FuNGI

P12000

Protein Details

Accession

P12000

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
581-600	HYEPSKRSRHWLKVKKDYLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000977 DNA_ligase_ATP-dep IPR012309 DNA_ligase_ATP-dep_C IPR012310 DNA_ligase_ATP-dep_cent IPR016059 DNA_ligase_ATP-dep_CS IPR012308 DNA_ligase_ATP-dep_N IPR036599 DNA_ligase_N_sf IPR012340 NA-bd_OB-fold
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0043596 C:nuclear replication fork GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0003910 F:DNA ligase (ATP) activity GO:0003909 F:DNA ligase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006284 P:base-excision repair GO:0051301 P:cell division GO:0071897 P:DNA biosynthetic process GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006273 P:lagging strand elongation GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:1903461 P:Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication
KEGG	spo:SPAC20G8.01 -
Pfam	View protein in Pfam PF04679 DNA_ligase_A_C PF01068 DNA_ligase_A_M PF04675 DNA_ligase_A_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00697 DNA_LIGASE_A1 PS00333 DNA_LIGASE_A2 PS50160 DNA_LIGASE_A3
CDD	cd07900 Adenylation_DNA_ligase_I_Euk cd07969 OBF_DNA_ligase_I

Amino Acid Sequences

MRTVFSQIPRFKQVNQYIRMSTRQSDISNFFISSASHKSEHVEVSQSSSDSKNVDGRSTSEKRKVESVKLVDESKHNNHDDTGTQNVERENNIVSEAKKQKTLGSSSSSSDAVSSNNDSGASTPIPLPIKEPPLESNARNDKLKGHATFAEMVKAFTKIENTSKRLEIIDIMGTYFFGILRDHPSDLLACVYLSINKLGPDYSGLELGIGESIIMKAIGESTGQTLQQIKLSFHKVGDLGLVAQTSRQNQPTMFKPAALTIPFLFDSLKKIAQMSGNQSQNRKIGVIKRLLSSCEGAEPKYLIRALEGKLRLQLAEKTILVALANATAQYHADKNGEKLSQQDRIEGEQILRDVYCQLPSYDLIVPHLIEHGLGTLRETCKLTPGIPTKPMLAKPTKQISEVLNTFDQAAFTCEYKYDGERAQVHFTEDGKFYVFSRNSENMSVRYPDISVSVSKWKKPDARSFILDCEAVGWDRDENKILPFQKLATRKRKDVKIGDIKVRACLFAFDILYLNGQPLLETPLNERRKLLYSMFQPSTGDFTFAKHSDQKSIESIEEFLEESVKDSCEGLMVKMLEGPDSHYEPSKRSRHWLKVKKDYLSGVGDSLDLIVIGAYYGKGKRTSVYGAFLLGCYDPDTETVQSICKLGTGFSEEHLETFYNQLKDIVISKKKDFYAHSDVPAHQPDVWFEPKYLWEVLAADLSLSPVYKAAIGYVQEDKGISLRFPRFIRIREDKSWEDATTSEQVSEFYRSQVAYSQKEKEGSPAAEDY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.62
3	0.62
4	0.59
5	0.61
6	0.63
7	0.56
8	0.49
9	0.45
10	0.44
11	0.41
12	0.41
13	0.4
14	0.39
15	0.38
16	0.35
17	0.31
18	0.26
19	0.25
20	0.23
21	0.24
22	0.24
23	0.23
24	0.23
25	0.26
26	0.29
27	0.31
28	0.29
29	0.29
30	0.25
31	0.29
32	0.31
33	0.28
34	0.26
35	0.25
36	0.25
37	0.21
38	0.24
39	0.25
40	0.24
41	0.27
42	0.26
43	0.28
44	0.35
45	0.42
46	0.47
47	0.49
48	0.51
49	0.51
50	0.59
51	0.61
52	0.6
53	0.62
54	0.59
55	0.57
56	0.58
57	0.58
58	0.51
59	0.51
60	0.5
61	0.48
62	0.5
63	0.45
64	0.42
65	0.4
66	0.4
67	0.37
68	0.33
69	0.32
70	0.27
71	0.25
72	0.27
73	0.28
74	0.27
75	0.26
76	0.23
77	0.19
78	0.17
79	0.19
80	0.2
81	0.18
82	0.26
83	0.33
84	0.34
85	0.37
86	0.37
87	0.39
88	0.42
89	0.46
90	0.41
91	0.39
92	0.39
93	0.38
94	0.39
95	0.35
96	0.29
97	0.25
98	0.21
99	0.15
100	0.16
101	0.17
