Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P56523

Protein Details
Accession P56523    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
632-658VSSSNECWKKAKRAKRRYGRLMQSEHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
640-648KKAKRAKRR
Subcellular Location(s) cysk 14, nucl 7, cyto 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019154  Arb2_domain  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR017321  Hist_deAcase_II_yeast  
IPR017320  Histone_deAcase_II_euk  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0099115  C:chromosome, subtelomeric region  
GO:1990342  C:heterochromatin island  
GO:0000118  C:histone deacetylase complex  
GO:0031934  C:mating-type region heterochromatin  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0070824  C:SHREC complex  
GO:0110129  C:SHREC2 complex  
GO:0140720  C:subtelomeric heterochromatin  
GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0031078  F:histone H3K14 deacetylase activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0090053  P:positive regulation of pericentric heterochromatin formation  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
KEGG spo:SPBC800.03  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09757  Arb2  
PF00850  Hist_deacetyl  
CDD cd11600  HDAC_Clr3  
Amino Acid Sequences MLASNSDGASTSVKPSDDAVNTVTPWSILLTNNKPMSGSENTLNNESHEMSQILKKSGLCYDPRMRFHATLSEVDDHPEDPRRVLRVFEAIKKAGYVSNVPSPSDVFLRIPAREATLEELLQVHSQEMYDRVTNTEKMSHEDLANLEKISDSLYYNNESAFCARLACGSAIETCTAVVTGQVKNAFAVVRPPGHHAEPHKPGGFCLFNNVSVTARSMLQRFPDKIKRVLIVDWDIHHGNGTQMAFYDDPNVLYVSLHRYENGRFYPGTNYGCAENCGEGPGLGRTVNIPWSCAGMGDGDYIYAFQRVVMPVAYEFDPDLVIVSCGFDAAAGDHIGQFLLTPAAYAHMTQMLMGLADGKVFISLEGGYNLDSISTSALAVAQSLLGIPPGRLHTTYACPQAVATINHVTKIQSQYWRCMRPKHFDANPKDAHVDRLHDVIRTYQAKKLFEDWKITNMPILRDSVSNVFNNQVLCSSNFFQKDNLLVIVHESPRVLGNGTSETNVLNLNDSLLVDPVSLYVEWAMQQDWGLIDINIPEVVTDGENAPVDILSEVKELCLYVWDNYVELSISKNIFFIGGGKAVHGLVNLASSRNVSDRVKCMVNFLGTEPLVGLKTASEEDLPTWYYRHSLVFVSSSNECWKKAKRAKRRYGRLMQSEHTETSDMMEQHYRAVTQYLLHLLQKARPTSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.27
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.26
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.15
16 0.23
17 0.27
18 0.36
19 0.38
20 0.37
21 0.36
22 0.34
23 0.36
24 0.33
25 0.32
26 0.28
27 0.33
28 0.35
29 0.38
30 0.38
31 0.34
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.22
36 0.2
37 0.19
38 0.24
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.27
43 0.27
44 0.32
45 0.35
46 0.33
47 0.37
48 0.45
49 0.5
50 0.53
51 0.55
52 0.55
53 0.51
54 0.5
55 0.49
56 0.42
57 0.37
58 0.38
59 0.37
60 0.32
61 0.33
62 0.31
63 0.24
64 0.24
65 0.29
66 0.25
67 0.24
68 0.28
69 0.3
70 0.3
71 0.31
72 0.31
73 0.32
74 0.36
75 0.41
76 0.43
77 0.4
78 0.39
79 0.38
80 0.36
81 0.29
82 0.27
83 0.22
84 0.2
85 0.27
86 0.28
87 0.28
88 0.27
89 0.26
90 0.26
91 0.24
92 0.22
93 0.15
94 0.2
95 0.23
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.24
100 0.22
101 0.23
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.11
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.16
119 0.19
120 0.21
121 0.22
122 0.26
123 0.24
124 0.27
125 0.3
126 0.29
127 0.26
128 0.25
129 0.25
130 0.23
131 0.24
132 0.19
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.13
173 0.11
174 0.14
175 0.14
176 0.17
177 0.18
178 0.22
179 0.24
180 0.25
181 0.29
182 0.3
183 0.36
184 0.38
185 0.43
186 0.43
187 0.39
188 0.38
189 0.4
190 0.37
191 0.29
192 0.3
193 0.25
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.19
198 0.17
199 0.19
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.18
206 0.24
207 0.25
208 0.32
209 0.39
210 0.41
211 0.45
212 0.46
213 0.44
214 0.4
215 0.39
216 0.35
217 0.3
218 0.27
219 0.24
220 0.24
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.15
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.21
248 0.21
249 0.19
250 0.17
251 0.18
252 0.22
253 0.25
254 0.25
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.12
380 0.17
381 0.21
382 0.23
383 0.22
384 0.2
385 0.2
386 0.21
387 0.22
388 0.18
389 0.17
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.21
394 0.19
395 0.19
396 0.23
397 0.24
398 0.25
399 0.27
400 0.34
401 0.41
402 0.49
403 0.48
404 0.53
405 0.54
406 0.55
407 0.6
408 0.6
409 0.6
410 0.61
411 0.64
412 0.64
413 0.61
414 0.53
415 0.5
416 0.42
417 0.4
418 0.32
419 0.28
420 0.21
421 0.23
422 0.21
423 0.2
424 0.2
425 0.17
426 0.22
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.28
431 0.29
432 0.3
433 0.35
434 0.35
435 0.33
436 0.38
437 0.35
438 0.36
439 0.36
440 0.35
441 0.31
442 0.27
443 0.25
444 0.2
445 0.21
446 0.16
447 0.15
448 0.17
449 0.18
450 0.19
451 0.18
452 0.17
453 0.16
454 0.17
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.11
459 0.12
460 0.15
461 0.16
462 0.2
463 0.21
464 0.22
465 0.22
466 0.22
467 0.22
468 0.2
469 0.19
470 0.14
471 0.12
472 0.14
473 0.16
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.12
478 0.13
479 0.13
480 0.12
481 0.08
482 0.1
483 0.13
484 0.13
485 0.14
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.11
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.06
526 0.07
527 0.06
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.07
542 0.07
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.11
552 0.1
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.11
570 0.1
571 0.07
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.14
579 0.19
580 0.19
581 0.23
582 0.27
583 0.31
584 0.35
585 0.33
586 0.35
587 0.34
588 0.33
589 0.3
590 0.27
591 0.29
592 0.24
593 0.24
594 0.2
595 0.18
596 0.16
597 0.15
598 0.13
599 0.07
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.14
607 0.16
608 0.15
609 0.15
610 0.14
611 0.16
612 0.17
613 0.18
614 0.17
615 0.17
616 0.19
617 0.2
618 0.21
619 0.23
620 0.23
621 0.23
622 0.3
623 0.31
624 0.3
625 0.35
626 0.41
627 0.48
628 0.57
629 0.65
630 0.67
631 0.76
632 0.85
633 0.9
634 0.93
635 0.93
636 0.93
637 0.93
638 0.91
639 0.87
640 0.8
641 0.76
642 0.69
643 0.6
644 0.51
645 0.42
646 0.33
647 0.29
648 0.31
649 0.23
650 0.22
651 0.25
652 0.23
653 0.25
654 0.26
655 0.23
656 0.19
657 0.2
658 0.18
659 0.15
660 0.18
661 0.2
662 0.21
663 0.22
664 0.26
665 0.27
666 0.31
667 0.36