Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SVM2

Protein Details
Accession R7SVM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-201YTDSSHKEEKEKKEKRPFWDRTGHRDKEKDKDKERARERERERERERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-218EEKEKKEKRPFWDRTGHRDKEKDKDKERARERERERERERDRDRDVLRGREREKERK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_107777  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd21383  GAT_GGA_Tom1-like  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MKKLFGRDKPKAVKVTPSSPVDVSGLGENHTYPSHRHDRLHSGTEEQWDLMSETDPPLQPLRPPNYAPSQTLSFASMNSMNSPVPSPVPRSTSPFSIVSAVPPPSSKASKERDGTVLKKKPPSTPNAFAAVGILNSLNPTLPEPVNSHDTSDDGYTDSSHKEEKEKKEKRPFWDRTGHRDKEKDKDKERARERERERERERDRDRDVLRGREREKERKEEGTPVEITRMLGYLFATSSEDWMLVLDVCDKASANEENAKEAAKALRKEFKSGEPSTQLAAARLWAIMLRNCSILFVKHCASRKFIDTLDEVLKAKTTPPVVRERLLQVLAAASYASDNDSNFRHLWRKYKRDEQPDEGVPFDTDDAMFYPATPRHSVGPNTLTPPVVEQPLHPQSLTPGQPPSQQRPSSQPQHNHHHPPSQQQTPQRPPSTTTPGKTKSHSSRTRIIPPEEDIRRLFQECKVGRGNANLLSEALAYAKPEDLKSKDIIKEFYARCRASQELISAQIPWAFAQAERSREAAGRPTEAAKARETRASVDRDRDQPPSSPKKDKDEHLTTEEKLLAAILAANEELLEALRLYDDLERVGIERDAEERSKRDIRMDRSRLVYDENNEAHFLEPGQANHGGASSSRSPSPSPSTSPSPAPSLVITPSIAHSTISQPAPTRPQPNSNQGHTDRNHHQSHTHHPVSQGSGQSLAPPPPAPHGPRLPTQRSNTPSPERGSLHRGPAPGRSSLDSTRGSITTAPTPSKLRQNSSEEWSEVDHDNDDCKTPVRPSAKALGKRRVVEPPEGERPFDPDDLFYDQSVNESIRTSEDSDSEDGHPKNPWHRPVHYVYDAAAERTQQRIREGRLAAAALVGGVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.69
3 0.66
4 0.61
5 0.56
6 0.49
7 0.48
8 0.39
9 0.33
10 0.27
11 0.23
12 0.2
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.24
21 0.33
22 0.37
23 0.42
24 0.46
25 0.54
26 0.6
27 0.64
28 0.57
29 0.52
30 0.51
31 0.51
32 0.46
33 0.36
34 0.29
35 0.24
36 0.22
37 0.18
38 0.15
39 0.12
40 0.13
41 0.17
42 0.17
43 0.19
44 0.21
45 0.22
46 0.27
47 0.34
48 0.38
49 0.4
50 0.41
51 0.45
52 0.51
53 0.54
54 0.51
55 0.47
56 0.44
57 0.4
58 0.38
59 0.36
60 0.26
61 0.23
62 0.24
63 0.21
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.17
71 0.19
72 0.21
73 0.25
74 0.27
75 0.33
76 0.34
77 0.4
78 0.42
79 0.42
80 0.43
81 0.38
82 0.35
83 0.32
84 0.3
85 0.26
86 0.27
87 0.25
88 0.22
89 0.21
90 0.22
91 0.25
92 0.28
93 0.29
94 0.32
95 0.38
96 0.45
97 0.48
98 0.49
99 0.51
100 0.55
101 0.58
102 0.6
103 0.61
104 0.6
105 0.65
106 0.64
107 0.66
108 0.66
109 0.68
110 0.66
111 0.65
112 0.62
113 0.59
114 0.55
115 0.46
116 0.41
117 0.32
118 0.23
119 0.16
120 0.12
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.08
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.16
131 0.2
132 0.26
133 0.26
134 0.26
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.17
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.17
148 0.25
149 0.33
150 0.42
151 0.52
152 0.59
153 0.68
154 0.76
155 0.82
156 0.82
157 0.84
158 0.81
159 0.78
160 0.8
161 0.75
162 0.74
163 0.78
164 0.75
165 0.71
166 0.72
167 0.68
168 0.68
169 0.73
170 0.72
171 0.68
172 0.72
173 0.74
174 0.76
175 0.81
176 0.81
177 0.78
178 0.79
179 0.79
180 0.8
181 0.8
182 0.8
183 0.77
184 0.77
185 0.77
186 0.77
187 0.77
188 0.75
189 0.7
190 0.69
191 0.64
192 0.63
193 0.62
194 0.61
195 0.61
196 0.61
197 0.58
198 0.59
199 0.65
200 0.66
201 0.67
202 0.66
203 0.64
204 0.62
205 0.62
206 0.6
207 0.56
208 0.51
209 0.46
210 0.38
211 0.35
212 0.29
213 0.27
214 0.19
215 0.17
216 0.11
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.17
247 0.17
248 0.2
249 0.2
250 0.23
251 0.25
252 0.33
253 0.34
254 0.38
255 0.39
256 0.4
257 0.42
258 0.42
259 0.41
260 0.36
261 0.36
262 0.33
263 0.33
264 0.27
265 0.2
266 0.18
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.21
285 0.27
286 0.27
287 0.3
288 0.31
289 0.31
290 0.31
291 0.29
292 0.27
293 0.23
294 0.25
295 0.23
296 0.23
297 0.2
298 0.17
299 0.17
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.19
306 0.28
307 0.3
308 0.31
309 0.33
310 0.32
311 0.32
312 0.3
313 0.26
314 0.17
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.08
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.07
326 0.08
327 0.11
328 0.11
329 0.14
330 0.19
331 0.21
332 0.31
333 0.39
334 0.47
335 0.51
336 0.6
337 0.66
338 0.71
339 0.74
340 0.7
341 0.67
342 0.63
343 0.57
344 0.48
345 0.4
346 0.3
347 0.23
348 0.18
349 0.12
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.09
357 0.11
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.19
363 0.21
364 0.21
365 0.23
366 0.22
367 0.24
368 0.24
369 0.21
370 0.18
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.12
375 0.1
376 0.17
377 0.21
378 0.21
379 0.19
380 0.18
381 0.18
382 0.23
383 0.24
384 0.18
385 0.17
386 0.17
387 0.23
388 0.27
389 0.32
390 0.34
391 0.35
392 0.35
393 0.4
394 0.46
395 0.5
396 0.53
397 0.55
398 0.53
399 0.6
400 0.65
401 0.66
402 0.62
403 0.59
404 0.54
405 0.54
406 0.53
407 0.49
408 0.47
409 0.47
410 0.53
411 0.54
412 0.6
413 0.54
414 0.49
415 0.47
416 0.48
417 0.5
418 0.45
419 0.39
420 0.39
421 0.42
422 0.44
423 0.43
424 0.45
425 0.44
426 0.5
427 0.55
428 0.52
429 0.54
430 0.57
431 0.63
432 0.6
433 0.55
434 0.46
435 0.42
436 0.45
437 0.39
438 0.37
439 0.29
440 0.26
441 0.26
442 0.25
443 0.24
444 0.18
445 0.26
446 0.23
447 0.27
448 0.28
449 0.27
450 0.26
451 0.27
452 0.27
453 0.21
454 0.22
455 0.17
456 0.15
457 0.14
458 0.12
459 0.11
460 0.09
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.11
468 0.13
469 0.15
470 0.17
471 0.22
472 0.25
473 0.26
474 0.27
475 0.25
476 0.31
477 0.3
478 0.35
479 0.37
480 0.34
481 0.33
482 0.34
483 0.34
484 0.27
485 0.28
486 0.23
487 0.17
488 0.19
489 0.18
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.12
494 0.09
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.13
499 0.16
500 0.17
501 0.18
502 0.19
503 0.19
504 0.2
505 0.21
506 0.2