102	0.15
103	0.15
104	0.15
105	0.14
106	0.14
107	0.17
108	0.14
109	0.12
110	0.12
111	0.17
112	0.19
113	0.19
114	0.21
115	0.22
116	0.28
117	0.28
118	0.3
119	0.27
120	0.31
121	0.36
122	0.34
123	0.39
124	0.42
125	0.45
126	0.44
127	0.43
128	0.4
129	0.42
130	0.49
131	0.4
132	0.35
133	0.33
134	0.34
135	0.38
136	0.35
137	0.34
138	0.27
139	0.26
140	0.23
141	0.22
142	0.19
143	0.15
144	0.18
145	0.16
146	0.25
147	0.31
148	0.34
149	0.37
150	0.38
151	0.38
152	0.36
153	0.33
154	0.26
155	0.2
156	0.2
157	0.16
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.07
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.12
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.15
175	0.1
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.1
181	0.1
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.08
196	0.05
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.04
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.07
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.13
214	0.16
215	0.17
216	0.16
217	0.2
218	0.24
219	0.24
220	0.22
221	0.23
222	0.2
223	0.19
224	0.18
225	0.13
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.06
230	0.08
231	0.09
232	0.12
233	0.15
234	0.17
235	0.18
236	0.19
237	0.23
238	0.26
239	0.32
240	0.29
241	0.26
242	0.25
243	0.25
244	0.28
245	0.24
246	0.21
247	0.14
248	0.16
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.11
253	0.14
254	0.15
255	0.16
256	0.13
257	0.14
258	0.16
259	0.19
260	0.21
261	0.24
262	0.29
263	0.34
264	0.36
265	0.38
266	0.39
267	0.38
268	0.35
269	0.3
270	0.26
271	0.27
272	0.3
273	0.35
274	0.34
275	0.35
276	0.35
277	0.35
278	0.33
279	0.28
280	0.21
281	0.2
282	0.19
283	0.16
284	0.16
285	0.15
286	0.14
287	0.15
288	0.15
289	0.1
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.2
294	0.21
295	0.19
296	0.2
297	0.21
298	0.2
299	0.18
300	0.19
301	0.14
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.11
308	0.09
309	0.07
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.09
320	0.1
321	0.12
322	0.16
323	0.16
324	0.15
325	0.19
326	0.22
327	0.27
328	0.26
329	0.28
330	0.25
331	0.26
332	0.27
333	0.23
334	0.19
335	0.13
336	0.13
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.11
353	0.1
354	0.1
355	0.07
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.05
362	0.08
363	0.08
364	0.1
365	0.11
366	0.1
367	0.13
368	0.14
369	0.14
370	0.18
371	0.22
372	0.23
373	0.24
374	0.25
375	0.24
376	0.26
377	0.28
378	0.26
379	0.25
380	0.25
381	0.29
382	0.35
383	0.34
384	0.32
385	0.33
386	0.29
387	0.31
388	0.3
389	0.26
390	0.2
391	0.19
392	0.18
393	0.16
394	0.14
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.16
407	0.19
408	0.22
409	0.23
410	0.23
411	0.23
412	0.22
413	0.22
414	0.2
415	0.17
416	0.15
417	0.13
418	0.13
419	0.12
420	0.18
421	0.18
422	0.17
423	0.22
424	0.24
425	0.24
426	0.26
427	0.27
428	0.21
429	0.22
430	0.23
431	0.18
432	0.16
433	0.14
434	0.12
435	0.12
