FuNGI

Q9C106

Protein Details

Accession

Q9C106

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
217-238	LTRKPKESIPHPTKRRKRAVGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
220-234	KPKESIPHPTKRRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013197 RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH IPR008806 RNA_pol_III_Rpc82_C IPR039748 RPC3 IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	spo:SPAPB1E7.03 -
Pfam	View protein in Pfam PF08221 HTH_9 PF05645 RNA_pol_Rpc82

Amino Acid Sequences

MSQYAVELCEILVEEFFGDCCSAVASALLRHGRLTIPMLQKRTSLPGPKIRQALVSLMQHHMVLYVTVIENVREVTYYETQWKEIYNILRKGKDVYLISQKLNQEAASVVKYLSTQGRARVLEVFNAFDKKVDGSDEESRMMQKNLTELIYQKFLLVVQPRHLIPVGDQEMQLRIKHLDRRKSENVSEIKKNREVDDSVALEMLELRAADMSELQGLTRKPKESIPHPTKRRKRAVGSAPSVSTDLNNILDDDNSILVPDLSAHVRINSGKLSVLSKNARLTHWVERRIGKSTSLVYSHVLSMLEPRLFSISNQSPVFTLTTMELTRNFPNDIDVESSIVDKQYSVNSASNELRVMEKLNELDELAEEDNYEESVDENANRKSKVLAQHLELLADCSLKFISKIGNRGMGEWAVNFTHLTDMLRAIEYENFIEQKFGERAIRLLRIIKDKGKIEEKQLANIALLRQRDLRTVLQAMAEIGALELQEVPRSSDRAPSKTFFLWFHRPDRAYSLLLDELYHVIARLYMRLRDARAQRAQLIEKAERIDIKGNEEQYLQKFEQAELKKLYSYEEKLLLQASRLDDMVLVFRDNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.08
4	0.07
5	0.07
6	0.07
7	0.07
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.17
15	0.19
16	0.18
17	0.19
18	0.2
19	0.2
20	0.21
21	0.23
22	0.26
23	0.33
24	0.39
25	0.43
26	0.43
27	0.44
28	0.45
29	0.48
30	0.47
31	0.46
32	0.47
33	0.54
34	0.6
35	0.64
36	0.66
37	0.6
38	0.55
39	0.49
40	0.46
41	0.42
42	0.39
43	0.35
44	0.33
45	0.32
46	0.29
47	0.27
48	0.22
49	0.16
50	0.11
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.1
55	0.11
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.13
63	0.16
64	0.18
65	0.25
66	0.25
67	0.26
68	0.27
69	0.27
70	0.23
71	0.26
72	0.32
73	0.34
74	0.41
75	0.46
76	0.47
77	0.47
78	0.49
79	0.46
80	0.44
81	0.37
82	0.35
83	0.39
84	0.41
85	0.41
86	0.42
87	0.41
88	0.37
89	0.36
90	0.3
91	0.21
92	0.18
93	0.19
94	0.15
95	0.15
96	0.12
97	0.11
98	0.12
99	0.13
100	0.16
101	0.19
102	0.19
103	0.23
104	0.29
105	0.29
106	0.3
107	0.34
108	0.31
109	0.31
110	0.3
111	0.28
112	0.24
113	0.26
114	0.24
115	0.19
116	0.19
117	0.15
118	0.15
119	0.14
120	0.13
121	0.17
122	0.23
123	0.24
124	0.24
125	0.24
126	0.26
127	0.26
128	0.25
129	0.21
130	0.16
131	0.17
132	0.18
133	0.18
134	0.17
135	0.17
136	0.19
137	0.21
138	0.2
139	0.17
140	0.15
141	0.14
142	0.18
143	0.21
144	0.21
145	0.22
146	0.25
147	0.25
148	0.27
149	0.27
150	0.23
151	0.17
152	0.24
153	0.24
154	0.22
155	0.22
156	0.21
157	0.24
158	0.26
159	0.25
160	0.18
161	0.16
162	0.19
163	0.28
164	0.34
165	0.4
166	0.44
167	0.52
168	0.58
169	0.62
170	0.59
171	0.59
172	0.59
173	0.56
174	0.6
175	0.57
176	0.55
177	0.54
178	0.54
179	0.47
180	0.44
181	0.39
182	0.33
183	0.34
184	0.29
185	0.24
186	0.22
187	0.2
188	0.15
189	0.14
190	0.11
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.08
203	0.09
204	0.15
205	0.18
206	0.19
207	0.2
208	0.24
209	0.3
210	0.33
211	0.44
212	0.48
213	0.55
214	0.63
215	0.72
216	0.77
217	0.82
218	0.84
219	0.8
220	0.77
221	0.76
222	0.77
223	0.76
224	0.71
225	0.64
226	0.55
227	0.48
228	0.42
229	0.33
230	0.23
231	0.14
232	0.11
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.08
239	0.07
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.12
260	0.11
261	0.17
262	0.17
263	0.19
264	0.23
265	0.24
266	0.23
267	0.24
268	0.27
269	0.31
270	0.35
271	0.37
272	0.36
273	0.38
274	0.4
275	0.41
276	0.38
277	0.29
278	0.25
279	0.23
280	0.22
281	0.19
282	0.18
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.12
287	0.1
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.15
298	0.15
299	0.2
300	0.2
301	0.2
302	0.19
303	0.2
304	0.2
305	0.13
306	0.11
307	0.07
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.13
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.12
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.1
333	0.13
334	0.13
335	0.17
336	0.18
337	0.17
338	0.16
339	0.15
340	0.14
341	0.12
342	0.13
343	0.1
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.04
360	0.04
361	0.06
362	0.06
363	0.08
364	0.11
365	0.15
366	0.18
367	0.18
368	0.18
369	0.19
370	0.23
371	0.29
372	0.34
373	0.33
374	0.32
375	0.38
376	0.38
377	0.37
378	0.32
379	0.25
380	0.18
381	0.15
382	0.13
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.14
389	0.16
390	0.21
391	0.23
392	0.29
393	0.29
394	0.3
395	0.31
396	0.25
397	0.22
398	0.18
399	0.17
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.11
421	0.15
422	0.14
423	0.16
424	0.16
425	0.16
426	0.18
427	0.22
428	0.25
429	0.21
430	0.26
431	0.28
432	0.33
433	0.37
434	0.39
435	0.41
436	0.42
437	0.47
438	0.49
439	0.47
440	0.46
441	0.51
442	0.47
443	0.45
444	0.44
445	0.38
446	0.31
447	0.3
448	0.27
449	0.22
450	0.22
451	0.2
452	0.22
453	0.22
454	0.24
455	0.27
456	0.26
457	0.26
458	0.27
459	0.26
460	0.23
461	0.22
462	0.19
463	0.15
464	0.13
465	0.08
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.07
473	0.08
474	0.12
475	0.13
476	0.16
477	0.17
478	0.24
479	0.3
480	0.34
481	0.38
482	0.37
483	0.4
484	0.41
485	0.43
486	0.39
487	0.41
488	0.45
489	0.45
490	0.49
491	0.53
492	0.51
493	0.5
494	0.51
495	0.48
496	0.39
497	0.35
498	0.33
499	0.26
500	0.25
501	0.23
502	0.19
503	0.15
504	0.15
505	0.14
506	0.1
507	0.08
508	0.1
509	0.1
510	0.14
511	0.16
512	0.18
513	0.22
514	0.26
515	0.3
516	0.36
517	0.42
518	0.46
519	0.51
520	0.52
521	0.52
522	0.54
523	0.54
524	0.5
525	0.5
526	0.44
527	0.4
528	0.38
529	0.37
530	0.32
531	0.32
532	0.35
533	0.3
534	0.34
535	0.36
536	0.35
537	0.34
538	0.34
539	0.37
540	0.33
541	0.39
542	0.32
543	0.31
544	0.3
545	0.3
546	0.38
547	0.36
548	0.39
549	0.37
550	0.38
551	0.36
552	0.35
553	0.39
554	0.38
555	0.38
556	0.37
557	0.37
558	0.36
559	0.35
560	0.38
561	0.34
562	0.28
563	0.28
564	0.25
565	0.22
566	0.21
567	0.2
568	0.17
569	0.17
570	0.2
571	0.17

Q9C106

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer