
83 0.36
84 0.39
85 0.38
86 0.37
87 0.31
88 0.25
89 0.23
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.23
95 0.25
96 0.23
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.12
108 0.14
109 0.16
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.2
136 0.22
137 0.23
138 0.23
139 0.21
140 0.22
141 0.24
142 0.3
143 0.33
144 0.36
145 0.4
146 0.45
147 0.54
148 0.58
149 0.57
150 0.58
151 0.52
152 0.52
153 0.48
154 0.43
155 0.37
156 0.3
157 0.29
158 0.19
159 0.16
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.13
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.17
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.16
190 0.26
191 0.25
192 0.27
193 0.27
194 0.28
195 0.31
196 0.37
197 0.4
198 0.33
199 0.36
200 0.35
201 0.36
202 0.35
203 0.32
204 0.29
205 0.26
206 0.24
207 0.24
208 0.29
209 0.27
210 0.28
211 0.28
212 0.25
213 0.23
214 0.27
215 0.25
216 0.2
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.11
237 0.15
238 0.22
239 0.25
240 0.27
241 0.27
242 0.28
243 0.29
244 0.26
245 0.25
246 0.23
247 0.21
248 0.21
249 0.24
250 0.25
251 0.27
252 0.29
253 0.28
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.17
258 0.16
259 0.18
260 0.17
261 0.2
262 0.19
263 0.2
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.13
268 0.12
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.12
274 0.15
275 0.17
276 0.22
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.27
281 0.21
282 0.2
283 0.21
284 0.23
285 0.29
286 0.31
287 0.36
288 0.4
289 0.47
290 0.52
291 0.59
292 0.62
293 0.62
294 0.71
295 0.76
296 0.8
297 0.82
298 0.84
299 0.78
300 0.74
301 0.69
302 0.67
303 0.59
304 0.51
305 0.45
306 0.38
307 0.35
308 0.3
309 0.31
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.24
314 0.31
315 0.33
316 0.41
317 0.41
318 0.46
319 0.54
320 0.58
321 0.67
322 0.69
323 0.74
324 0.76
325 0.81
326 0.83
327 0.83
328 0.81
329 0.7
330 0.6
331 0.57
332 0.5
333 0.43
334 0.41
335 0.37
336 0.4
337 0.4
338 0.39
339 0.35
340 0.32
341 0.3
342 0.26
343 0.24
344 0.17
345 0.16
346 0.21
347 0.22
348 0.24
349 0.26