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.19
440	0.21
441	0.23
442	0.25
443	0.29
444	0.35
445	0.4
446	0.48
447	0.46
448	0.49
449	0.52
450	0.52
451	0.48
452	0.43
453	0.37
454	0.27
455	0.19
456	0.15
457	0.11
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.09
462	0.1
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.17
467	0.18
468	0.18
469	0.18
470	0.19
471	0.24
472	0.32
473	0.4
474	0.45
475	0.49
476	0.55
477	0.63
478	0.67
479	0.69
480	0.67
481	0.68
482	0.68
483	0.68
484	0.67
485	0.65
486	0.59
487	0.55
488	0.49
489	0.39
490	0.28
491	0.23
492	0.17
493	0.14
494	0.14
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.1
500	0.09
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.16
509	0.25
510	0.29
511	0.29
512	0.3
513	0.27
514	0.31
515	0.33
516	0.31
517	0.28
518	0.29
519	0.37
520	0.37
521	0.34
522	0.31
523	0.28
524	0.31
525	0.24
526	0.22
527	0.15
528	0.15
529	0.2
530	0.2
531	0.23
532	0.24
533	0.25
534	0.29
535	0.3
536	0.31
537	0.29
538	0.3
539	0.28
540	0.23
541	0.23
542	0.17
543	0.16
544	0.13
545	0.11
546	0.1
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.1
557	0.13
558	0.12
559	0.12
560	0.13
561	0.13
562	0.12
563	0.11
564	0.14
565	0.14
566	0.16
567	0.17
568	0.2
569	0.22
570	0.25
571	0.34
572	0.38
573	0.37
574	0.44
575	0.53
576	0.58
577	0.68
578	0.75
579	0.76
580	0.79
581	0.84
582	0.78
583	0.72
584	0.64
585	0.57
586	0.51
587	0.41
588	0.31
589	0.24
590	0.2
591	0.16
592	0.14
593	0.09
594	0.05
595	0.04
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.06
602	0.08
603	0.11
604	0.13
605	0.14
606	0.15
607	0.19
608	0.24
609	0.24
610	0.27
611	0.25
612	0.25
613	0.25
614	0.23
615	0.21
616	0.15
617	0.13
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.1
622	0.13
623	0.13
624	0.14
625	0.14
626	0.14
627	0.14
628	0.15
629	0.13
630	0.11
631	0.11
632	0.1
633	0.11
634	0.14
635	0.14
636	0.15
637	0.19
638	0.18
639	0.18
640	0.19
641	0.18
642	0.14
643	0.18
644	0.22
645	0.19
646	0.19
647	0.19
648	0.18
649	0.19
650	0.24
651	0.29
652	0.31
653	0.35
654	0.38
655	0.44
656	0.45
657	0.48
658	0.46
659	0.45
660	0.48
661	0.47
662	0.49
663	0.47
664	0.47
665	0.48
666	0.48
667	0.42
668	0.33
669	0.3
670	0.27
671	0.29
672	0.32
673	0.27
674	0.24
675	0.24
676	0.25
677	0.28
678	0.26
679	0.2
680	0.16
681	0.16
682	0.17
683	0.16
684	0.14
685	0.11
686	0.1
687	0.1
688	0.1
689	0.09
690	0.08
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.12
697	0.13
698	0.16
699	0.2
700	0.2
701	0.19
702	0.19
703	0.19
704	0.19
705	0.19
706	0.17
707	0.21
708	0.24
709	0.3
710	0.31
711	0.39
712	0.42
713	0.45
714	0.54
715	0.56
716	0.6
717	0.6
718	0.67
719	0.62
720	0.61
721	0.61
722	0.52
723	0.43
724	0.36
725	0.34
726	0.31
727	0.28
728	0.23
729	0.19
730	0.2
731	0.21
732	0.25
733	0.22
734	0.19
735	0.21
736	0.2
737	0.21
738	0.27
739	0.31
740	0.33
741	0.39
742	0.43
743	0.45
744	0.47
745	0.46
746	0.46
747	0.47
748	0.41

P12000

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer