Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HGL3

Protein Details
Accession Q9HGL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-401GSGNRGRRGRGRGRGGRGRGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
383-401NRGRRGRGRGRGGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 9.5, extr 5, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR025761  FFD_box  
IPR025609  Lsm14-like_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR025768  TFG_box  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0170008  F:mRNA phosphatase activator activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0030371  F:translation repressor activity  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:1904689  P:negative regulation of cytoplasmic translational initiation  
GO:0033962  P:P-body assembly  
GO:0034063  P:stress granule assembly  
KEGG spo:SPBC800.09  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12701  LSM14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51513  FFD  
PS52002  SM  
PS51536  TFG  
CDD cd01736  LSm14_N  
Amino Acid Sequences MTEFIGSRISLISKSDIRYVGILQDINSQDSTLALKHVRWCGTEGRKQDPSQEIPPSDNVFDYIVFRGSDVKDLRIEEPATTPSAPPVQPPNDPAIIGSNSGQYNWNQAQTAQPPQPVQPNPYGAPYQQAPPAGAPYYMYPNAPAQFVPPGGLPLGTPLDASTPAVPYYGAPDQQQMGQRPEFAQNVSQGFAGQAPYNVRPGYGMPSNQKPPNFAPGMPAPGPTAVSASPSLQSMPPTNGVIPGAQPSIEASIEKESTSIRNSTVTNDRVVNTTVDVSQSQTVETSGPSKEVPTTQPDASAAKPRTEFDFQTANQKFQSMKDDLLKGKNDEEAEEFYKPKQSFFDNISCESKEKGMEAADRRALRDRERSLNMETFGVAGSGNRGRRGRGRGRGGRGRGRGYARNQYNQYRNSNGSQPRAQPANDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.29
4 0.29
5 0.3
6 0.29
7 0.26
8 0.25
9 0.24
10 0.19
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.25
15 0.22
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.12
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.24
24 0.3
25 0.32
26 0.32
27 0.34
28 0.4
29 0.47
30 0.51
31 0.5
32 0.51
33 0.56
34 0.55
35 0.6
36 0.57
37 0.54
38 0.54
39 0.56
40 0.5
41 0.45
42 0.49
43 0.44
44 0.38
45 0.32
46 0.27
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.16
55 0.16
56 0.23
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.27
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.22
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.17
71 0.22
72 0.21
73 0.22
74 0.28
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.34
79 0.3
80 0.3
81 0.27
82 0.24
83 0.21
84 0.2
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.14
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.19
95 0.19
96 0.24
97 0.26
98 0.33
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.31
103 0.39
104 0.36
105 0.36
106 0.33
107 0.34
108 0.32
109 0.34
110 0.33
111 0.25
112 0.26
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.2
117 0.18
118 0.17
119 0.19
120 0.16
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.16
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.17
162 0.22
163 0.2
164 0.23
165 0.22
166 0.22
167 0.23
168 0.25
169 0.23
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.22
194 0.27
195 0.3
196 0.3
197 0.29
198 0.28
199 0.32
200 0.3
201 0.25
202 0.24
203 0.22
204 0.26
205 0.23
206 0.22
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.11
211 0.11
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.1
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.13
249 0.14
250 0.18
251 0.24
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.24
258 0.2
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.19
281 0.23
282 0.22
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.23
287 0.3
288 0.26
289 0.25
290 0.26
291 0.27
292 0.31
293 0.33
294 0.31
295 0.27
296 0.32
297 0.29
298 0.39
299 0.39
300 0.35
301 0.32
302 0.33
303 0.3
304 0.25
305 0.31
306 0.22
307 0.25
308 0.28
309 0.33
310 0.35
311 0.4
312 0.4
313 0.36
314 0.35
315 0.35
316 0.3
317 0.27
318 0.25
319 0.24
320 0.24
321 0.25
322 0.25
323 0.22
324 0.29
325 0.28
326 0.26
327 0.25
328 0.25
329 0.27
330 0.32
331 0.39
332 0.35
333 0.39
334 0.42
335 0.4
336 0.38
337 0.35
338 0.32
339 0.24
340 0.22
341 0.2
342 0.19
343 0.25
344 0.28
345 0.33
346 0.37
347 0.37
348 0.39
349 0.45
350 0.45
351 0.44
352 0.49
353 0.49
354 0.51
355 0.55
356 0.57
357 0.54
358 0.55
359 0.5
360 0.41
361 0.35
362 0.27
363 0.21
364 0.18
365 0.12
366 0.07
367 0.11
368 0.16
369 0.18
370 0.24
371 0.25
372 0.3
373 0.37
374 0.47
375 0.52
376 0.57
377 0.65
378 0.68
379 0.77
380 0.82
381 0.83
382 0.83
383 0.8
384 0.75
385 0.71
386 0.69
387 0.67
388 0.65
389 0.67
390 0.65
391 0.67
392 0.69
393 0.71
394 0.73
395 0.72
396 0.72
397 0.67
398 0.65
399 0.6
400 0.63
401 0.61
402 0.6
403 0.59
404 0.58
405 0.59
406 0.6