507 0.19
508 0.18
509 0.18
510 0.18
511 0.21
512 0.24
513 0.25
514 0.21
515 0.24
516 0.24
517 0.26
518 0.25
519 0.25
520 0.27
521 0.31
522 0.31
523 0.33
524 0.36
525 0.38
526 0.4
527 0.41
528 0.37
529 0.36
530 0.43
531 0.47
532 0.49
533 0.53
534 0.53
535 0.58
536 0.61
537 0.61
538 0.61
539 0.58
540 0.56
541 0.52
542 0.51
543 0.43
544 0.41
545 0.36
546 0.27
547 0.2
548 0.15
549 0.1
550 0.07
551 0.07
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.09
577 0.12
578 0.14
579 0.16
580 0.17
581 0.23
582 0.28
583 0.28
584 0.35
585 0.4
586 0.46
587 0.54
588 0.58
589 0.56
590 0.55
591 0.56
592 0.49
593 0.46
594 0.41
595 0.32
596 0.34
597 0.3
598 0.27
599 0.26
600 0.26
601 0.21
602 0.18
603 0.15
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.13
612 0.1
613 0.09
614 0.13
615 0.12
616 0.14
617 0.15
618 0.17
619 0.17
620 0.21
621 0.28
622 0.27
623 0.29
624 0.32
625 0.37
626 0.38
627 0.4
628 0.38
629 0.35
630 0.32
631 0.29
632 0.24
633 0.2
634 0.18
635 0.16
636 0.15
637 0.12
638 0.13
639 0.13
640 0.13
641 0.11
642 0.12
643 0.13
644 0.18
645 0.18
646 0.19
647 0.19
648 0.22
649 0.29
650 0.34
651 0.38
652 0.36
653 0.43
654 0.48
655 0.56
656 0.59
657 0.55
658 0.58
659 0.55
660 0.6
661 0.53
662 0.54
663 0.52
664 0.53
665 0.53
666 0.46
667 0.48
668 0.44
669 0.52
670 0.55
671 0.51
672 0.45
673 0.43
674 0.45
675 0.44
676 0.44
677 0.36
678 0.27
679 0.26
680 0.23
681 0.25
682 0.24
683 0.21
684 0.19
685 0.18
686 0.19
687 0.21
688 0.28
689 0.28
690 0.32
691 0.37
692 0.39
693 0.45
694 0.53
695 0.56
696 0.58
697 0.61
698 0.63
699 0.61
700 0.63
701 0.64
702 0.62
703 0.6
704 0.56
705 0.57
706 0.51
707 0.5
708 0.51
709 0.48
710 0.48
711 0.45
712 0.45
713 0.4
714 0.44
715 0.43
716 0.38
717 0.36
718 0.32
719 0.33
720 0.33
721 0.37
722 0.32
723 0.31
724 0.3
725 0.28
726 0.26
727 0.23
728 0.24
729 0.24
730 0.26
731 0.26
732 0.27
733 0.31
734 0.35
735 0.42
736 0.45
737 0.45
738 0.49
739 0.54
740 0.56
741 0.57
742 0.58
743 0.48
744 0.44
745 0.39
746 0.35
747 0.29
748 0.26
749 0.21
750 0.17
751 0.19
752 0.18
753 0.19
754 0.17
755 0.17
756 0.19
757 0.2
758 0.28
759 0.31
760 0.32
761 0.34
762 0.43
763 0.51
764 0.57
765 0.63
766 0.64
767 0.66
768 0.67
769 0.66
770 0.66
771 0.61
772 0.6
773 0.57
774 0.55
775 0.59
776 0.57
777 0.55
778 0.46
779 0.47
780 0.43
781 0.39
782 0.32
783 0.23
784 0.26
785 0.29
786 0.3
787 0.25
788 0.22
789 0.2
790 0.2
791 0.21
792 0.18
793 0.13
794 0.13
795 0.14
796 0.15
797 0.18
798 0.19
799 0.19
800 0.2
801 0.22
802 0.23
803 0.25
804 0.26
805 0.31
806 0.29
807 0.29
808 0.33
809 0.34
810 0.42
811 0.47
812 0.53
813 0.53
814 0.56
815 0.61
816 0.64
817 0.67
818 0.62
819 0.54
820 0.46
821 0.46
822 0.43
823 0.39
824 0.33
825 0.26
826 0.25
827 0.31
828 0.35
829 0.3
830 0.37
831 0.42
832 0.46
833 0.52
834 0.51
835 0.47
836 0.47
837 0.44
838 0.37
839 0.29
840 0.23