Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SRS9

Protein Details
Accession R7SRS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53NSSNPQPPAKKRKTGPNQRQRGAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-44AKKRKTGP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_148846  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MRPIISYDDITTPQPALPPPPPNPKHQANSSNPQPPAKKRKTGPNQRQRGAANGRVGQPVQHWDDPGNQGMQMSYDDAPRQTEVRGEEEEEWDEEEESRELSHDEIWDDSALIDAWNSAAAEYEAFHGPGKSWKQEPVKKSPLWYNVPPEKTSKGKLKAAPSKTNGIAVEAEMNGRTEAADSSPLNFDTFVPTHDPSLAPAGPSLSVPAINAATLGSGAEAAIVSQDEAFSNAMTAMYWSGYWTAVYHCRRNESAPQNGAAEEYAADQIEDGLEEGEEDDDEDMLPAQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.22
4 0.27
5 0.33
6 0.39
7 0.49
8 0.51
9 0.56
10 0.62
11 0.64
12 0.65
13 0.66
14 0.68
15 0.65
16 0.72
17 0.73
18 0.73
19 0.67
20 0.68
21 0.66
22 0.66
23 0.69
24 0.68
25 0.69
26 0.67
27 0.76
28 0.8
29 0.84
30 0.85
31 0.85
32 0.87
33 0.81
34 0.81
35 0.71
36 0.69
37 0.65
38 0.59
39 0.55
40 0.48
41 0.48
42 0.44
43 0.42
44 0.34
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.26
49 0.24
50 0.23
51 0.28
52 0.29
53 0.29
54 0.24
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.12
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.24
121 0.33
122 0.38
123 0.43
124 0.46
125 0.51
126 0.49
127 0.51
128 0.49
129 0.47
130 0.47
131 0.45
132 0.43
133 0.42
134 0.44
135 0.42
136 0.39
137 0.36
138 0.33
139 0.35
140 0.35
141 0.34
142 0.38
143 0.41
144 0.48
145 0.53
146 0.57
147 0.59
148 0.54
149 0.53
150 0.47
151 0.46
152 0.37
153 0.29
154 0.23
155 0.16
156 0.15
157 0.11
158 0.1
159 0.07
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.09
168 0.08
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.13
184 0.17
185 0.16
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.2
233 0.26
234 0.32
235 0.34
236 0.39
237 0.41
238 0.46
239 0.52
240 0.51
241 0.54
242 0.51
243 0.5
244 0.45
245 0.43
246 0.39
247 0.29
248 0.22
249 0.13
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07